| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,936,090 | T→A | 5.4% | L268Q (CTG→CAG) | rbsC → | D‑ribose ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,936,090 | 0 | T | A | 5.4% | 240.1 / 3.4 | 74 | L268Q (CTG→CAG) | rbsC | D‑ribose ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/23); new base A (2/2); total (49/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
TTCTCTTTGTGGTCTGCTGGCATCGCTGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGCTGGCGG > NC_000913/3935959‑3936227 | ttCTCTTTGTGGTCTGCTGGCATCGCTGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCCCGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTggcgggcg > 2:926038/1‑140 (MQ=255)ttCTCTTTGTGGTCTGCTGGCATCGCTGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTggcgggcg > 2:48907/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGGCATCGCTGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCa < 2:761379/140‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCATCGCTGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCa < 1:759579/140‑1 (MQ=255) ctgctgGCATCGCTGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCag > 1:365091/1‑139 (MQ=255) tGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGTCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCTCATTGTTGGGACGTTg > 2:900180/1‑140 (MQ=255) ccGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCAGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATc > 2:175082/1‑140 (MQ=255) ccGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCAGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATc > 2:175118/1‑140 (MQ=255) gggATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCgg < 1:1132277/140‑1 (MQ=255) aTCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTAGGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGAGCGgcgc > 1:16060/1‑140 (MQ=255) ggCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTg < 1:697189/140‑1 (MQ=255) ggCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTg < 1:697109/140‑1 (MQ=255) cgcgTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGc < 1:247691/140‑1 (MQ=255) gTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTc < 1:287507/140‑1 (MQ=255) gTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTc < 1:184160/140‑1 (MQ=255) ctctcCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCt < 1:1145410/140‑1 (MQ=255) cGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATg > 2:171124/1‑140 (MQ=255) cGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCAGTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATg > 2:171283/1‑140 (MQ=255) cGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCGGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTTATTCTTGGCTTCCTTAATAATg > 2:171288/1‑140 (MQ=255) cacaACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGa > 1:514984/1‑140 (MQ=255) cacaACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGa > 1:536472/1‑140 (MQ=255) cacaACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGa > 1:214221/1‑140 (MQ=255) cacaACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGa > 1:210909/1‑140 (MQ=255) cccACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGaa < 1:413162/140‑1 (MQ=255) cccACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGaa < 2:302053/140‑1 (MQ=255) cccACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGaa < 1:531933/140‑1 (MQ=255) ccACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAAt < 1:471451/140‑1 (MQ=255) gcggGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGtt > 2:1031676/1‑140 (MQ=255) gcggGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGtt > 2:1077255/1‑140 (MQ=255) cggGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTa < 1:733038/140‑1 (MQ=255) cggGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTa < 2:957833/140‑1 (MQ=255) cggGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTa < 2:55013/140‑1 (MQ=255) cggGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCAATAATTCTTGTCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTa < 2:773137/140‑1 (MQ=255) ggACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGgt > 1:594679/1‑140 (MQ=255) ggACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGgt > 1:363161/1‑140 (MQ=255) ggACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGgt > 2:651385/1‑140 (MQ=255) ggACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGgt > 1:1158528/1‑140 (MQ=255) ggACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGgt > 2:165578/1‑140 (MQ=255) gACGGGCTATCAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGGTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCAGTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAAGAAGGGATTCACTTTCTAAggag > 2:627701/1‑138 (MQ=255) tGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGttt < 2:697262/140‑1 (MQ=255) ggCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATACTGGATTGAATTTGTTAGGTGTTtc < 1:956355/140‑1 (MQ=255) ggCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTtc > 1:1029700/1‑140 (MQ=255) cTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTtcct > 2:62448/1‑140 (MQ=255) tGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTcctcct > 1:386606/1‑140 (MQ=255) agAGCTGGTTGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGCTACGAGTCTGGCGGGCTGTAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTTATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTTAATTTGTTAGGTGTTTcctcct < 2:258445/139‑1 (MQ=255) aGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAAAGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTAt > 2:678786/1‑140 (MQ=255) ggATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTAcc > 1:199855/1‑140 (MQ=255) ggATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTAcc > 1:199756/1‑140 (MQ=255) ggATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTAcc > 1:199679/1‑140 (MQ=255) gATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCa > 2:675274/1‑140 (MQ=255) gATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCa > 2:629761/1‑140 (MQ=255) gATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCa > 2:629736/1‑140 (MQ=255) cTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAgatg < 2:16060/140‑1 (MQ=255) ctgcGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTc > 2:221635/1‑140 (MQ=255) ctgcGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTc > 2:304120/1‑140 (MQ=255) ctgcGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTc > 2:362273/1‑140 (MQ=255) ctgcGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTc > 2:372836/1‑140 (MQ=255) ctgcGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTc > 2:41081/1‑140 (MQ=255) gtggtTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGc > 2:134587/1‑140 (MQ=255) gtggtTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGc > 2:1124737/1‑140 (MQ=255) gtggtTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGc > 2:134576/1‑140 (MQ=255) gtggtTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGc > 1:543135/1‑140 (MQ=255) gtggtTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGc > 1:876310/1‑140 (MQ=255) gtggtTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGc > 1:876319/1‑140 (MQ=255) ggCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGAt > 1:1115443/1‑140 (MQ=255) ggTACGAGTCAGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGAtttt < 1:175118/140‑1 (MQ=255) ggTACGAGTCAGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTACTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCATATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGAtttt < 1:175082/140‑1 (MQ=255) tACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCTTCAAAGCGGTGGTGATTTTGc > 2:674821/1‑140 (MQ=255) tACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGc > 2:977487/1‑140 (MQ=255) tACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGc > 2:54300/1‑140 (MQ=255) tACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGc > 1:1084793/1‑140 (MQ=255) gAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGCTgg < 2:1154453/140‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGCTGGCg > 2:42818/1‑140 (MQ=255) tCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGCTGGCgg < 1:792861/140‑1 (MQ=255) | TTCTCTTTGTGGTCTGCTGGCATCGCTGGCCGGGATCATTGAAGTGGCGCGTCTCTCCTCCGCACAACCCACGGCGGGGACTGGCTATGAGCTGGATGCTATTGCTGCGGTGGTTCTGGGCGGTACGAGTCTGGCGGGCGGAAAAGGTCGCATTGTTGGGACGTTGATCGGCGCATTAATTCTTGGCTTCCTTAATAATGGATTGAATTTGTTAGGTGTTTCCTCCTATTACCAGATGATCGTCAAAGCGGTGGTGATTTTGCTGGCGG > NC_000913/3935959‑3936227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |