Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,449,344 | A→G | 5.3% | A180A (GCT→GCC) | rpsC ← | 30S ribosomal subunit protein S3 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,449,344 | 0 | A | G | 5.3% | 245.5 / 4.3 | 75 | A180A (GCT→GCC) | rpsC | 30S ribosomal subunit protein S3 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/43); new base G (2/2); total (30/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 |
GGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGCTTCA > NC_000913/3449213‑3449483 | ggCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCag > 2:1019928/1‑140 (MQ=255) gCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCaga < 2:368207/140‑1 (MQ=255) gCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCaga < 2:368405/140‑1 (MQ=255) tGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAgt > 2:1035537/1‑140 (MQ=255) agcagcCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGAAGTCAGCACGCAGAgtgt > 1:1209275/1‑140 (MQ=255) cGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGAc < 2:1110793/140‑1 (MQ=255) cGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGAc < 2:517813/140‑1 (MQ=255) tgttCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCGGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTc > 2:712578/1‑140 (MQ=255) tgttCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCGGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTc > 2:710496/1‑140 (MQ=255) tgttCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTc > 2:1133996/1‑140 (MQ=255) gttCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTcg < 1:896567/140‑1 (MQ=255) gttCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTcg < 1:604654/140‑1 (MQ=255) gttCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTcg < 1:506646/140‑1 (MQ=255) aCAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTa < 1:943021/140‑1 (MQ=255) cagcagCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTAc < 1:273776/140‑1 (MQ=255) cagcagCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTAc < 1:10542/140‑1 (MQ=255) cagcCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCAt > 2:250810/1‑140 (MQ=255) caccaaTACCACCCAGGATCTATAAATTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCAt > 2:230392/6‑140 (MQ=255) agcCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCAtt < 2:886278/140‑1 (MQ=255) agcCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCAtt < 2:886155/140‑1 (MQ=255) ggATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGAtt > 1:657022/1‑140 (MQ=255) ctcGCCTTTGAAGATCCACACTTTCACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcg < 2:1171499/140‑1 (MQ=255) ctcGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGTGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcg < 2:349082/140‑1 (MQ=255) ctcGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcg < 2:910233/140‑1 (MQ=255) cGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcgcg < 2:586954/140‑1 (MQ=255) cGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcgcg < 1:831102/140‑1 (MQ=255) cGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcgcg > 1:610245/1‑140 (MQ=255) cGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcgcg > 1:1231317/1‑140 (MQ=255) cGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCcgcg < 2:600473/140‑1 (MQ=255) ttGAAGATCCACACTTTAACGCCGTTTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCgccgcc < 2:1078664/140‑1 (MQ=255) ttGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCgccgcc < 2:815039/140‑1 (MQ=255) ttGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCgccgcc < 2:1078595/140‑1 (MQ=255) acTTTAACGCCGATTACACCGTACGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCt < 2:446257/140‑1 (MQ=255) acTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCt < 2:317401/140‑1 (MQ=255) tAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACt > 2:571066/1‑140 (MQ=255) tAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACt < 2:1112094/140‑1 (MQ=255) aaCGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACtt > 2:946432/1‑140 (MQ=255) aCGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTc < 2:88673/140‑1 (MQ=255) aCGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTc < 2:88662/140‑1 (MQ=255) aCGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATACGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTc < 2:155609/140‑1 (MQ=255) aTTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACttt > 2:278775/1‑140 (MQ=255) aTTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACttt > 2:278726/1‑140 (MQ=255) aTTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACttt > 2:194689/1‑140 (MQ=255) aTTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACttt > 2:194483/1‑140 (MQ=255) gTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCtt > 2:610519/1‑140 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1:248752/140‑1 (MQ=255) gcgcTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGa > 1:303704/1‑140 (MQ=255) cAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTATTACCTTTAGCGCCCAGACGCAtt < 2:107313/140‑1 (MQ=255) cAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCAtt < 1:99191/140‑1 (MQ=255) cAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCAtt < 1:768833/140‑1 (MQ=255) gtgtTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGTTACGCGACCTTCGCGGTACCTTTCGGGACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATTCCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGtt < 1:690877/140‑1 (MQ=255) gtgtTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGtt < 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gtAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTa < 1:923020/140‑1 (MQ=255) gtAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACATGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTa < 1:923080/140‑1 (MQ=255) cGATGTCGGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCa < 1:712578/140‑1 (MQ=255) cGATGTCGGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCa < 1:710496/140‑1 (MQ=255) cGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCa < 1:1133996/140‑1 (MQ=255) cGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCa < 1:571066/140‑1 (MQ=255) aTGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACg < 1:1086228/140‑1 (MQ=255) aTGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACg < 1:1053358/140‑1 (MQ=255) tGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGc > 2:851938/1‑140 (MQ=255) tGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGc > 2:851998/1‑140 (MQ=255) tGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGc > 1:110329/1‑140 (MQ=255) tGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGc > 2:892484/1‑140 (MQ=255) cAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGCTTc > 1:1127520/1‑140 (MQ=255) aGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGCTTCa < 1:800578/140‑1 (MQ=255) | GGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGCTTCA > NC_000913/3449213‑3449483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |