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aGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATTGCAGTACTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAg < 2:254715/149‑1 (MQ=255) gcgcATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAggg > 2:392986/1‑149 (MQ=255) gcATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGcc < 1:985005/149‑1 (MQ=255) gTCCTGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGGCTTGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCggg < 2:535564/149‑1 (MQ=255) tCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCgggg < 1:1476392/149‑1 (MQ=255) cGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGcc > 2:385866/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGccc > 1:1482521/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGcac > 2:551900/1‑147 (MQ=255) tAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCGGTAAAGGGGCCCTg < 2:97545/149‑1 (MQ=255) aaTGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGAAATTGAAATGACAAAATGATAGCATGGCCCCTTTACCGGGGCCATGa > 1:1133485/1‑149 (MQ=255) attgCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCATCAACGGTAAGAACATAGTTATAATCGGGAGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGaa < 2:572283/146‑1 (MQ=255) aTGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGaa < 2:876010/149‑1 (MQ=255) tGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAg < 1:1119833/149‑1 (MQ=255) ggCAGTCCTTCTCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGGAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCGGTAAAGGGGCCCTgctat < 2:1117787/149‑5 (MQ=255) ggCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGc > 1:1462776/1‑149 (MQ=255) gCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGCg > 1:277795/1‑149 (MQ=255) | ACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGCG > NC_000913/4537364‑4537658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |