New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4579883 | 383 (0.750) | 4 (0.010) | 4/266 | NT | 1.0% | noncoding (49/77 nt) | symR | sRNA antisense regulator destabilizing divergent and overlapping symE mRNA |
? | NC_000913 | = 4579899 | 389 (0.790) | noncoding (65/77 nt) | symR | sRNA antisense regulator destabilizing divergent and overlapping symE mRNA | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 439 total aligned reads displayed.
GCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGAAAG > NC_000913/4579751‑4580048 | gCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGACTGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATc > 2:3011593‑M2/1‑149 (MQ=255) gCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATc > 2:8145534‑M2/1‑149 (MQ=255) gCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGAGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATc > 2:4572482‑M2/1‑149 (MQ=255) cGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATcc > 1:3415925‑M2/1‑148 (MQ=255) cGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATcc > 1:560962‑M2/1‑148 (MQ=255) gACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATccg < 1:4522603‑M2/150‑4 (MQ=255) aCTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATccgc > 1:6637431‑M2/1‑146 (MQ=255) aCTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATcagc < 1:2503615‑M2/150‑5 (MQ=255) cTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATccgca > 2:2277629‑M2/1‑145 (MQ=255) gCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACcg > 1:8545458/1‑150 (MQ=255) cATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACcgc > 1:3989960/1‑150 (MQ=255) cATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACcgc < 1:3781241/150‑1 (MQ=255) cATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACcgc < 1:7915747/150‑1 (MQ=255) cATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACcgc > 2:4704864/1‑150 (MQ=255) tAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCgcgc < 2:1350015/150‑1 (MQ=255) ccGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTaa > 2:28100/1‑150 (MQ=255) ccGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTaa > 2:6219163/1‑150 (MQ=255) cGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTaaa > 1:4637385/1‑150 (MQ=255) 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gAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTAtgt < 1:867641/150‑1 (MQ=255) aTAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTgg < 1:2293982/150‑1 (MQ=255) gtgattgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGtt < 1:2785092/150‑1 (MQ=255) attgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATg > 1:6575243/1‑150 (MQ=255) gattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTgg > 1:332272/1‑150 (MQ=255) attAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGc < 2:5800236/150‑1 (MQ=255) attAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGc < 1:2934116/150‑1 (MQ=255) aTGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAaat > 1:5716255/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAACTACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGACGAAAAGGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAaataat < 2:5495416/150‑1 (MQ=255) gggTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAataata < 1:1358334/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATaaaaa < 2:404489/150‑1 (MQ=255) tgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAg > 2:1194217/1‑150 (MQ=255) tgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAg < 2:5677709/150‑1 (MQ=255) gtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAgc > 2:6135731/1‑150 (MQ=255) gtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAgc > 1:3869661/1‑150 (MQ=255) tGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAgcgc > 1:5012008/1‑150 (MQ=255) tGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAgcgc > 2:1015469/1‑150 (MQ=255) ggCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCa > 2:6694512/1‑150 (MQ=255) gcgcACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCAc < 1:6910993/150‑1 (MQ=255) cgcACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCAcc > 2:2550727/1‑150 (MQ=255) caTCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGaa > 2:4171862/1‑150 (MQ=255) aTCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGaaa < 1:3183882/150‑1 (MQ=255) | GCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGAAAG > NC_000913/4579751‑4580048 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |