| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3722005 | 154 (1.710) | 8 (0.090) | 8/258 | NT | 5.1% | noncoding (1373/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3722024 | 154 (1.810) | noncoding (1392/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAA > NC_000913/3721876‑3722172 | aCCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGATCTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAAtcagac > 1:1555222‑M2/1‑143 (MQ=255) aCCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAAtcagac > 1:981521‑M2/1‑143 (MQ=255) ggAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTc < 2:95052/149‑1 (MQ=255) ttttttATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGtt < 2:1296992/148‑1 (MQ=255) gtTTTTATCTTGATGATTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCTATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGtt < 1:782755/149‑1 (MQ=255) tttttATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGttt > 2:1348662/1‑149 (MQ=255) tttATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTaa < 2:626512/149‑1 (MQ=255) tttATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTaa > 2:1582822/1‑149 (MQ=255) tgatgaGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCa > 1:1327876/1‑149 (MQ=255) gatgaGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCaa < 1:883862/149‑1 (MQ=255) atgaGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCaaa > 2:1150349/1‑148 (MQ=255) tgaGTTCATTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGACTTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTAAACTGTCCAACt < 1:980818/149‑1 (MQ=255) gaGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACtt < 2:1173198/149‑1 (MQ=255) aGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACttt > 2:1199820/1‑149 (MQ=255) ttCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACttttt > 2:431189/1‑149 (MQ=255) ttCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACttttt < 2:733524/149‑1 (MQ=255) tCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑g < 1:926363/149‑1 (MQ=255) tCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑g < 1:568703/149‑1 (MQ=255) cAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑gg < 1:738307/149‑1 (MQ=255) cAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑gg < 1:938306/149‑1 (MQ=255) aGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑ggg > 1:592061/1‑149 (MQ=255) aGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑ggg > 2:1504550/1‑149 (MQ=255) tataAGCTAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAg < 2:1402056/149‑1 (MQ=255) gCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACaa > 1:665297/1‑149 (MQ=255) gCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCAAATTGAATATCGGAATCA‑CACCTATATGCCTCGAGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACaa > 1:86000/1‑149 (MQ=255) gAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACaaaa > 1:640735/1‑148 (MQ=255) aCTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTatat < 2:57122/105‑1 (MQ=255) aCTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTatat > 1:57122/1‑105 (MQ=255) gAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGa < 2:1443714/149‑1 (MQ=255) gAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGa < 2:605419/149‑1 (MQ=255) aatgATGCTGTTACGTAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGATTATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGTGTCAGTACAAACTTTGAt < 1:281122/146‑1 (MQ=255) aaGGATGCTGTTACGGAATATATTGTATACTACAACAGCAGAAGAATTCGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGACTCGTGTTTAACTGTCCATCTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGAt < 1:285535/149‑1 (MQ=255) aaGGATGCTGTTACGGAATATATTGACTACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑TACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGAt < 1:156532/149‑1 (MQ=255) aaGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGAt < 1:106896/149‑1 (MQ=255) gATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GTGGTCAGTACAAACTTTGATTta > 2:1454246/1‑149 (MQ=255) gATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTta > 2:1159836/1‑149 (MQ=255) aTGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTtat < 2:261184/149‑1 (MQ=255) cTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAACAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGt < 1:213309/149‑1 (MQ=255) ttACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAg > 1:375612/1‑149 (MQ=255) ttAAGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAg < 1:170416/149‑1 (MQ=255) tACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAgg < 1:1005396/149‑1 (MQ=255) cGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTg > 2:184896/1‑149 (MQ=255) gAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAAATGTCAAACTTATT‑GGTGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTggg > 1:739491/1‑149 (MQ=255) atatatTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCAAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGc > 1:798545/1‑149 (MQ=255) tttGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCtttt < 2:341766/148‑1 (MQ=255) atTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCtttt > 1:1538746/1‑149 (MQ=255) ttGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGCCTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCttttg > 1:997056/1‑148 (MQ=255) ttGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTtc > 1:586050/1‑149 (MQ=255) tGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTtct < 1:1210765/149‑1 (MQ=255) tGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTtct < 2:1599911/149‑1 (MQ=255) aaTACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCtttt < 2:663176/145‑1 (MQ=255) aaTACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTctct > 2:1223289/1‑149 (MQ=255) tactacAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCtctgt < 1:410004/149‑1 (MQ=255) tacAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAAAATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCtctgtctg < 2:529893/149‑1 (MQ=255) caacaGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGcc > 1:1423343/1‑149 (MQ=255) cagcagAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACaaa > 2:147542/1‑107 (MQ=255) agcagAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTc > 1:650561/1‑149 (MQ=255) agcagAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTc < 1:1399371/149‑1 (MQ=255) cagAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCgg < 2:496104/149‑1 (MQ=255) gaagaaTTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATGTGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTg > 1:1467499/1‑149 (MQ=255) gaagaaTTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTg < 2:286925/149‑1 (MQ=255) ttAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATAcc > 1:326018/1‑149 (MQ=255) tAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCt < 2:246062/149‑1 (MQ=255) tAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGGCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCt < 2:855472/149‑1 (MQ=255) atccattaaTTAAAATGGCTTCCCCCAAATGAATATCGGAATCACTACGTTTAT‑CCTCGTGGTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGGGAGTTAAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTg < 1:301141/142‑1 (MQ=255) ccTGATTTTATAAGGTCTGACTCCTATTGAATATCGGATTTA‑GTACTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GTGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTgag < 1:885492/149‑1 (MQ=255) ccTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTgat > 2:1511764/1‑148 (MQ=255) ccTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTgag > 1:447662/1‑149 (MQ=255) cTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTgaga > 1:1022463/1‑149 (MQ=255) cTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTgaga > 1:1273434/1‑149 (MQ=255) tGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCg > 1:1321778/1‑134 (MQ=255) aaaTTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATAACTGAGACaa > 2:137885/1‑149 (MQ=255) aTTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAAc < 2:1489966/149‑1 (MQ=255) aTTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAAc > 2:1347345/1‑149 (MQ=255) tAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAg > 1:1539750/1‑149 (MQ=255) tAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAg < 1:1145975/149‑1 (MQ=255) aaaaGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAAtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatcctt > 1:47527‑M2/1‑30 (MQ=255) aaaaGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGt < 1:432862/149‑1 (MQ=255) aaaaGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGt < 1:948449/149‑1 (MQ=255) aaaaGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGt < 1:1516132/149‑1 (MQ=255) aaGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAAtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttcgcttatattactgaactcatcaagataaaaacactccgactttaa < 2:651502‑M2/149‑122 (MQ=255) aGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGtctc < 2:482314/149‑1 (MQ=255) gTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTGTT‑GGGGTCAGTACAAACTATGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACACACAGTCTCaa > 2:1064509/1‑149 (MQ=255) tCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑TGGGGCAGTACAAACTTTGATTTATTGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAg < 2:301504/149‑1 (MQ=255) tCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAg < 2:1538746/149‑1 (MQ=255) tGACTACAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCTGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGTTGGGTGTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAATCAGTCTAAAGCa > 1:811085/1‑149 (MQ=255) aCTCCAATTGAATATCGGAAtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttcgattatattactgaaatcaacaagataaaaacactcctaatttaatgttccaa < 1:1510217‑M2/149‑130 (MQ=255) tCCAATTGAATATCGGAAtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattcaatatattccgtaacagcatccttcagttcgcttatattactgaactcatcaagataaaaacactccgactttaaggttcaaaag < 2:462431‑M2/149‑132 (MQ=255) tCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCAccc < 2:1327876/149‑1 (MQ=255) tCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCg > 1:1475384/1‑149 (MQ=255) cAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTg > 2:35147/1‑149 (MQ=255) aaTTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTgg < 2:447012/149‑1 (MQ=255) aaTTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTgg < 2:655807/149‑1 (MQ=255) aaTTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGGAAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCGTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTgg < 1:610973/149‑1 (MQ=255) aTTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTAGAAACTTTGATTTTTAGTAAGGTGGGGCTTTTCTCAGTCTGACTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTAACAAGCACCCGTGGc > 2:1003201/1‑149 (MQ=255) gAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTAt < 1:1199820/149‑1 (MQ=255) tCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAg < 1:289802/149‑1 (MQ=255) tCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAg > 1:1217821/1‑149 (MQ=255) cGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGc > 1:1422530/1‑149 (MQ=255) cGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGc < 2:917096/149‑1 (MQ=255) | TTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCA‑GACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTT‑GGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAA > NC_000913/3721876‑3722172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |