| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,542,421 | G→T | 5.1% | S57Y (TCC→TAC) | narZ ← | nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,542,421 | 0 | G | T | 5.1% | 286.6 / 4.8 | 78 | S57Y (TCC→TAC) | narZ | nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/32); new base T (2/2); total (44/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
TGTAAAGATACCAGGAGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGTAGCGAA > NC_000913/1542278‑1542568 | tGTAAAGATACCAGGAGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTg > 1:165807/1‑150 (MQ=255)tGTAAAGATACCAGGAGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATGTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTg < 1:590078/150‑1 (MQ=255) aGGAGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAacac < 2:1279480/150‑1 (MQ=255) aGGAGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAacac > 2:289407/1‑150 (MQ=255) aGGAGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAacac > 1:310805/1‑150 (MQ=255) aGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCgt > 2:1141136/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCgtgggtg < 2:923675/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCgtgggtgg > 1:1082561/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTAATGATTGGGCAGGTCAGCGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCAATTTTAACGAAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCgtgggtgg > 1:9312/1‑150 (MQ=255) gcgcCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGaa > 1:1182905/1‑150 (MQ=255) cgcCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAAc < 2:1122800/150‑1 (MQ=255) cgcCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAAc < 2:1248618/150‑1 (MQ=255) gcCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACg > 1:1039776/1‑150 (MQ=255) gcCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACg > 1:335242/1‑150 (MQ=255) ccACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGc > 1:868173/1‑150 (MQ=255) gggCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGAtt < 2:290421/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTg < 2:67569/150‑1 (MQ=255) gAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACt < 1:523864/150‑1 (MQ=255) gAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACt > 1:1252994/1‑150 (MQ=255) gTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGcc > 1:1042462/1‑150 (MQ=255) ttCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCa > 2:880236/1‑150 (MQ=255) aGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAg > 2:60345/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTg > 1:1152041/1‑150 (MQ=255) aGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGtc < 1:1023179/150‑1 (MQ=255) gggCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGtcc > 1:1170330/1‑150 (MQ=255) gggCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGtcc > 1:1170350/1‑150 (MQ=255) ggCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGtcct < 1:731837/150‑1 (MQ=255) ggCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGtcct > 2:936888/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACTGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCTCGATTTTGTCGTACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTcgc > 2:1153533/1‑150 (MQ=255) tAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTg < 1:448157/150‑1 (MQ=255) tAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTg < 1:968933/150‑1 (MQ=255) tCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTa > 1:445121/1‑150 (MQ=255) ggTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATg < 1:135005/150‑1 (MQ=255) ggTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATg < 1:135004/150‑1 (MQ=255) gTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGc > 2:111223/1‑150 (MQ=255) tGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATc > 1:1276755/1‑150 (MQ=255) ttGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCAc > 2:853359/1‑150 (MQ=255) ttGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCAc > 2:857679/1‑150 (MQ=255) aTTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGt > 2:1192622/1‑150 (MQ=255) tttCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTc > 2:1261516/1‑150 (MQ=255) cccAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGt > 2:948903/1‑150 (MQ=255) accAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGt < 2:356758/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTg < 1:148496/150‑1 (MQ=255) cAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGa < 2:1094316/150‑1 (MQ=255) cAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGa > 1:766812/1‑150 (MQ=255) aGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGAc > 1:1332801/1‑150 (MQ=255) ggTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGAcc > 2:753236/1‑150 (MQ=255) gTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCa > 2:638975/1‑150 (MQ=255) aCCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCg < 1:253913/150‑1 (MQ=255) aCCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCg > 1:173487/1‑150 (MQ=255) aCCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCg < 1:253936/150‑1 (MQ=255) aCCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCaaa < 1:896257/150‑1 (MQ=255) aCCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCaaa < 1:475332/150‑1 (MQ=255) aCCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCaaa < 1:896326/150‑1 (MQ=255) aCCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCaaa < 1:1372134/150‑1 (MQ=255) ccATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAg < 1:733026/150‑1 (MQ=255) ccATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAg < 1:424113/150‑1 (MQ=255) aTTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGt > 1:1183856/1‑150 (MQ=255) ttttAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGttt < 1:759970/150‑1 (MQ=255) tttAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTc > 2:1180962/1‑150 (MQ=255) cGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCt > 2:1281750/1‑150 (MQ=255) gTAGATTTTCCAGCTACAGTAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATg > 2:869540/1‑111 (MQ=255) gTAGATTTTCCAGCTACAGTAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATg > 2:869601/1‑111 (MQ=255) gTAGATTTTCCAGCTACAGTAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATg < 1:869540/111‑1 (MQ=255) gTAGATTTTCCAGCTACAGTAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATg < 1:869601/111‑1 (MQ=255) tAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCttt > 2:192624/1‑150 (MQ=255) tAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCttt < 2:614507/150‑1 (MQ=255) aGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCtttt > 2:701212/1‑150 (MQ=255) gATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTtttg > 2:231450/1‑150 (MQ=255) gATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTtttg > 2:621397/1‑150 (MQ=255) ccAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGaa < 1:760985/150‑1 (MQ=255) aGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGt > 1:153844/1‑150 (MQ=255) aGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGt > 1:927729/1‑150 (MQ=255) gCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGTa < 1:522811/150‑1 (MQ=255) gCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGTa < 1:522860/150‑1 (MQ=255) gCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGTa < 1:522872/150‑1 (MQ=255) tACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGTAGc < 2:1224796/150‑1 (MQ=255) aGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGTAGCGaa > 2:208108/1‑150 (MQ=255) | TGTAAAGATACCAGGAGTAACTTGCGCCACGCGGGCAGCCGCGAGGTTCATGATTGGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAGACCATTTTTAACGTAGATTTTCCAGCTACAGGAGCCTGTACAGTTAACACCGTGGGTGGAACGCACGATTTTGTCGAACTGCCAACGCTGGCGATAGCTGTCCTCCCAGTCGCGGTTGCTATGCATCACCTGTCCGTGACCATCGGCAAAGGTTTCGCCCTTTTGTTTGAAGTAGCGAA > NC_000913/1542278‑1542568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |