New junction evidence | |||||||||||
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ATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGATGGAGCTACGTGCGCAGCGGC > NC_000913/919289‑919580 | aTCGCCGGACTGCTTACGGTAGGGAGATTTCTTAACGCACCCGTGCCGACCTAGCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGCGATTTACAGCAAAGCGTTCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGt > 1:208255‑M2/1‑148 (MQ=255) aTCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATGCTTAACGCCCCCGGGCCGACTTATCCGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGAGTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGt > 1:213091‑M2/1‑148 (MQ=255) gACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGt > 1:412542/1‑149 (MQ=255) 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aTTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACAGGATAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGtt > 2:236827/1‑149 (MQ=255) aTTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGAGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGtt > 2:754695/1‑149 (MQ=255) tACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGa < 2:106655/149‑1 (MQ=255) tACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTCCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATATACAGCAAAGCGTGCTGGCTACCGGAAAGCTGGACTCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGa < 2:111071/149‑1 (MQ=255) cGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGCCCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGaaa > 2:1006933/1‑149 (MQ=255) aTGGAGACCTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGGGCGCCCCGGGGACTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCGGGACGCGCTGCGTAAGGGTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAActc < 1:1135184/149‑1 (MQ=255) tGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAActct < 2:763535/149‑1 (MQ=255) gagaATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGt > 2:1404883/1‑149 (MQ=255) agaATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGAGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTc > 1:1168422/1‑149 (MQ=255) agaATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTAACAGACGCTGAAAGTGCGACCAGGTGATTTACAGCAAAGCTTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTAGAAAACTCTTTc > 1:536115/1‑149 (MQ=255) 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gcTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGc > 1:891077/1‑149 (MQ=255) tGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTTAAAACTCTGTCGGTGGCGTTTGGCGATAAAGTAAATAAAGACCAGCTTTTAGTGGTTATTGATCCTGAACAGTCTGAAAACCTGATTAAGGATGTCGAAGCAACGCTg < 2:536115/149‑1 (MQ=255) cGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGAt < 2:412542/149‑1 (MQ=255) cGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGAt < 1:156982/149‑1 (MQ=255) cGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGAt < 2:159876/149‑1 (MQ=255) cGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGGGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGAt < 2:811137/149‑1 (MQ=255) gTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGATg > 2:665477/1‑149 (MQ=255) tAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGATgg > 2:310740/1‑149 (MQ=255) tGATGTGGGCGCGCAGTGCAGCGTTCAGTTGAAACCTCTGTCGGTGGCGATTCGCGACAAAGTAAACAAAGACCAGCCTTTAGGGGTTCTTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGCTCGAAGCAACGCTGATGGAGCTAc < 1:236827/149‑1 (MQ=255) gATGTGGGCGCGCAGGtcagcgtctgataagtcggcacgggtgcgttaagaattctccataacgtaatcagtccggcgatgactatcaccagcgcaataacgtaacgcttcttcacggttttccgctttttcataaattttctgaatac > 2:1205950‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGATGGAGCTACGt > 1:1207945/1‑149 (MQ=255) cgcAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGGCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGATGGAGCTACGTGCGCAGCgg < 1:950912/149‑1 (MQ=255) gcAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGATGGAGCTACGTGCGCAGCGgc > 2:596746/1‑149 (MQ=255) | ATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGTCGGTGGCGATTGGCGATAAAGTAAAAAAAGACCAGCTTTTAGGGGTTATTGATCCTGAACAGGCTGAAAACCAGATTAAGGAGGTCGAAGCAACGCTGATGGAGCTACGTGCGCAGCGGC > NC_000913/919289‑919580 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |