| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2466384 | 66 (0.750) | 47 (0.610) | 20/244 | 1.1 | 48.1% | intergenic (+1/‑161) | argW/intS | tRNA‑Arg/CPS‑53 (KpLE1) prophage; putative prophage CPS‑53 integrase |
| ? | NC_000913 | 2476600 = | 43 (0.550) | intergenic (+2/+94) | pawZ/dsdC | tRNA‑OTHER/dsd operon activator; autorepressor | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GTGACCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCT > NC_000913/2476461‑2476739 | taagcaatcgagcggcagcgtacttaccccgcactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatc > 1:1149623‑M2/140‑140 (MQ=255) tGACCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCAAcc > 1:815149/1‑140 (MQ=255) aCCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCATTCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCtt > 1:245287/1‑140 (MQ=255) aCCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCtt > 1:1020700/1‑140 (MQ=255) aCCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCtt > 1:303037/1‑140 (MQ=255) cgcgcggcagcgtacttaccccgcactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaaaggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGtt > 2:459780‑M2/132‑140 (MQ=255) gtgAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGttt < 1:1471649/140‑1 (MQ=255) ttCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATccc > 1:391649/1‑140 (MQ=255) ttCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATccc > 1:391637/1‑140 (MQ=255) taTAAGCTCTTAAGACGCGCAAATGGGTATTAGAGCGGGTATAATATTTCTCTCATCTAAAAAACACCATTCCAATGTATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAAc < 2:1315963/139‑1 (MQ=255) cactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAAc > 2:98245‑M2/109‑140 (MQ=255) cactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAAc > 2:96912‑M2/109‑140 (MQ=255) cactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAAc > 2:1145196‑M2/109‑140 (MQ=255) cactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAAc > 2:1145155‑M2/109‑140 (MQ=255) ggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataactagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTaaattaaatt > 1:858538‑M2/96‑140 (MQ=255) ggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataactagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTaaattaaatt > 1:858520‑M2/96‑140 (MQ=255) ggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTaaattaaatt > 1:902673‑M2/96‑140 (MQ=255) tatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCg > 1:362388‑M2/94‑140 (MQ=255) tatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCg > 1:72712‑M2/94‑140 (MQ=255) tatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCg > 2:1319464‑M2/94‑140 (MQ=255) tatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCg > 1:490816‑M2/94‑140 (MQ=255) tAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAg < 1:515559/140‑1 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTACATTAAATTCGAACTAGCAg > 1:514812‑M2/85‑140 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAg > 1:147909‑M2/85‑140 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAg > 1:272771‑M2/85‑140 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAg > 1:273739‑M2/85‑140 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAg > 1:514771‑M2/85‑140 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAAGTCGAACTAGCAg > 2:130984‑M2/85‑140 (MQ=255) cGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAg > 2:1257140/1‑140 (MQ=255) cGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAg > 1:400593/1‑140 (MQ=255) ccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgatcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTATATTAAATTCGAACTAGCAgg < 2:795634‑M2/57‑1 (MQ=255) ccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAgg < 2:990538‑M2/57‑1 (MQ=255) gcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATAAAATTCGAACTAGCAGGcc > 2:181891‑M2/82‑140 (MQ=255) atTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAg > 2:864626/1‑140 (MQ=255) tttCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAgg < 1:465841/140‑1 (MQ=255) tttCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAgg < 1:1273805/140‑1 (MQ=255) tttCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAgg < 1:270765/140‑1 (MQ=255) ctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGTataatg < 2:404334‑M2/67‑3 (MQ=255) ctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaagtgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGATTAAgg < 2:404443‑M2/67‑1 (MQ=255) tctcACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGca < 2:1126514/140‑1 (MQ=255) tcACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGcaca < 2:303037/140‑1 (MQ=255) taaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAg > 2:1067427‑M2/66‑140 (MQ=255) aaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAgg < 2:776628‑M2/76‑1 (MQ=255) cacCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTgg > 1:492398/1‑140 (MQ=255) ccATTCCAAGCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTgggt > 2:178504/1‑138 (MQ=255) ttCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTa > 1:1321930/1‑140 (MQ=255) gcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTAt > 1:1394404‑M2/50‑140 (MQ=255) cccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTAtt > 1:781307‑M2/49‑140 (MQ=255) cccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTAtt > 1:922442‑M2/49‑140 (MQ=255) cccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTAtt < 2:1006124‑M2/92‑1 (MQ=255) ccAATCAAACCCCTGCTGCTTCAAGAAGATGACTGCAGGGGACACCATCCTTGAGTTTATCCCAAACACCACATAAAAACCGTAATTTAAATACGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACAACAGCAACACGTGGTTTTAtt < 2:1521895/140‑1 (MQ=255) aatcCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAgg < 1:1018855/99‑1 (MQ=255) aatcCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAgg > 2:1018855/1‑99 (MQ=255) aatcCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTAt > 1:989157/1‑140 (MQ=255) aatcCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTAt > 1:1194496/1‑140 (MQ=255) aatcCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTAt > 1:997510/1‑140 (MQ=255) ccccTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGaa < 1:844320/140‑1 (MQ=255) gggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAg < 1:1420120‑M2/102‑1 (MQ=255) gggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAg < 2:147909‑M2/102‑1 (MQ=255) cccTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAg < 1:156286/140‑1 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(MQ=255) tgcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGc < 2:626207‑M2/125‑1 (MQ=255) gcaggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGcc < 2:1318042‑M2/126‑1 (MQ=255) caggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCa > 1:1126148‑M2/14‑140 (MQ=255) caggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCa < 2:871110‑M2/127‑1 (MQ=255) ggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGa > 1:139272‑M2/12‑140 (MQ=255) ggggacaccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGa < 2:1142667‑M2/129‑1 (MQ=255) caccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGataata > 1:1511051‑M2/7‑140 (MQ=255) ccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATaaa < 1:1257341‑M2/136‑1 (MQ=255) ccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATaaa < 1:753220‑M2/136‑1 (MQ=255) ccatCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTATTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATaaa < 1:741608‑M2/136‑1 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAActct > 2:504651/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCt > 2:611613/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCt > 2:568131/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCt > 2:567614/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCt > 2:504461/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCt > 1:83352/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCt > 2:967425/1‑140 (MQ=255) ccTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCt > 1:1079579/1‑140 (MQ=255) | GTGACCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCATCCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCT > NC_000913/2476461‑2476739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |