| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,012,159 | 0 | A | T | 5.6% | 667.6 / 17.1 | 210 | pseudogene (193/312 nt) | yedN | pseudogene, IpaH/YopM family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (89/109); new base T (7/5); total (96/114) | |||||||||||
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Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CCGAATGGGTGGGTTACCAGTTCCCTGATTTTTTCTATCATGATAAAACCTATCTTATTATAAATCGAGAAATCTTGAAACCAGAGACTATAATCACCCCATTCGAAATATTCTGAGTGCAATAACTTAAATTCTGACAGCATATTAAATAATTTGCTGTCTTCACTAATTGGTGTAAACTTACCATTTCCAAGACAACTGACTAACTCACTTGATAATTCATTTATGATTGCATCATCAGATACTAACTCATGTTGTTTTATCGTAGATTCAGTATTAGATGTGACTTTATTTAAT > NC_000913/2012011‑2012307 | gAATGGGTGGGTTACCAGTTCCCTGATTTTTTCTATCATGATAAAACCTATCTTATTATAAATCGAGAAATCTTGAAACCAGAGACTATAATCACCCCATTCGAAATATTCTGAGTGCAATAACTTAAATTCTGACAGCATATTAaata < 2:1262048/149‑1 (MQ=255) gAATGGGTGGGTTACCAGTTCCCTGATTTTTTCTATCATGATAAAACCTATCTTATTATAAATCGAGAAATCTTGAAACCAGAGACTATAATCACCCCATTCGAAATATTCTGAGTGCAATAACTTAAATTCTGACAGCATATTAaata > 1:1530773/1‑149 (MQ=255) tgtgtgggtTACCAGTTCCCTGATTTTTTCTATCATGATAAAACCTATCTTATTATAAATCGAGAAATCTTGAAACCAGAGACTATAATCACCCCATTCGAAATATTCTGAGTGCAATAACTTAAATTCTGACAGCATATTAAATAAtt < 2:37753/146‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |