Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 843,216 | G→T | 9.8% | M295I (ATG→ATT) | rlmF → | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 843,216 | 0 | G | T | 9.8% | 1329.9 / 26.2 | 438 | M295I (ATG→ATT) | rlmF | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (152/228); new base T (56/2); total (208/230) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.48e-18 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 447 total aligned reads displayed.
CAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATGTTT > NC_000913/843067‑843365 | cAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATg < 1:3340386/150‑1 (MQ=255) ggTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGaa < 1:6475211/150‑1 (MQ=255) ggTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑GGGACCTTTATGaa > 2:6969031/1‑150 (MQ=255) gagATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGATGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTTGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAac < 1:1820313/148‑1 (MQ=255) gTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCC‑TGGCCCTTTATGAac > 1:3700579/1‑150 (MQ=255) gTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTGC‑TGGACCGTTATGTac > 2:82919/1‑150 (MQ=255) aTGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAacgac < 2:2024070/150‑1 (MQ=255) gtgGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑TGGACCATTATGAacgacgc > 2:3579359/1‑149 (MQ=255) tgGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTTTTGGC‑GGGACCTTTATTAAACACGag > 2:344408/1‑150 (MQ=255) tgGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑GGGACCGTTATGAACGACGag > 2:415645/1‑150 (MQ=255) gTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGagc > 2:761747/1‑150 (MQ=255) gTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGagca < 2:859174/150‑1 (MQ=255) gTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTGC‑TGGACCTTTATGAAAGACGagca > 2:7925846/1‑150 (MQ=255) aaTCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGcgcc < 1:7391376/149‑1 (MQ=255) aTCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGcgccg < 2:7166611/150‑1 (MQ=255) aTCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGcgccg < 2:610218/150‑1 (MQ=255) aCTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGccgccg > 2:5347208/1‑150 (MQ=255) ggTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGttt < 1:8220954/150‑1 (MQ=255) ggTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTGC‑AGGACCGTTATTTAACACGAGCACCgccccccatt > 1:8540025/1‑146 (MQ=255) aTCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGt < 1:4223597/150‑1 (MQ=255) aTCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGGGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGt < 1:4169150/150‑1 (MQ=255) tcGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCaa > 2:6842740/1‑150 (MQ=255) tcGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTGCC‑TGGGCCGTTATTAACGACCAGCAGCGCCCCCGGTTTGTCaa > 1:7232954/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAAt < 1:3121740/150‑1 (MQ=255) gtggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGGGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATc < 1:8361041/150‑1 (MQ=255) tgAAAACTAACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATTAACGACGACCAGCGCCGCCGGTTTGTCAATAGccc > 1:5052127/1‑149 (MQ=255) aaaaCTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGc < 2:7747904/150‑1 (MQ=255) aaaaCTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGc < 1:747715/150‑1 (MQ=255) aaaaCTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTGC‑TGGACCATTATTAAAGACGAGCCGCGCCGCCCTTTTGTGAAAAGCCAGc > 2:170464/1‑150 (MQ=255) aCTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTCC‑GGGGCCGTTTTGTACGACGAGCAGCGCCGCCGGGTTGGGAATAGCCcgcggg > 1:4931546/1‑148 (MQ=255) cTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑AGGACCATTATTAACCACGAGCCGCGCCCCCGATTTGTCAAAAGCCAGCGTTa > 1:6018748/1‑150 (MQ=255) ttACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTaa > 2:8436728/1‑150 (MQ=255) ccgccgTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGc < 2:674671/150‑1 (MQ=255) cgccgTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑AGGGCCGTTATGAACGACGAGCCGCGCCGCCCTTTTGTCAAACGCCCGCCGTAAAGCg > 1:2901542/1‑150 (MQ=255) gccgTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGt < 1:445021/150‑1 (MQ=255) gccgTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑GGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCCCCCGTTTGTCAATCGCCAGCGGTAAATCGt > 2:2241092/1‑150 (MQ=255) ccgTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGtt < 1:8674456/150‑1 (MQ=255) ccgTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGtt < 2:4106802/150‑1 (MQ=255) ccgTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGtt < 2:9129997/150‑1 (MQ=255) ttGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTGC‑AGGACCTTTATTAAAGACGAGCAGCGCCCCCCGTTTTTCAAAAGCCACCCGTAAAACggtggt > 1:2331796/1‑150 (MQ=255) ttGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGt < 2:4736876/150‑1 (MQ=255) tATCGTG‑CCCTGCCGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTcc < 2:1230879/150‑1 (MQ=255) tATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTcc < 2:5688267/150‑1 (MQ=255) aTCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTccc < 2:3454695/150‑1 (MQ=255) tCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGGTATTTCC‑GGGACCATTATGAACCACCAGCCGCGCCCCCCTTTTGTCAAAACCCCCCCGTAAAGCGGTGGTTcccc > 1:9076562/1‑150 (MQ=255) tCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGGTATTGCCGTGGA‑CTTTATGAACGACGAGCCCCGCCGCCCGTTTGTAAATCGCCAGCGGTAAATCGTTGGGTaccc > 1:5548604/1‑150 (MQ=255) tG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCcgg < 1:1559851/150‑1 (MQ=255) ccTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCC‑AGGGCCATAATGTACCAACAGCACCCCCGCCCTGTTGTCAATAGCCAGCGGGAAAGAGTTGGTTGCCCcggcgg > 1:2715544/1‑150 (MQ=255) ccTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCcggcgg > 2:6143871/1‑150 (MQ=255) acggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCC‑AGGCCCATTATTAACGAAGAGCAGCGCCCCCGTTTTTTCAAAAGCCACCCGTAAATCCGTGGTTACCCCCGCGGTAAc > 1:1392447/1‑150 (MQ=255) acggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTGTATTTGC‑TGGACCATTATGAAAGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTTTCAATAGCCACCGTTAAAGCGTTGGTTACCCCCGCCGTAAc > 2:8813154/1‑150 (MQ=255) cggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTGCC‑GGGGCCGTTTTTAACCACGAGCAGCGCCCCCGGTTTTTCAAAAGCCACCGGTAAAACCTTGGTTCCCCCCCCGGGAAcc > 1:552332/1‑149 (MQ=255) ggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCATTATGAACCACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCCGCGGTAACgg > 2:7563941/1‑150 (MQ=255) ggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTGC‑GGGCCCGTTATGGACGACCCGCCGCGCCGCCGGTTTGTCAAACGCCCCCGGTAAAGCGGTGGTTCCCCCCGCGGGAACgg > 2:6519415/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCa < 1:2197890/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGACGGTGGTTAAAAAAGAGAGGGCCCAGGGGCAAAAGCCGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGACCGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCgg < 2:3791117/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCgg < 2:8982031/150‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCggg < 1:2385160/150‑1 (MQ=255) aaGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTcgcg < 1:6179993/150‑1 (MQ=255) gtggtTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGccc < 1:344408/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAg < 2:5976542/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAg < 1:5967448/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAg < 2:3322215/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAg < 1:523256/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCC‑TGGACCTTTATGAAACACGAGCACCCCCGCCGGTTTGTCCAACGCCAGCGTTAAATCGTTGGTTACCCCCGCGGGAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgc > 2:4375476/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgc < 1:404381/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgca < 1:5347991/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgca < 2:1010049/150‑1 (MQ=255) aaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCC‑AGGACCGTTATGAAAGACGAGCAGCGCCGCCCTTTTGTCAATCGCCCGCGGTAAAGCGTTGGTTCCCCCCGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcagg > 2:8174863/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcagg < 1:6864961/150‑1 (MQ=255) aaaaGAGAGGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcagg < 2:6285985/150‑1 (MQ=255) aaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCC‑GGGACCTTTATGAACGACGCCCAGCGCCGCCGGTTTGTCAATCGCCCGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCCGCGGTAACCGGTCAGCCCGGGTCGCGCCCGGCgcaggc > 2:8755688/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGa < 2:6348175/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCC‑GGGACCTTTATGAACGACGGGCAGCGCCCCCGGTTTGTCCATCGCCCGCGGTAAAGCGGTGGGTCCCCCGGCGGTAACGGGTCAGCCGGGGGCGCGCCCCGGGCAGGCCGCACCGGATa > 2:2597406/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑AGGACCATTATGAACGACCAGCAGCGCCGCCCGTTTGTCCATAGCCAGCGGTAAAGCGGTGGTTCCCCCCGCGGTAACGGGTCAGCCCGGGGCGCGCCCGGAGCAGGCCCCACCAGATa > 2:1067168/1‑150 (MQ=255) aGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCC‑TGGACCCGTATGAACGGCCCGCCGCGCCCCCGGTGTGTCCAACCCCACCGGTAAAGCCGGGGGTCCCCCCGCGGGAACCGGGCAGCCCGGGGCGCCCCCGGAGCCCGCAGCAccagcgaag > 2:7385167/1‑143 (MQ=255) ggggCAAAAGCAGCGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGt < 2:2459395/150‑1 (MQ=255) gCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTg < 1:2506996/150‑1 (MQ=255) gCAAAAGCAGAGTCGCTTTAGTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTg < 1:7762659/150‑1 (MQ=255) aaGCAGAGTCGCGTTATTTCC‑GGGACCTTTATGAACCACGAGCAGCCCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGGTAAAGCCTTTGTTCCCCCCGCGGTAAACGTTCAGCCCGGGGCGCGCCCGGAGCAGGCACCACCTGATAAGTCTGCAca > 2:3735698/1‑149 (MQ=255) aGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTg < 1:4826194/150‑1 (MQ=255) aGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTg < 1:637566/150‑1 (MQ=255) aGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTg < 1:7112368/150‑1 (MQ=255) cAGAGTCGCTTTATTTCC‑TGGACCATTATGAAACACGAGCAGCGCCCCCCTTTTTTCAATACCCAGCGTTAAAGCGTTTGTTACCCCCGCGGTAACCGTTCATCCGGGGTCGCGCCCCGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACAGgc > 2:5159261/1‑150 (MQ=255) gTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGgcgcgc < 2:4599146/150‑1 (MQ=255) gCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGaa < 2:4885297/150‑1 (MQ=255) tttATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcg > 2:2862269/1‑150 (MQ=255) tttATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcg > 1:6728671/1‑150 (MQ=255) tttATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcg > 1:5773942/1‑150 (MQ=255) tATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgcc < 1:384958/150‑1 (MQ=255) ttGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgcccg > 2:1520559/1‑150 (MQ=255) tGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgcccgc > 2:4030719/1‑150 (MQ=255) cc‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCa > 1:8064683/1‑150 (MQ=255) cc‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCa > 1:327187/1‑150 (MQ=255) ggACCTTTATTAACGACGAGCAGCGCCGCGTTTTTGTAAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCGGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGt < 1:7925846/150‑1 (MQ=255) ggACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGt > 1:5675187/1‑150 (MQ=255) gACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTc < 2:6649992/150‑1 (MQ=255) gACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTc < 2:5437128/150‑1 (MQ=255) aCCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGTTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTTATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCg < 1:1036809/150‑1 (MQ=255) tttATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGaaa > 1:119939/1‑150 (MQ=255) | CAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTG‑CCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCC‑TGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATGTTT > NC_000913/843067‑843365 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |