New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 812959 = | 92 (1.020) | 5 (0.060) | 4/248 | NT | 5.4% | intergenic (+12/‑567) | bioD/uvrB | dethiobiotin synthetase/exision nuclease of nucleotide excision repair, DNA damage recognition component |
? | NC_000913 | 813011 = | 91 (1.110) | intergenic (+64/‑515) | bioD/uvrB | dethiobiotin synthetase/exision nuclease of nucleotide excision repair, DNA damage recognition component |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAG > NC_000913/812811‑813106 | ggggAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACGCGCATGATTCCCGCTCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGGAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTAtt < 1:745905/148‑1 (MQ=255) ctcgtgttttctaactctaatacacatggttatccacaggaatagtggataactgtctccagcccctatcccccgccgcctgggcaattcccacattcgccgcatgaggcggaagtaaaatttttttcgtgattattttagaatttaat < 1:1085347‑M1/1‑1 (MQ=255) cGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTAtt > 1:1137319/1‑149 (MQ=255) ggAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTg < 2:1136304/149‑1 (MQ=255) ggAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTg < 2:1250905/149‑1 (MQ=255) ggAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTg > 1:660116/1‑149 (MQ=255) gAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAAGCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTgg < 1:197430/149‑1 (MQ=255) tgttttctaactctaatacacatggttatccacaggaatagtggataactgtctccagcccctatcccccgccgcctgggcaattcccacattcgccgcatgaggcggaagtaaaatttttttcgtgattattttagaatttaaTTGGt > 2:499947‑M1/145‑149 (MQ=255) aataCGTCTCGCTGAATATATGACCAAGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGGTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGt < 2:209088/146‑1 (MQ=255) gttttctaactctaatacacatggttatccacaggaatagtggataactgtctccagcccctatcccccgccgcctgggcaattcccacattcgccgcatgagtcggaagtaaaatttttttcgtgattattttagaatttaaTTGGtt > 2:1286872‑M1/144‑149 (MQ=255) gttttctaactctaatacacatggttatccacaggaatagtggataactgtctccagcccctatcccccgccgcctgggcaattcccacattcgccgcatgaggcggaagtaaaatttttttcgtgattattttagaatttaaTTGGtt > 2:1256472‑M1/144‑149 (MQ=255) ttctaactctaatacacatggttatccacaggaatagtggataactgtctccagcccctatcccccgccgcctgggcaattcccacattcgccgcatgaggcggaagtaaaatttttttcgtgattattttagaatttaaTTGGTTaaa < 1:916248‑M1/9‑1 (MQ=255) cGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTaaa < 2:1529355/149‑1 (MQ=255) tCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCGTGCCGTGTTGTAGCCATTCTGTAATTGGTTAAAtt > 1:53638/1‑149 (MQ=255) taactctaatacacatggttatccacaggaatagtggataactgtctccagcccctatcccccgccgcctgggcaattcccacattcgccgcatgaggcggaagtaaaatttttttcgtgattattttagaatttaaTTGGTTAAATTg > 1:1386037‑M1/138‑149 (MQ=255) cACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTg < 2:12552/149‑1 (MQ=255) cGCTTAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTgcg < 1:790701/149‑1 (MQ=255) gCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTgcga > 2:1380067/1‑149 (MQ=255) 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cttgTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGcggcgg > 2:226220/1‑149 (MQ=255) cttgTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGcggcgg > 2:455715/1‑149 (MQ=255) ttgttgTACGCATTCTGGATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCggg < 2:84228/149‑1 (MQ=255) gtAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATa > 2:1172030/1‑149 (MQ=255) gtAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATa > 2:365477/1‑149 (MQ=255) gtAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGAGTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATa < 2:53638/149‑1 (MQ=255) ccATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAgggg > 1:505225/1‑149 (MQ=255) ttCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTg > 1:25739/1‑149 (MQ=255) cTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGga < 1:1595825/149‑1 (MQ=255) tttGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCTGCGAATGTGTGAATTGCCAAGTCGTCGGGGGATAGGGGCTggcgtctt > 1:1020296/1‑143 (MQ=255) tttGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAg > 2:72485/1‑149 (MQ=255) tttGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAg > 2:1289733/1‑149 (MQ=255) | CGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAG > NC_000913/812811‑813106 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |