| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 228124 | NA (NA) | noncoding (2366/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTTGACTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/227956‑228108‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < NC_000913/228124‑227976 AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTCAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTTGAC < 2:7241909/150‑1AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTTGAC < 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1:14228/150‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 2:6687877/150‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 2:6074071/150‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 2:5622593/150‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 1:7010493/150‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATTCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACACACCAGACACTGTCCGCAAC > 2:6382070/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC > 2:7160936/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC > 2:3634738/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC > 1:6889361/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < 1:7852104/150‑1 AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTTGACTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/227956‑228108‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < NC_000913/228124‑227976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |