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Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
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gAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTAt < 2:1119970/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATc < 1:1572322/149‑1 (MQ=255) aGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATACCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCa > 1:1416330/1‑149 (MQ=255) aGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCACTAGTATTCAATATCACTTTGAATCATATTTAAATTACTAATATATCa > 1:238595/1‑149 (MQ=255) gCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaa > 1:417033/1‑149 (MQ=255) ggTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaaat < 2:1317893/149‑1 (MQ=255) aaGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaaataaat > 1:224494/1‑149 (MQ=255) aGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAatc < 2:952722/149‑1 (MQ=255) attGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGCCGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCACGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGc > 2:21962/1‑149 (MQ=255) attGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGc > 1:798209/1‑149 (MQ=255) aTAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCt > 2:117776/1‑149 (MQ=255) gaagCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTgg < 2:1058461/149‑1 (MQ=255) | CAGTTCTCTCAAATCGTAAAAGTTTATCGGTAAGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGC > NC_000913/245987‑246283 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |