| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4412107 | 465 (0.930) | 5 (0.010) | 4/266 | NT | 1.1% | coding (129/399 nt) | yjfL | UPF0719 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 4412139 | 477 (1.000) | coding (161/399 nt) | yjfL | UPF0719 family inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4411953‑4412107‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacaat‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < NC_000913/4412139‑4411991 ATTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACGGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAA < 2:7184132/150‑1 TTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCTTATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAA < 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TTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAA < 2:3598376/150‑1 TTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAA > 2:8180920/1‑150 TTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAA < 1:8301673/150‑1 GGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACA > 1:4448000/1‑150 GTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAA < 2:6328373/150‑1 GTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAA < 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1:7088391/1‑150 TTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAAT > 1:6308162/1‑150 TTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAAT > 1:5123875/1‑150 TTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAAT < 1:3281696/150‑1 TTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGGTAATCAAAAACAAT > 1:6473925/1‑150 TTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTAAACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAAT > 2:4353081/1‑150 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< 2:1703424/149‑1 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT > 1:7380481/1‑150 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT > 2:3676919/1‑150 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT < 1:4332064/150‑1 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT > 1:6520976/1‑150 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT > 2:5676574/1‑150 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT < 1:7854100/150‑1 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT < 2:2585859/150‑1 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT < 2:2585848/150‑1 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT > 2:5961137/1‑150 AACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGT < 2:7996524/150‑1 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< 2:400889/150‑1 ACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTG < 2:2350290/150‑1 ACAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTG < 2:3471789/150‑1 aAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACTGCGCGGTATTATTGTTTTTGTTTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATGACCATAGCCTCGCCTATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGA < 2:4465749/149‑1 CAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGA < 2:7976370/150‑1 CAAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGA < 2:212564/150‑1 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AAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAA > 2:3286605/1‑150 AAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAA > 2:3674119/1‑150 AAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAA < 2:3812477/150‑1 AAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAA > 2:2028354/1‑150 AAT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAA < 1:973182/150‑1 AT‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAAT < 2:4046465/150‑1 T‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGTTTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < 1:7862100/150‑1 T‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < 1:7862077/150‑1 T‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < 2:237660/150‑1 T‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < 2:237678/150‑1 T‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < 1:3425693/150‑1 T‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < 2:238334/150‑1 ATTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4411953‑4412107‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacaat‑GTACCGCTGAACGCCAGTGACGCCGCGGTATTATTGTTTTTGATTAACTGCCATTCGTTGTGCGGTGTAATTTTAGAATAGATAAACAGAAAAATAATCACCATAGCCACGCCAATAAAAAAATAGGCGCTAAAGGCAAGAAGTGAATC < NC_000913/4412139‑4411991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |