| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,556,501 | C→T | 5.0% | G266D (GGC→GAC) | eutC ← | ethanolamine ammonia‑lyase, small subunit (light chain) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,556,501 | 0 | C | T | 5.0% | 272.0 / 3.4 | 80 | G266D (GGC→GAC) | eutC | ethanolamine ammonia‑lyase, small subunit (light chain) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/43); new base T (2/2); total (35/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
TCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTAAACGGCGTAGCAGGAGAGGCTTTCTGACTGACCCAACCCCGGACGTTCGCCCACCAGCAGGATCACTACTTTCGCGCCGAG > NC_000913/2556352‑2556649 | tCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgc > 1:1397418/1‑150 (MQ=255) aCCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTACAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgccg < 2:355359/150‑1 (MQ=255) aCCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgccg < 1:38063/150‑1 (MQ=255) aCCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgccg < 1:1291764/150‑1 (MQ=255) ccGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgccgcc < 1:1344856/150‑1 (MQ=255) ccGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgccgcc < 1:1344864/150‑1 (MQ=255) ccGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgccgcc > 2:150766/1‑150 (MQ=255) ccGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgccgcc > 2:291608/1‑150 (MQ=255) gCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCACgccgccgg < 2:839020/150‑3 (MQ=255) tAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt < 1:579201/150‑1 (MQ=255) tAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt < 1:201559/150‑1 (MQ=255) ggTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGAGGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAAt < 1:1307622/150‑1 (MQ=255) gACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTagag < 2:1203415/150‑1 (MQ=255) aCGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAgaga > 2:467373/1‑150 (MQ=255) gTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATAc < 1:218232/150‑1 (MQ=255) gAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGGTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGCATGTTAGAGATACAgg > 1:447213/1‑150 (MQ=255) aaTCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGt < 1:1004947/150‑1 (MQ=255) tCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGACTGTTAGAGATACAGGTGc > 1:192072/1‑150 (MQ=255) 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cTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCaa > 2:467419/1‑150 (MQ=255) tGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAAc < 2:365316/150‑1 (MQ=255) gCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACgg > 1:723052/1‑150 (MQ=255) gCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCGGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACgg > 2:188238/1‑150 (MQ=255) cATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggt < 2:474287/150‑1 (MQ=255) cATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggt < 2:476038/150‑1 (MQ=255) atgatgCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggtg < 2:1247846/150‑1 (MQ=255) tgatgCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggtgg > 2:1244627/1‑150 (MQ=255) tgatgCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggtgg < 2:984931/150‑1 (MQ=255) gatgCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGTCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggtggt > 2:726400/1‑150 (MQ=255) gatgCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGTCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggtggt > 2:726419/1‑150 (MQ=255) cctcctTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGcc > 2:1236262/1‑150 (MQ=255) cctcctTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGcc > 2:155909/1‑150 (MQ=255) cctcctTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGcc > 2:469105/1‑150 (MQ=255) ctTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATAc < 2:1061397/150‑1 (MQ=255) 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tCAACCGGCGGCGTGTCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTAAACGGCGTAGCAGGAGAGGCTTTCTGACTGACCCAACCCCGGACGTTCGCCCACCAGCAGGATCact < 1:726419/150‑1 (MQ=255) ggcggcGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTAAACGGCGTAGCAGGAGAGGCTTTCTGACTGACCCAACCCCGGACGTTCGCCCACCAGCAGGATCACTACTTTc < 1:799991/150‑1 (MQ=255) gcgTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGa < 2:669592/70‑1 (MQ=255) gcgTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGa > 1:669592/1‑70 (MQ=255) tGCCGCCCTGGTGTATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTAAACGGCGTAGCAGGAGAGGCTTTCTGACTGACCCAACCCCGGACGTTCGCCCACCAGCAGGATCACTACTTTCGCGccta < 1:935259/150‑3 (MQ=255) tGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTAAACGGCGTAGCAGGAGAGGCTTTCTGACTGACCCAACCCCGGACGTTCGCCCACCAGCAGGATCACTACTTTCGCGCCGa < 1:538149/150‑1 (MQ=255) gccgccCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTAAACGGCGTAGCAGGAGAGGCTTTCTGACTGACCCAACCCCGGACGTTCGCCCACCAGCAGGATCACTACTTTCGCGCCGAg > 2:797054/1‑150 (MQ=255) | TCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTAAACGGCGTAGCAGGAGAGGCTTTCTGACTGACCCAACCCCGGACGTTCGCCCACCAGCAGGATCACTACTTTCGCGCCGAG > NC_000913/2556352‑2556649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |