New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 781577 = | 70 (0.780) | 3 (0.030) +GAAGTG |
3/262 | NT | 5.6% | noncoding (1/76 nt) | lysQ | tRNA‑Lys |
? | NC_000913 | 2521171 = | 36 (0.400) | intergenic (+45/‑2) | valX/valY | tRNA‑Val/tRNA‑Val |
CCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC > NC_000913/2521024‑2521314 | ctgctgcaggttcgaatctttgagtatcgcagatagtaaaaaagcgcctttagggcgcttttttacattggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacCCGAAGt < 2:1141327‑M1/7‑1 (MQ=255) ccgccgTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGt < 1:809338/149‑1 (MQ=255) ccgccgTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGt > 2:809338/1‑149 (MQ=255) 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tGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGTGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCAATCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAaggagg < 2:532528/149‑1 (MQ=255) tGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAaggagg < 1:1207117/149‑1 (MQ=255) aaGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTATTGTAAAAATGTGAAGTAAAGAAGTGGGTGATTAGCTAAGCTGGGAGAGCACCTCACATACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCg > 2:1426241/1‑149 (MQ=37) aaGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTGCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTTAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGAGCCCg > 1:495787/1‑149 (MQ=255) ttggtgggtcgtgcaggattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacCCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGtcat < 2:916567‑M1/74‑1 (MQ=255) cggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTATTGTAAAAATGTGAAGTAACGAAGTGGGTGATTAGCTCAGATGGGAGAGCACCTCCCTTAATAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCACGTCATAACccaccaa > 2:1100549/1‑148 (MQ=25) ttcgaacctgtgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacccgaagtgGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCgg < 1:398546‑M2/84‑1 (MQ=255) gattcgaacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacCCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCggg > 1:1428846‑M1/60‑149 (MQ=255) aacctgcgaccaattgattaaaagtcaactgctctaccaactgagctaacgacCCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTa > 1:595085‑M1/54‑149 (MQ=255) acccaccACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAgggg < 1:1151364/99‑1 (MQ=255) acccaccACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAgggg > 2:1151364/1‑99 (MQ=255) 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CCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC > NC_000913/2521024‑2521314 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |