Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,202,685 | 0 | A | G | 23.4% | 339.7 / 108.8 | 175 | E265E (GAA→GAG) | cca | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/65); new base G (21/20); total (90/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.77e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
TTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCC > NC_000913/3202587‑3202784 | tGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTg < 1:328048/100‑1 (MQ=255) gACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTgg < 1:316532/100‑1 (MQ=255) gACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTgg > 2:2058169/1‑100 (MQ=255) cGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGCTCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGcc > 2:2435258/1‑100 (MQ=255) cGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGcc > 2:1435736/1‑100 (MQ=255) cGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGcc > 2:2836926/1‑100 (MQ=255) gCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGccn < 1:2369350/100‑2 (MQ=255) gCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcg < 2:344017/100‑1 (MQ=255) tctcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGgcggcg < 1:3207812/100‑1 (MQ=255) tctcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGgcggcg < 1:3207704/100‑1 (MQ=255) tctcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcgcg < 2:762134/100‑1 (MQ=255) tctcAAGGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGGTGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTggcggcn < 2:1664939/100‑2 (MQ=255) cctcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGgcggcg < 2:1663991/99‑1 (MQ=255) tcAGTGGCGGCGAGGCTGAGTCCGGGGGTCGATGTCCGTTTCGCCACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtc < 2:2969918/100‑1 (MQ=255) tcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtc < 1:187481/100‑1 (MQ=38) tcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtc < 1:2576923/100‑1 (MQ=255) tcAATGGCGGCGATGCGGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGGTCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtc < 1:2396880/100‑1 (MQ=38) cAAGGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGAGGTCCGTTTCGCACCTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtca < 2:2623850/100‑1 (MQ=37) aaTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtcat > 1:1632158/1‑100 (MQ=255) aTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 1:1869760/100‑3 (MQ=38) tGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtcatca > 2:1950005/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtcatca < 2:494920/100‑1 (MQ=255) ggcggcGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTcatcat > 1:3174106/1‑100 (MQ=255) ggcggcGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTcatcat < 2:1002314/100‑1 (MQ=255) gcggcgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatg > 2:1207949/1‑100 (MQ=255) ggcgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggt > 2:2086296/1‑100 (MQ=255) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg > 1:3086305/1‑100 (MQ=255) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg < 2:1035212/100‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg > 1:3085470/1‑100 (MQ=255) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg < 2:1035365/100‑1 (MQ=255) gCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGc < 2:1537362/100‑1 (MQ=255) tGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGccc > 2:1321558/1‑100 (MQ=255) tGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGccc > 1:342966/1‑100 (MQ=255) tGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGccc > 2:2355449/1‑100 (MQ=255) tGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGccc > 1:1714726/1‑100 (MQ=255) aGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcgg < 2:920999/100‑1 (MQ=255) gTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggc > 2:1541807/1‑100 (MQ=255) gTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggc > 2:483890/1‑100 (MQ=255) tCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggcg < 1:1058592/100‑1 (MQ=255) ccGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggcgg > 2:3148132/1‑100 (MQ=255) cGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg > 1:2115920/1‑100 (MQ=255) cGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg < 1:930652/100‑1 (MQ=255) cGCAGGTCGATGTCCGTTACGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGACTGTCGCCACCAGAACTCTGGCGGCGTCATCATGGTCAGGGCCCGGCggg > 2:3164395/1‑100 (MQ=255) cAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg < 1:1857776/100‑1 (MQ=255) cAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg < 1:666154/100‑1 (MQ=255) ggTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGtt < 2:39164/100‑1 (MQ=255) gTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGttn < 1:254821/100‑2 (MQ=255) gTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa < 1:2880167/100‑1 (MQ=255) tCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTaa > 1:2435470/1‑100 (MQ=255) aTGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGACCGGCGGGTGTTAAGtt > 1:2950104/1‑100 (MQ=255) aTGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGACCGGCGGGTGTTAAGtt > 1:2950035/1‑100 (MQ=255) ccGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTg < 2:754745/100‑1 (MQ=255) ccGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTg < 1:264311/100‑1 (MQ=255) ccGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTg > 1:649928/1‑100 (MQ=255) ccGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTg > 1:1447024/1‑100 (MQ=255) ttCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAACATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaac < 1:888404/100‑1 (MQ=255) cAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACt < 2:735692/100‑1 (MQ=255) cTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATg < 1:1975901/100‑1 (MQ=255) cTTTAGGCCACGATCTCGGGAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATg < 2:2326208/100‑1 (MQ=255) tttATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGc < 1:2333798/100‑1 (MQ=255) ttATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGcc < 1:1664937/100‑1 (MQ=255) tATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGACAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTactcca > 2:2651634/1‑95 (MQ=255) aTGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAg > 2:56283/1‑100 (MQ=255) cACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTc > 1:883759/1‑100 (MQ=255) ctcGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGcgcg > 1:238202/1‑100 (MQ=255) ctcGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGcgcg > 2:1546134/1‑100 (MQ=255) ctcGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGcgcg > 1:1759400/1‑100 (MQ=255) cGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTg < 2:198387/100‑1 (MQ=255) cGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTg < 2:198216/100‑1 (MQ=255) ggTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGTCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGc > 2:1852262/1‑100 (MQ=255) gTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGcc < 1:1502515/100‑1 (MQ=255) gTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGcc > 1:1000245/1‑100 (MQ=255) gTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGcc < 1:954019/100‑1 (MQ=255) tAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCa < 1:1776501/100‑1 (MQ=255) catgatGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAAt > 2:2048352/6‑100 (MQ=37) aGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAAt < 2:170965/100‑1 (MQ=255) gggCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATg < 1:562857/100‑1 (MQ=255) gggCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATg < 1:562906/100‑1 (MQ=255) tgatGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGa > 2:1616585/4‑100 (MQ=38) tgatGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCAGCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGa > 1:1225309/4‑100 (MQ=25) tgatGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCAGCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGa > 1:2417445/4‑100 (MQ=25) ggCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGa < 2:1992232/100‑1 (MQ=255) ggCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGa > 1:3030853/1‑100 (MQ=255) gatGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGaa > 1:2778044/3‑100 (MQ=38) tGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAAt > 2:2290590/1‑100 (MQ=38) tGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAAt < 1:306158/100‑1 (MQ=255) aCGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTc > 1:2674431/1‑100 (MQ=39) aCGCGGCCAGAGTTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTc > 1:224254/1‑100 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCCGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 2:2695602/1‑100 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:1916209/1‑100 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 2:819038/1‑100 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:2050554/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg < 2:831981/100‑1 (MQ=255) gccgccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcgc < 1:1738574/100‑1 (MQ=255) cAGAACTTTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAttt > 2:1199577/1‑100 (MQ=255) aGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTa < 1:2692893/100‑1 (MQ=255) aGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTa > 2:252384/1‑100 (MQ=255) gAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAg > 1:8229/1‑100 (MQ=255) gAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAg > 1:2510690/1‑100 (MQ=255) aCTCTGGCCGCGACATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGcc < 2:1278087/100‑1 (MQ=255) | TTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCC > NC_000913/3202587‑3202784 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |