New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4491362 | 84 (0.930) | 3 (0.030) | 3/264 | NT | 3.5% | coding (1164/1320 nt) | idnT | L‑idonate and D‑gluconate transporter |
? | NC_000913 | = 4491399 | 86 (0.990) | coding (1127/1320 nt) | idnT | L‑idonate and D‑gluconate transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AATAGAAATAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCGCGGTGGTAATGGCCGCGACGGTGGCAGAGCCCAGAGCGATACGCAACAGCGCCGCAACAGTCCAGCACATCAATAACGGCGAAAGTGTAGTTCCGGTCATTAAG > NC_000913/4491251‑4491545 | aataGAAATAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCgg < 2:214253/149‑1 (MQ=255) aTAGAAATAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACAAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTAAGTGAGCCGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGg < 2:108089‑M2/149‑2 (MQ=255) tAGAAATAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGga < 2:1249603‑M2/149‑3 (MQ=255) aGAAATAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGgat > 2:1519596‑M2/1‑146 (MQ=255) aGAAATAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGgat < 1:709133‑M2/149‑4 (MQ=255) aaaTAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCCCGCTGCCCGCCCCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGgctcg < 1:1472539‑M2/149‑6 (MQ=255) aaTAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCgg < 2:754213/149‑1 (MQ=255) aaGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGGCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCAt < 1:452434/149‑1 (MQ=255) 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cGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCGCGGTGGTAATGGCCGCGACGGTGGCAGAGCCCAGAGCGATACGCAACAGCGCCGCAACAGTCCAGCACATCAATAACGGCGAAAGTGTAGTTCCGGTCATTAAg > 1:1133003/1‑149 (MQ=255) | AATAGAAATAAGGGTTTCCATCACCGTCCAGGTACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCGCGGTGGTAATGGCCGCGACGGTGGCAGAGCCCAGAGCGATACGCAACAGCGCCGCAACAGTCCAGCACATCAATAACGGCGAAAGTGTAGTTCCGGTCATTAAG > NC_000913/4491251‑4491545 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |