| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,363,453 | C→T | 5.1% | A61T (GCC→ACC) ‡ | yfaY ← | inactive PncC family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,363,453 | 0 | C | T | 5.1% | 328.4 / 5.8 | 97 | A61T (GCC→ACC) ‡ | yfaY | inactive PncC family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/53); new base T (2/3); total (41/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.73e-01 | |||||||||||
TACTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACACT > NC_000913/2363304‑2363598 | tACTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGc < 1:1026155/150‑1 (MQ=255) tCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTg > 2:1399400/1‑150 (MQ=255) tCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTg > 1:994413/1‑150 (MQ=255) 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TACTCGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACACT > NC_000913/2363304‑2363598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |