| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3884921 | 81 (0.900) | 7 (0.080) | 5/256 | NT | 8.3% | coding (106/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 3884957 | 80 (0.950) | coding (142/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein | |||||
AAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTCATC > NC_000913/3884811‑3885105 | aaaTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTtt > 2:601251‑M2/1‑147 (MQ=255) aTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttgg < 2:1361051‑M2/149‑5 (MQ=255) ctgcccccgccactgtcGCCTGGCTCGCGGGTCCTTATAGCCCTCATTCGGGTATATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagt > 2:978028‑M2/7‑142 (MQ=255) aTGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGTGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagt > 2:350855‑M2/1‑142 (MQ=255) aTGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTCCGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagt > 1:1418826‑M2/1‑142 (MQ=255) gcgcCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGTGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAt < 2:1080616/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAt > 1:1146720/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAt < 2:1222436/149‑1 (MQ=255) gccgccACTGTCGCCTGGCTCGCGCGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCATCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGAAGGTTTGGAGTGATaa > 2:1009002/1‑149 (MQ=255) cgccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATaaaa < 2:1121606/149‑1 (MQ=255) ccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAgg < 1:1591415/149‑1 (MQ=255) ccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGGCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAgg < 2:1480085/149‑1 (MQ=255) cACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGATACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGc > 2:760272/1‑149 (MQ=255) aCTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCTCTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCa < 1:90265/149‑1 (MQ=255) cTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAg < 2:1562023/149‑1 (MQ=255) tCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAgttg < 2:875499/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCTCTCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAgttggt < 2:1108222/149‑1 (MQ=255) gggTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGaaa < 1:60912/149‑1 (MQ=255) 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ccTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAacac > 2:119181/1‑149 (MQ=255) ccTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCCTTACACCCTGGTGGTGACGCTCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAacac > 2:720483/1‑149 (MQ=255) cTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACt > 2:437250/1‑149 (MQ=255) cTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACt > 2:1384761/1‑149 (MQ=255) gTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGCCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTaa < 2:422157/149‑1 (MQ=255) aaGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGAt < 2:226272/149‑1 (MQ=255) aaGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGAt < 1:164912/149‑1 (MQ=255) aaGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGAt < 1:174986/149‑1 (MQ=255) aGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATg < 1:1361051/149‑1 (MQ=255) gCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCGGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATgg > 2:6975/1‑149 (MQ=255) cTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGa > 1:1527156/1‑149 (MQ=255) tACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGCTCCCGTCCCGCCCGGCCCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGAt > 1:816328/1‑149 (MQ=255) ggAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACACTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGAttag > 1:296552/1‑147 (MQ=255) ttGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTcgcaac < 2:957533/149‑1 (MQ=255) gCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACt < 2:822453/127‑1 (MQ=255) gCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACt > 1:822453/1‑127 (MQ=255) aTTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATCCCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCt > 2:1452801/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGGCGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCttt < 2:651230/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTa < 2:1355416/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTa < 2:1342874/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTa < 1:1278644/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTa < 1:470108/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGGTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCCCCCTTTACACACTGGTGGTTACGATCCCGTCCCTCCCGGCCCCTTTGCTCCCAGCGAACACTACCGAGGGATTCGACACGCAAGCTTGTa > 2:252515/1‑149 (MQ=255) aGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTc > 1:411876/1‑149 (MQ=255) aGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTAGACGGTGAAACGCGTAATAAAATGCCACACTTTACACCCTGGTGGTGACGATCACGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACTCAATCTTTAAGta > 2:673515/1‑148 (MQ=255) tttGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTCATc > 2:890721/1‑149 (MQ=255) | AAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTCATC > NC_000913/3884811‑3885105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |