| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3499211 = | 141 (1.560) | 7 (0.080) | 6/260 | NT | 5.1% | intergenic (+10/‑237) | cysG/yhfL | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase/small lipoprotein |
| ? | NC_000913 | 3499229 = | 129 (1.510) | intergenic (+28/‑219) | cysG/yhfL | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase/small lipoprotein | |||||
GAATATTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3499365‑3499211‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctggccTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTC > NC_000913/3499229‑3499376 GAATATTTAATTGTAGTCAGTGAGAGAATGACTTAATTTTGTAAGTCTCTTTAAAGGTGATTATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGTCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCT < 1:102741/149‑1GAATATTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCT > 2:1239015/1‑149GAATATTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCT > 2:1129314/1‑149 AATATTTAATTGGCGTCATTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGTATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTC < 1:1462418/149‑1 AATATTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGTCCAGAATTCTC < 1:1507651/149‑1 aATTAAATTGGCTTGAGTGAGCGAATGACTTTATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATATAATAATTGGCAATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTG < 2:66622/148‑1 ATTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACTGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGG < 1:52412/149‑1 TTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGC > 1:1331916/1‑149 TTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGC > 2:1356291/1‑149 CATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCACCTTAATAAATATTATat > 2:361055/1‑147 GCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAAT > 2:1513222/1‑149 TGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTA > 2:684560/1‑149 TCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGA > 1:74397/1‑149 TCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGA > 1:409174/1‑149 ATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACG > 2:128386/1‑149 AGGCCAGAATTCTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTA > 2:1265844/1‑149 TCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTA < 2:505233/149‑1 TGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGACAATTAAATATTCCTGTATC > 1:841209/1‑149 TGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCATTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTAAAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATC > 2:365686/1‑149 GGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCG < 1:1000167/149‑1 GGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCG < 1:1352201/149‑1 GGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCG < 1:1000173/149‑1 GCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGT > 1:382221/1‑149 CCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTT < 1:626969/149‑1 CCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTT > 1:445098/1‑149 CTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTa > 1:1494654/1‑148 CTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTAACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCAAATTAAATATTCATGTATCGTTC > 2:56028/1‑149 GAATATTTAATTGGCGTCAGTGAGCGAATGACTTAATTTTGTAAGTCGCTGTAACGGTGAATATAACCCATTAGCAGATAATATTTATTAAGGGGCTATGTTTTATTTGCTGAATATATAAAAAGAGTCATTAAGAAGGCCAGAATTCTCTGGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3499365‑3499211‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctggccTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTC > NC_000913/3499229‑3499376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |