| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 609312 = | 61 (0.680) | 4 (0.050) | 4/260 | NT | 7.1% | noncoding (1306/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2515540 = | 47 (0.550) | noncoding (1268/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
AAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATT > NC_000913/609164‑609460 | ctgcaagggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgt < 1:664080‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcaagggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgtt > 1:284960‑M1/148‑149 (MQ=255) tgcaagggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgtt < 1:1293348‑M1/2‑1 (MQ=255) gcaagggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttc > 1:156717‑M1/147‑149 (MQ=255) gcaagggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttc > 2:1146428‑M1/147‑149 (MQ=255) gggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgTTCTTCa > 1:40955‑M1/143‑149 (MQ=255) tCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAg < 1:660041/149‑1 (MQ=11) aTCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTa < 1:430597/149‑1 (MQ=32) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |