New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 450687 = | 28 (0.310) | 4 (0.050) | 4/266 | NT | 8.2% | coding (924/948 nt) | cyoA | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II |
? | NC_000913 | 450751 = | 62 (0.710) | coding (860/948 nt) | cyoA | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II |
CAGGCCAACGAGCGCCAGACCTCCCAAAATAATGCCAGCGATCGTAACCATGACGATAGGTTCATGGAACGGGACTGCATCAAGTGATAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAT > NC_000913/450540‑450834 | gaagcagtcgccgaacaccatgtctgacatggctgcgttcgaaaaactggccgcgcctagcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCa < 2:1172632‑M1/2‑1 (MQ=255) gaagcagtcgccgaacaccatgtctgacatggctgcgttcgaaaaactggccgcgcctagcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCa < 1:1242713‑M1/2‑1 (MQ=255) gaagcagtcgccgaacaccatgtctgacatggctgcgttcgaaaaactggccgcgcctagcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCa < 1:1249868‑M1/2‑1 (MQ=255) gaagcagtcgccgaacaccatgtctgacatggctgcgttcgaaaaactggccgcgcctagcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCa < 1:25195‑M1/2‑1 (MQ=255) aagcagtcgccgaacaccatgtctgacatggctgcgttcgaaaaactggccgcgcctagcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCAt > 1:731819‑M1/147‑149 (MQ=255) aagcagtcgccgaacaccatgtatgacattgctgcgttcgaaaaactttcagcgcgtagctaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCAt > 2:640461‑M1/147‑149 (MQ=255) accatgtctgacatggctgcgttcgaaaaactggccgcgcctagcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaacccgacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCATGTCCATGCCTTCCAt < 1:933469‑M1/18‑1 (MQ=255) aaaactggccgcgcctagcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCtt < 1:380392‑M1/44‑1 (MQ=255) gcgaatacaaccaggtggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTcc > 2:812955‑M1/89‑149 (MQ=255) tggaatatttctccaacgtgaaaccagacttgtttgccgatgtaattaacaagtttatggctcacggtaagagCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGa > 2:933469‑M1/74‑149 (MQ=255) atcATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATc > 2:154301/3‑149 (MQ=255) aTCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGc < 1:1097116/149‑1 (MQ=255) tCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCAGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCa > 1:550113/1‑149 (MQ=255) cTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCaa > 2:72538/1‑149 (MQ=255) tttATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCaaa > 2:580375/1‑149 (MQ=255) ttATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCacac > 1:93096/1‑149 (MQ=255) tATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACa > 1:268541/1‑149 (MQ=255) tATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACa > 1:1229296/1‑149 (MQ=255) ttcCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCt > 1:1320539/1‑149 (MQ=255) ccTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATTTACATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTgg < 2:1037056/149‑1 (MQ=255) tCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGtt > 1:1185708/1‑149 (MQ=255) tCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGtt > 2:1284227/1‑149 (MQ=255) cAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGttt < 2:1311724/149‑1 (MQ=255) ccTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGt > 2:1181721/1‑149 (MQ=255) cTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGtt > 1:1394767/1‑149 (MQ=255) tttAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTg > 2:349470/1‑149 (MQ=255) tttAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATCCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTg > 1:650422/1‑149 (MQ=255) aaTGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGgag < 1:923727/149‑1 (MQ=255) aaTGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGgag > 2:977526/1‑149 (MQ=255) gggCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGaaa < 2:487061/149‑1 (MQ=255) ggtggATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAat < 1:454274/146‑1 (MQ=255) ggtggATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAat < 1:1036610/146‑1 (MQ=255) ggATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATAtt < 1:72538/149‑1 (MQ=255) gATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTc < 2:883547/149‑1 (MQ=255) aTTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTcc > 2:1249868/1‑149 (MQ=255) aTTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTcc > 2:959969/1‑149 (MQ=255) cgcgTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACATTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTTCATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCt > 2:776475/1‑149 (MQ=255) cgTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 2:1186338/149‑1 (MQ=255) tCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATGGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGGTGTAt > 2:195855/1‑149 (MQ=255) tCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAt > 1:1442252/1‑149 (MQ=255) | CAGGCCAACGAGCGCCAGACCTCCCAAAATAATGCCAGCGATCGTAACCATGACGATAGGTTCATGGAACGGGACTGCATCAAGTGATAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAT > NC_000913/450540‑450834 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |