| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,995,556 | 0 | C | A | 6.5% | 597.8 / 21.6 | 193 | pseudogene (205/447 nt) | ygeN | pseudogene, orgB family, part of T3SS PAI ETT2 remnant |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (86/94); new base A (7/6); total (93/100) | |||||||||||
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Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
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cATTCCATATTGATTTGTCGACAAAACATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAActtct > 2:1330788/1‑149 (MQ=255) | CAGATTTCGTTAACCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAACTTCT > NC_000913/2995408‑2995704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |