| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 784,961 | G→T | 10.1% | T119T (ACC→ACA) | ybgS ← | putative periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 784,961 | 0 | G | T | 10.1% | 1239.2 / 25.0 | 418 | T119T (ACC→ACA) | ybgS | putative periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (147/215); new base T (53/3); total (200/218) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 431 total aligned reads displayed.
TGAGTGCGCCATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTGAAGAACCATCCGAATGCAGCATTGT > NC_000913/784812‑785110 | tgagtgCGCCATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTg < 1:6964386/150‑1 (MQ=255)tgagtgCGCCATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTg < 2:4239866/150‑1 (MQ=255) gagtgCGCCATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTgg < 2:1192744/150‑1 (MQ=255) gagtgCGCCATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTGTTgg > 1:1723815/1‑150 (MQ=255) gcgcCATGACGAGTCATCCCTTAAGTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATc < 2:2330723/150‑1 (MQ=255) ccATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGAc < 1:7186636/150‑1 (MQ=255) cATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGAca < 1:1343072/150‑1 (MQ=255) cATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGAca < 2:343153/150‑1 (MQ=255) cATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGAca > 1:4862181/1‑150 (MQ=255) gAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCatta < 1:8028840/150‑1 (MQ=255) tCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCAATATTg > 2:3984240/1‑150 (MQ=255) cATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGa < 2:8564391/150‑1 (MQ=255) aTCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGAt < 1:8136897/150‑1 (MQ=255) aTCCCTTAATTAGTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTCTTGGTATCGACATCATTATTGAt < 1:7803225/150‑1 (MQ=255) tCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTCCCGTCGGGGTTGGTATCGACAACAATATTGATg > 2:8011184/1‑150 (MQ=255) tCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCATTATTGATg < 2:559122/150‑1 (MQ=255) tCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCAATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATg > 2:4992505/1‑150 (MQ=255) cccTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGc < 1:3891538/150‑1 (MQ=255) ccTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGGTTTGGTATCGACATCATTATTGATGcc > 1:3311955/1‑150 (MQ=255) cTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCa > 1:2473579/1‑150 (MQ=255) ttAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACAACCTTATTTATGCCaa > 2:5731034/1‑149 (MQ=255) aaTTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCa < 2:829793/150‑1 (MQ=255) ttattCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCAcc < 2:734673/150‑1 (MQ=255) ttCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATAGACATCATTATTTATTCCATCaaccgt > 2:7001012/1‑145 (MQ=255) ttCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGt < 1:8369189/150‑1 (MQ=255) tctcACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGtt < 2:3576839/150‑1 (MQ=255) ctcACTTACGTTTCTGACATGATTCTGATTTTAGATGTTAATTTTTTAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCTTTTTTTGCTATTTTGCTGGTTTACTGCGTGGTTCCGTCGGTTTTTGTATCGACTTCATTATTTATGCCATCACCGGttt < 2:1718393/150‑1 (MQ=255) ctcACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGttt < 1:7041892/150‑1 (MQ=255) tcACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCATTATTTATGGCAACACCGGtttt > 1:5889735/1‑149 (MQ=255) cACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGt < 2:2006158/150‑1 (MQ=255) aCTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTa < 2:3272965/150‑1 (MQ=255) ttAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCATTATTTATGCCAACACCGGTTTGTAcc > 1:7460818/1‑150 (MQ=255) aCTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTTATTCCATCACCGGGTTTTaacatt > 1:3724518/1‑145 (MQ=255) aCTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCttt < 2:7516619/150‑1 (MQ=255) ttATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTa < 1:2197604/150‑1 (MQ=255) tATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTAt < 2:186326/150‑1 (MQ=255) aTGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTAtt < 1:5406922/150‑1 (MQ=255) aTGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTAtt < 1:2063473/150‑1 (MQ=255) atcatACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTCGTGGCGATTTTGCAGGGTTACGGCGTGGTCCCGTCGGGTTTGGGATCGACATCCGTCTGGAGGGCCTCACCGGGGTGGGCCTTTTTTTTgtgcg > 2:5387701/1‑146 (MQ=255) tcatACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTCCTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATc < 2:6422910/150‑1 (MQ=255) tcatACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCCGTTTTTACCTTTTTATTTatata > 1:8642236/1‑149 (MQ=255) tcatACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGGTTTGGTATCGACAACAATATTGATGCCATCAACCGTTTGTAACATTTTAttttaatc > 2:1529127/1‑144 (MQ=255) atACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCATTATTTATGCCAACACCGGTTTTTACCTTTTTATTTatataag > 2:5922189/1‑147 (MQ=255) atACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCg < 1:4182095/150‑1 (MQ=255) cTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCAATATTTATGCCCACACCGGTTTGTACCATTTTATTTATATACGGAc > 1:1578623/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACAACAATATTGAAGCCATCACCCGGTTGTTCCATTTTATTTATATCCGGGCa > 2:2526484/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGGTTTGGTTTCGACATCAATATTGATGCCCTCACCCGGTTGTACCATTTTATTTATATCCGGACa > 2:1527129/1‑150 (MQ=255) gCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTCATTGATATCCGGACAg < 1:1590001/150‑1 (MQ=255) gCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGGTTTTGTATCGACATACTTATTTTTTCCCACACCCGTTTTTAACATTTTATTTTTATACGGCCAg > 2:6578602/1‑150 (MQ=255) aGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTAACTTTTTATTGTTATACGGACAGCGACCa > 1:6441092/1‑150 (MQ=255) aaGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATAGACATCATTATTGATGCCATCACCGGGTTGTAACTTTTTATTTATATCCGGACAGCGACCaac > 2:5154840/1‑148 (MQ=255) aaGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATc < 2:7779231/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTTTTTCCATCACCCGTTTGTAACTTTTTATTGATATAAGGACAGCGACCATCttt > 1:1882462/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCttt < 1:8312768/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCttt < 2:3719543/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATAATTATTGATGCCAGCACCCGGTTGTACCTTTTTATTGTTATCCGGACAGCGACCATCttt > 1:4018359/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGGTTTGGTATCGCCATCAATATTGATTCCCGCACCCGGTTGTACCATTTTATTTATATCCGGACAGCGCCCATCGTTGc > 2:8154714/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACAt < 2:4119777/150‑1 (MQ=255) aTTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCAACACCCGTGTGTACCTTTTTATTGATATCCGGCCAGCGACCATCGTTGcacag > 2:7485821/1‑149 (MQ=255) tAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTTATATCCGGACAGCGACCAACTTTGCACATgg > 2:4576029/1‑150 (MQ=255) aaaaGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTAAAGACATAAATAATTATTCCAACAACGGTTTTTACATTTTTATTTATATCCGGACAGCGACAAACTATGcacaatgt > 2:2633195/1‑146 (MQ=255) aaaGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGGTTTGGGAAAGACAGCATTATTTATGCCAACACCCGTGTGTACCATTTTAATGATATCACGACAGCGACCATCTTTTCACATTgtt > 2:7309197/1‑149 (MQ=255) aaGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCCTCTTTGCACATTgtgt > 1:4984439/1‑150 (MQ=255) gggAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTc < 1:4090814/150‑1 (MQ=255) gggAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTc < 1:5830016/150‑1 (MQ=255) ggAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACAACATTATTGATGCCATAACCCGGTTGTACCTTTTTATTTATATCCGGACAGCGACCATATTTTCACAAGGTGTTCt > 1:7342557/1‑150 (MQ=255) gagagaCTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCtt < 2:6974727/150‑1 (MQ=255) gagagaCTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCtt < 2:1389099/150‑1 (MQ=255) gagagaCTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACAGCATTATTGATGCCATCACCGGGTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCtt > 1:5656474/1‑150 (MQ=255) gagaCTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTtgt < 1:2743621/150‑1 (MQ=255) gaCTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGc < 1:5979103/150‑1 (MQ=255) aCTCCGCTCTCCCAGTATTGGCGAGTTGGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGct < 1:2366921/150‑1 (MQ=255) tCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTAACTTTTTATTGATATACGGACAGCGACCATCTTTGCACAAGGTGTTCTTTTGgtct > 1:5317028/1‑150 (MQ=255) tCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGGTTTGGTATCGACAACCATATTGATGCCATCACCCGGGTGTACCATTTTATTGATATACCGACAGCGACCAGCTTTGCACAAGGTGTTCGTGTGctcg > 1:5132142/1‑149 (MQ=255) ccGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTTCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATAGACATCATTATTGATGCCTTCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGTCCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCtt < 2:1754050/150‑1 (MQ=255) tctcCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCCGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACACCGACCATCTATGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATc > 2:7621608/1‑150 (MQ=255) tcCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCtt < 2:440846/150‑1 (MQ=255) cccATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCCTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCttt < 1:4292340/150‑1 (MQ=255) ccATTATTGGCTATTTTGCAGTGTTACTGCGTTGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTg < 1:7085735/150‑1 (MQ=255) cATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTgg < 2:1291542/150‑1 (MQ=255) attattGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGt < 1:3563540/150‑1 (MQ=255) ttattGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCATTATTGATTCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTTATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTTTGCTCTTCATCTTTTGTc > 2:4804885/1‑150 (MQ=255) ttGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCAtt < 2:2822330/150‑1 (MQ=255) tGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTAACGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTc < 2:2466201/150‑1 (MQ=255) tATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACC‑TTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTACGTCa > 2:6360646/1‑150 (MQ=255) tATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACAACATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTAATGATATCCGGACAGCGACCCTCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTc > 2:8680963/1‑150 (MQ=255) tttGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCAtt < 2:3040821/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTc < 1:2973279/150‑1 (MQ=255) ggTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTTGTATCGACATCCTTTTTGATGCCATCACCGGTTTGTACCATTTTATTGATATACCGACAGCGACCATCTTTTCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCAACATTTGTCATTCCGTCAATTTTAAtt > 2:2380494/1‑150 (MQ=255) ggTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTTATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCAtt < 1:4651856/150‑1 (MQ=255) tACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTgaa < 2:4298379/150‑1 (MQ=255) tACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTgaa < 1:7574052/150‑1 (MQ=255) tGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCa < 1:1024938/113‑1 (MQ=255) ccGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTGAAGAACCATCCGaa < 1:914729/150‑1 (MQ=255) cGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACAATCTTTGAACATGGTGTTCTTGTGATCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTTAAGAACCATCCGAAt > 2:5331325/1‑150 (MQ=255) gTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTTATATCCGGACAGCGACCATGTTTGCACATGGTGTTCTTGTGGTCTTCTTCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTGATTGTAGATCCTTCCGAATg > 2:8493178/1‑150 (MQ=255) gTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTGAAGAACCATCCGAATgcagc > 2:6285662/1‑150 (MQ=255) ttttGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCAt > 2:2271251/1‑120 (MQ=255) ttttGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCAt < 1:6628139/120‑1 (MQ=255) ggTATCGAAATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCAGACAGCGACAATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTGAAGAACCATACGAATGCAGCATtgt < 2:8350971/150‑1 (MQ=255) | TGAGTGCGCCATGACGAGTCATCCCTTAATTATTCTCACTTAACTTTATGACATCATACTGCTTTTAGAAGTGAAAAATTAAAAGGGAGAGACTCCGCTCTCCCATTATTGGCTATTTTGCAGGGTTACTGCGTGGTACCGTCGGTTTTGGTATCGACATCATTATTGATGCCATCACCGGTTTGTACCTTTTTATTGATATCCGGACAGCGACCATCTTTGCACATGGTGTTCTTGTGCTCTTCATCTTTGGTCATTCCGTCATTGTTCATTGAAGAACCATCCGAATGCAGCATTGT > NC_000913/784812‑785110 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |