| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,758,927 | A→G | 5.1% | intergenic (+71/‑58) | alpA → / → yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,758,927 | 0 | A | G | 5.1% | 495.5 / 10.3 | 157 | intergenic (+71/‑58) | alpA/yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/80); new base G (5/3); total (74/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
ATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCT > NC_000913/2758779‑2759074 | tCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCgg < 2:15805/149‑1 (MQ=255) ggCGTGAAATCTGGCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑aa < 1:85555/149‑1 (MQ=255) gCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaat < 1:990279/149‑3 (MQ=255) gTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAg < 1:1017967/149‑1 (MQ=255) gTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAg > 1:1348830/1‑149 (MQ=255) tGATATATGTCGGATGGATTGAGGCCGACATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATATGAGGGTGTTACATGAATTAATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTATTAGCGG‑AATAGc > 2:752664/1‑149 (MQ=255) tGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGc < 2:973012/149‑1 (MQ=255) gAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagca < 2:403764/149‑7 (MQ=255) aaaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCa < 2:219750/149‑1 (MQ=255) aaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCat < 1:1198428/149‑1 (MQ=255) gatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTaa > 2:572038/1‑149 (MQ=255) atggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTaaa > 1:483159/1‑149 (MQ=255) gatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACaa > 1:1219739/1‑149 (MQ=255) gatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACaa > 1:1131204/1‑149 (MQ=255) gAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTc > 2:819868/1‑149 (MQ=255) aGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt > 2:1372375/1‑149 (MQ=255) aGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt > 2:141553/1‑149 (MQ=255) gCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCtta > 2:128970/1‑149 (MQ=255) ccGAGATTGATGATTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa < 1:746522/149‑1 (MQ=255) ccGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa > 1:648820/1‑149 (MQ=255) ccGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTCTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa < 2:340110/149‑1 (MQ=255) cGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaat > 1:1326428/1‑149 (MQ=255) cGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaat < 1:407711/149‑1 (MQ=255) gagaTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatt < 2:595072/149‑1 (MQ=255) agaTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt < 2:886785/149‑1 (MQ=255) tttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGTGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa < 2:302928/148‑1 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaat < 2:450191/149‑1 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaat < 1:540338/149‑1 (MQ=255) gatgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATttaatta > 2:236438/1‑149 (MQ=255) tgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTaaa < 1:1131629/149‑1 (MQ=255) taGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAt < 1:1421259/148‑1 (MQ=255) gaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCTG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAt > 1:1005661/1‑149 (MQ=255) gaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAt > 1:640298/1‑149 (MQ=255) gaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATCTAATTAAAt < 2:382916/149‑1 (MQ=255) gaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCATGCTATTTCCGCCATAAATAGCGG‑AATAGCAATATTTTCTAAACAATTTCTTAATTTaaataaat > 1:949749/1‑149 (MQ=255) gTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa > 2:676215/1‑149 (MQ=255) ggTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga < 2:628821/149‑1 (MQ=255) ggTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga < 2:1403534/149‑1 (MQ=255) gTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAagag < 2:1163822/149‑1 (MQ=255) aTCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGGTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCa > 1:406338/1‑149 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCAt < 2:1593971/149‑1 (MQ=255) acaACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTAATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTg > 2:888592/1‑149 (MQ=255) cGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATg > 2:513943/1‑149 (MQ=255) tAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 1:1501299/1‑149 (MQ=255) tAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 1:298696/1‑149 (MQ=255) tAAACTTATTTGAGGGTGTTACAAGAATTCATACTCAATTTCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa < 1:1199268/149‑1 (MQ=255) aaaCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt < 2:741079/149‑1 (MQ=255) aaCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATg > 2:577634/1‑149 (MQ=255) aaCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATg < 2:92764/149‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgt > 1:1374446/1‑149 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgt > 2:614356/1‑149 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgt < 2:736660/149‑1 (MQ=255) aTTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAAAAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGttcgt > 2:304826/1‑149 (MQ=255) ttGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTcc > 1:188836/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCtt > 2:233176/1‑149 (MQ=255) aGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCttt < 2:1383125/149‑1 (MQ=255) gggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTc > 2:1048314/1‑149 (MQ=255) ggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc < 1:560801/149‑1 (MQ=255) gtgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATAttt < 2:726107/86‑1 (MQ=255) gtgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATAttt > 1:726107/1‑86 (MQ=255) gtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg < 2:483159/149‑1 (MQ=255) gtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg > 1:1250333/1‑149 (MQ=255) ttACATGACTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATATCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATTTTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTGCAATGGGCGGCCTTTCCCTGt < 2:1591189/149‑1 (MQ=255) ttACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGt > 2:1409858/1‑149 (MQ=255) ttACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGt < 1:1372375/149‑1 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGa > 2:286110/1‑149 (MQ=255) aTGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt > 2:522266/1‑149 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATg < 1:459739/149‑1 (MQ=255) cATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTc < 1:982251/149‑1 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCt > 2:1464944/1‑149 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaaaa < 1:1258821/149‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATGTTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAAt < 2:1251937/149‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCGTGTAGATGCAGTTCCTaaatt > 2:790224/1‑147 (MQ=255) gCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATc < 1:596064/149‑1 (MQ=255) cTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCa < 2:1358795/149‑1 (MQ=255) cATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATATCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGaa < 2:1327909/149‑1 (MQ=255) ggAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCa > 2:1353833/1‑149 (MQ=255) gAGTGTTAACATCCTGCTATTTCCGCAATTAATATAGG‑AATAGGCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTTATTAAGAGGCATTTCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGGATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCaa < 2:1147902/149‑1 (MQ=255) aGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAt > 1:823911/1‑149 (MQ=255) tgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAttt > 1:472012/1‑149 (MQ=255) tgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAttt > 2:1538344/1‑149 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTAt > 2:381031/1‑149 (MQ=255) aCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑ATTAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGaa > 1:135729/1‑149 (MQ=255) aCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGTCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGaa < 1:184743/149‑1 (MQ=255) aCATCCTGCTATTTCCGACATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGaa < 1:236438/149‑1 (MQ=255) cATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAg < 2:1501299/149‑1 (MQ=255) aTCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGt < 1:233176/149‑1 (MQ=255) atggctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa > 1:144340/8‑149 (MQ=255) tggctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa > 2:391461/7‑149 (MQ=255) tGCTATTTCCGCCATTTATAGCGG‑AATAGCCATATTAGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATAAGGAATGCAATTAATGATGTGGaa > 2:1469688/1‑149 (MQ=255) gctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACa > 2:862167/5‑149 (MQ=255) tattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGc > 1:1494040/3‑149 (MQ=255) gCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGAATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGc > 2:478988/1‑149 (MQ=255) ccATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGTTCGTCCTTTACCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGAAATTTATGAAGTGCAACAGCATACGCa > 1:814454/1‑149 (MQ=255) ccATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAtt < 1:959759/126‑1 (MQ=255) ccATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAtt > 2:959759/1‑126 (MQ=255) ccATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCa < 2:188836/149‑1 (MQ=255) cATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAg < 1:528627/149‑1 (MQ=255) aTAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGcccc > 1:564525/1‑149 (MQ=255) tAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCt < 1:1409858/149‑1 (MQ=255) | ATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCT > NC_000913/2758779‑2759074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |