New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4596725 | 75 (0.830) | 6 (0.070) | 6/266 | NT | 7.0% | coding (736/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase |
? | NC_000913 | = 4596761 | 86 (0.980) | coding (772/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase |
CCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGAAAAATCACTGCT > NC_000913/4596614‑4596907 | ccTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGt < 1:654677‑M2/149‑2 (MQ=255) cTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGt < 1:1127883/149‑1 (MQ=255) tGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTc > 2:1421022/1‑149 (MQ=255) 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tttGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGa > 2:230262/1‑149 (MQ=255) ttGAGTCGGCCCGGCGGCACGGGGGTATTTGTCGGCCTGTTTAACGGTGAGTTGCAGTTCACCGAACCGTAATTCCAAAAAAATGAACCGACGAGGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGAt < 1:319535/149‑1 (MQ=255) gATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATgg > 1:883349/1‑149 (MQ=255) aTTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTTAAGGTGAGTTGCAGTTATCGGAACCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGAATTTGCGAAAGTCGGTCGACTGATGGc > 2:223656/1‑149 (MQ=255) aTTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGCTCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGc > 1:1057354/1‑149 (MQ=255) 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tCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCggaag > 1:1379259/1‑149 (MQ=255) tCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCggaag > 2:956089/1‑149 (MQ=255) tCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCgcaag > 1:243994/1‑149 (MQ=255) gcccggcggCACGGGGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTTAGTGGCAGTTCTCGGATCCGGAATTCCATAAAAAACAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCggaag < 1:1448289/146‑1 (MQ=255) ccACGGCGGCACGGTGTTATTGGTCGGCCTGTTTAACGGGGAGGTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCggaag < 1:1170223/148‑1 (MQ=255) gcggcACGGTGGTATTTGCCGCCCTGTTAAACGGTGCGTTGCAGTTCACCCACCCGCAATACCAAAAAAAACAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGaaaa < 1:698814/149‑1 (MQ=255) cggcACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGGGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGaaaaa < 1:156509/149‑1 (MQ=255) cACGGTGGtattcatcgcatgttgattacctgtcgcgtcgatcactttctgcgccagcgaaccaccaaactgcgcccgtagctgcgcgtcaaaatcttcggctgacgggtccagtaaaggtaattccagacgcgttgccacatgttcac > 2:1512989‑M2/1‑8 (MQ=255) cACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGAAAAATCa < 1:956089/149‑1 (MQ=255) cACGGTGGTAATTGTCGGCCTGTTAAAAGGTGAGTTGCAGTGCTCCCATCCGGAATTCCATAAAAAATAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGAAAAATCa < 1:143805/149‑1 (MQ=255) tggtATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGAAAAATCActgct > 2:418769/1‑149 (MQ=255) | CCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGAAAAATCACTGCT > NC_000913/4596614‑4596907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |