| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,493,562 | T→A | 5.6% | intergenic (‑308/+205) | frc ← / ← yfdX | formyl‑CoA transferase, NAD(P)‑binding/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,493,562 | 0 | T | A | 5.6% | 518.9 / 14.0 | 162 | intergenic (‑308/+205) | frc/yfdX | formyl‑CoA transferase, NAD(P)‑binding/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/91); new base A (3/6); total (65/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATA > NC_000913/2493415‑2493709 | tttCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGCAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCttttt > 1:837759/1‑149 (MQ=255)tttCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACTCttttt > 1:52982/1‑149 (MQ=255)tttCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCttttt > 1:1312847/1‑149 (MQ=255)tttATGCATGTTAAGTAGTTAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTAGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCttttt < 2:242538/149‑1 (MQ=255) ttGCATGGTAAGTATTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTaaa < 1:1474409/148‑1 (MQ=255) cTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTaaa < 1:511244/149‑1 (MQ=255) tGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAg < 2:1379835/149‑1 (MQ=255) gCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGc > 1:1105440/1‑149 (MQ=255) cATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCg > 1:174377/1‑149 (MQ=255) tGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTa < 2:1299071/149‑1 (MQ=255) tGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTa > 1:359673/1‑149 (MQ=255) tGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTAAAAAGCGTa < 1:452558/149‑1 (MQ=255) ggTAATTAGTGATGACGAAAATAAGAATATTATAAATATTGATTCGTGGGTATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCTCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTAAAAAGCGTaa < 1:800901/149‑2 (MQ=255) ggTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTAAAAAGCGTaa < 1:736499/149‑2 (MQ=255) gTAAGTAGTGAGGACGAAAAGATGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTAAAAAGCGTaat < 2:1128577/149‑3 (MQ=255) gTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTAcc < 2:321882/149‑1 (MQ=255) aaGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCAt > 1:323177/1‑149 (MQ=255) gtagtGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATaa < 2:1403158/149‑1 (MQ=255) agtGAGGACGAAAAGAATAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATTATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATaaaa < 1:1109425/149‑1 (MQ=255) aGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATTATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacata > 1:1338943/1‑149 (MQ=255) tgACGAAAATAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGATTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataa < 1:950849/148‑1 (MQ=255) ggACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataa < 1:743539/149‑1 (MQ=255) gAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAATAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAacataacata > 2:841868/1‑149 (MQ=255) gAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTTAAGCGTACCATAAAacataacata > 2:903426/1‑149 (MQ=255) gAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAacataacata > 2:876218/1‑149 (MQ=255) aaaaGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAAcataacataa < 1:1581562/149‑1 (MQ=255) aagaagAATATGATAAATATTGATTAGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCTACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACataata < 2:805393/149‑1 (MQ=255) aaTATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGAt > 2:653303/1‑149 (MQ=255) tatGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGAttt > 1:514574/1‑149 (MQ=255) tatGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGAttt < 2:63713/149‑1 (MQ=255) atGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtg > 1:1377035/1‑149 (MQ=255) tGATAAATATTGATTCTTTGAAATCTGAGAGATTCGAGAAATTTGTGATGTTATTATTACAACTTTAATAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAATGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgt < 1:96927/149‑1 (MQ=255) tGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgt < 2:31576/149‑1 (MQ=255) taTAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgtg < 1:1242467/148‑1 (MQ=255) gATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgtg < 2:920875/149‑1 (MQ=255) gATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgtg < 2:92252/149‑1 (MQ=255) aTAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGTTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGtga < 1:322319/149‑1 (MQ=255) aTAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCATTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACAAAATAAATGATTTGtga > 1:116331/1‑149 (MQ=255) ttaaTATTTATTCGTGGTAATCATAGAGAGTCGCGAGATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGtgat < 2:424743/147‑1 (MQ=255) tAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGtgat < 1:1357980/149‑1 (MQ=255) tAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGAATTGtgat > 1:1071909/1‑149 (MQ=255) tatTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTTTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGaca > 1:15402/1‑149 (MQ=255) tatTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAATAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATTAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGaca > 1:1231044/1‑149 (MQ=255) aTTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGa < 2:474987/149‑1 (MQ=255) aggTAATCAGAGAGAGTCGCGAAATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGattatt < 2:1522611/148‑1 (MQ=255) gTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGc < 2:682720/149‑1 (MQ=255) agagagagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTa > 1:922498/1‑149 (MQ=255) gagagagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTAc < 1:694931/149‑1 (MQ=255) agagagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATTAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACt > 1:276148/1‑149 (MQ=255) agagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACttt < 2:1312847/149‑1 (MQ=255) agagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACttt < 2:174377/149‑1 (MQ=255) gTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAg < 1:98245/149‑1 (MQ=255) gcgACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGaa < 2:600647/149‑1 (MQ=255) aTTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATaa > 1:673177/1‑149 (MQ=255) tgtgATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAAt < 2:717720/149‑1 (MQ=255) gtgATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGAATTACAAGCCAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATg < 2:1007356/149‑1 (MQ=255) tgATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACAAGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGc > 2:1177721/1‑149 (MQ=255) gATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCg > 1:1433658/1‑149 (MQ=255) aTGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGa < 1:257454/149‑1 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGt > 2:1246195/1‑149 (MQ=255) ttATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACCCGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGtt > 2:1052079/1‑149 (MQ=255) ttCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTtat < 1:1024286/149‑1 (MQ=255) ttCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTtat < 1:391756/149‑1 (MQ=255) tCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTtata < 1:876218/149‑1 (MQ=255) cTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGTTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAg < 2:1370251/149‑1 (MQ=255) attACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACACGGAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAg < 2:119188/148‑1 (MQ=255) ttACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGc > 1:1056239/1‑149 (MQ=255) aaCTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATATGTGATGACACGGGATTATTGCGTTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCAcag > 1:297468/1‑147 (MQ=255) aCTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACcgc < 2:1473104/149‑1 (MQ=255) tGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGa > 1:174873/1‑149 (MQ=255) tGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGa > 1:902028/1‑149 (MQ=255) tAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAgc > 2:1094514/1‑149 (MQ=255) agCGCCGGTGATTAACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGAGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCaa < 1:463100/149‑1 (MQ=255) agCGCAGGTGATTTACAAGCAAGGGTTTTATTACGCTTTTTAAAGCGTACGATAAAAGATAACATAATAAATGATTTGTGATTACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATCTAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCaa < 2:875926/149‑1 (MQ=255) cGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTTTAGCACCGCGAGCGCCAaataat < 2:61835/149‑1 (MQ=255) cGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAaataat > 2:653627/1‑149 (MQ=255) cGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAaataat < 2:52982/149‑1 (MQ=255) ggTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAAtt > 2:808289/1‑149 (MQ=255) ggTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAACGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAAtt > 1:590397/1‑149 (MQ=255) tGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAAtttt < 2:1104319/149‑1 (MQ=255) gATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTa < 2:1338943/149‑1 (MQ=255) gATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTa > 1:617263/1‑149 (MQ=255) ttACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATTATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGa < 2:973218/149‑1 (MQ=255) caagcaagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACca > 2:502032/1‑149 (MQ=255) caagcaagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACca < 1:486617/149‑1 (MQ=255) gcaagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACaa > 1:1485321/1‑149 (MQ=255) caagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAAc < 2:94787/149‑1 (MQ=255) caagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAAc < 2:1231044/149‑1 (MQ=255) gTATGATTACGCTTTTTATAGCGTACCATAAAACATAACATAATAACTGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTc < 2:300834/149‑1 (MQ=255) gTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTc > 1:756153/1‑149 (MQ=255) gTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTc > 2:406696/1‑149 (MQ=255) tGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATTCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTa > 2:1548807/1‑149 (MQ=255) tggtACGCTTTAAAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTAt > 1:1128260/4‑149 (MQ=255) ttACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATtg < 2:1306169/149‑1 (MQ=255) cGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTgg > 2:1210681/1‑149 (MQ=255) cGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTgg < 1:1373590/149‑1 (MQ=255) gCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACAACACCATGTCGTATTGTggg > 2:246794/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACAACAAACTTTCGTATTGTGGt > 2:1419066/1‑149 (MQ=255) cTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTc < 1:212619/149‑1 (MQ=255) tttttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCa > 1:1144088/1‑149 (MQ=255) | TTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATA > NC_000913/2493415‑2493709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |