Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,390,401 | C→A | 5.3% | intergenic (‑41/+56) | psd ← / ← rsgA | phosphatidylserine decarboxylase/ribosome small subunit‑dependent GTPase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,390,401 | 0 | C | A | 5.3% | 345.1 / 7.4 | 95 | intergenic (‑41/+56) | psd/rsgA | phosphatidylserine decarboxylase/ribosome small subunit‑dependent GTPase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/39); new base A (2/3); total (53/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 |
TTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTT > NC_000913/4390256‑4390542 | ttttGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACa > 2:1164473/1‑150 (MQ=255) tCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCg < 2:842671/150‑1 (MQ=255) aGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGa > 2:1382966/1‑150 (MQ=255) aGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCATGTAGGCCGGa < 1:600615/150‑1 (MQ=255) gCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGAt > 1:246289/1‑150 (MQ=255) gCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGAt > 1:246273/1‑150 (MQ=255) gCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCATGTAGGCCGGAt < 2:220724/150‑1 (MQ=255) cATCCTGCCCGCTTGCTGGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATcc < 2:1267174/150‑1 (MQ=255) tCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGACTTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTg < 1:1168724/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCGCGCCCGCGCCCCCCCCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGa < 1:1374659/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGaa > 1:321487/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCATGTAGGCCGGATcaggaac < 2:766542/150‑7 (MQ=255) cccGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCAATGATTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGaaaaa > 1:960426/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTAAAATGAATTTAACAAGGTAGACTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCAGGCCTACATGCCGGCTCCTGaaaaaa > 2:1058105/1‑150 (MQ=255) cGCTTGCTTGCGCCCCCACCCGCCCGGCGAGTAAGCCATAGTCTCGGCAGAATGTACTGTCGCGAAAGTTTAAATGAATCTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGaaaaaaa < 1:369090/150‑1 (MQ=255) cGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGaaaaaaa < 1:369093/150‑1 (MQ=255) gcttgcttGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAg > 2:108345/1‑150 (MQ=255) gcttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAATAAAAGGGGa < 1:176031/150‑1 (MQ=255) gcttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGa < 1:156387/150‑1 (MQ=255) ttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACg > 1:44118/1‑150 (MQ=255) tgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCGGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGa < 2:965862/150‑1 (MQ=255) tgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGa < 2:259502/150‑1 (MQ=255) gcCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTCCTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTc < 1:919894/150‑1 (MQ=255) gcCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTACGGCAGACTGAACTCTAGCGAAAGTTGAAACGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTc < 1:919887/150‑1 (MQ=255) ccccAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCt > 2:710620/1‑150 (MQ=255) ccccAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCt > 2:710618/1‑150 (MQ=255) cccAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAATAAGGGGACGATTCTa > 2:364833/1‑150 (MQ=255) cccAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTa > 2:455257/1‑150 (MQ=255) cccAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCAGTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTa > 2:715496/1‑150 (MQ=255) aGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAg > 1:849245/1‑150 (MQ=255) ggCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGc < 2:710658/150‑1 (MQ=255) tAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAAtt > 2:276649/1‑150 (MQ=255) tAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAAtt > 2:1356509/1‑150 (MQ=255) tAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCAATGTTTTGTCGTTCCTGATACGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGAAGATTCTAACGACGGGTAGCTTAAtg > 2:1182636/1‑149 (MQ=255) gCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtc > 1:1402436/1‑150 (MQ=255) gCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtc > 1:1402459/1‑150 (MQ=255) gCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtc < 2:755707/150‑1 (MQ=255) gCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtc > 1:571080/1‑150 (MQ=255) gCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGGTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtc < 2:755734/150‑1 (MQ=255) ccATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGAGCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtca < 1:76104/150‑1 (MQ=255) cATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtcag > 1:427212/1‑150 (MQ=255) tttCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAACAAAAGGGGACGAGTCGAACGACGGGGAGCTGCATGGTCCGGCATc > 2:904911/1‑150 (MQ=255) tcAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTAt > 2:1313226/2‑150 (MQ=255) aGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCa > 1:1232777/1‑150 (MQ=255) aGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCa < 2:447002/150‑1 (MQ=255) aGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTGAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCa < 2:448503/150‑1 (MQ=255) tGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGaaa > 1:491728/1‑150 (MQ=255) gTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGaaaa < 1:499146/150‑1 (MQ=255) gTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGaaaa < 2:321487/150‑1 (MQ=255) tGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGttt > 2:1333237/1‑150 (MQ=255) gTAGCGAAAGTTTAAATTAATTGAACCAGGGAGCCGCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAAGTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGtttt < 1:887954/150‑1 (MQ=255) gCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCAATGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGAGTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTAc > 2:182088/1‑150 (MQ=255) cGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTAAcg > 2:238166/1‑150 (MQ=255) ttAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGttttt > 2:1003329/1‑150 (MQ=255) gAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTgc < 2:1209300/150‑1 (MQ=255) aTTTAACAAGTTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGTGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTgcgc < 2:683487/150‑1 (MQ=255) aTTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTgcgc < 1:575143/150‑1 (MQ=255) aTTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTGAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTgcgc > 1:387096/1‑150 (MQ=255) ttAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCa > 1:854008/1‑150 (MQ=255) aaCAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATg > 2:1224507/1‑150 (MQ=255) aCAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGc > 1:916136/1‑150 (MQ=255) gTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTCTCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTcc > 1:157852/1‑150 (MQ=255) gTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTcc > 1:157818/1‑150 (MQ=255) tAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCTGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCa < 2:782988/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTAACTGCGCCATGCTTTCCAGAATAc > 1:1108320/1‑150 (MQ=255) aGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACgg > 1:880335/1‑150 (MQ=255) aGGCCATTGTTTTGACGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACgg < 2:392586/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGt < 2:1096232/150‑1 (MQ=255) ccATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGa > 2:1293737/1‑150 (MQ=255) ccATTCTTTTGTCGTTCATGATCCGGCATACATGCAGGATCCAGAAAAAAAGGGGACGAGTCTAACGACGGGTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGAATCAGAAACGTTTTTACGCGTTTATACCTGCGCCATGCGTTCCACAATACGGTgg > 2:1293741/1‑149 (MQ=255) cATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATCCGGTGAt > 2:834613/1‑150 (MQ=255) cATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGAt < 2:1249168/150‑1 (MQ=255) cATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGAt < 2:1249167/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATa < 2:38576/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATa < 1:470166/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATa < 2:664749/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATCCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATa < 1:1061922/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAg > 2:92667/1‑150 (MQ=255) ttttGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGttt < 2:783252/150‑1 (MQ=255) tttGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGtttt < 1:982514/150‑1 (MQ=255) tttGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGtttt < 1:982499/150‑1 (MQ=255) tttGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGtttt < 1:982490/150‑1 (MQ=255) ttGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTc < 2:1303515/150‑1 (MQ=255) tCGTTCCTGATCCGGCCTACATTCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCAAGCTTTCCAGAAAACGGTGATAGTTTTAGaa > 1:583324/1‑150 (MQ=255) tCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTAAGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCAAGAATACGGTGATAGTTTTCGaa > 1:1363978/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAAc > 1:108852/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACg > 1:1250395/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTGTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACg > 1:1250400/1‑150 (MQ=255) tCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACgg < 1:150364/150‑1 (MQ=255) tCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACgg > 1:115647/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACggg > 1:708538/1‑150 (MQ=255) tGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGtt > 1:666509/1‑150 (MQ=255) tGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGtt > 1:1214352/1‑150 (MQ=255) gATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGttt > 1:450127/1‑150 (MQ=255) gATCCGGCATGTAGGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACTCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGttt > 2:745072/1‑150 (MQ=255) | TTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTT > NC_000913/4390256‑4390542 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |