| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,995,558 | T→G | 6.2% | pseudogene (203/447 nt) | ygeN ← | pseudogene, orgB family, part of T3SS PAI ETT2 remnant |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,995,558 | 0 | T | G | 6.2% | 571.5 / 22.6 | 189 | pseudogene (203/447 nt) | ygeN | pseudogene, orgB family, part of T3SS PAI ETT2 remnant |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (84/93); new base G (6/6); total (90/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
GATTTCGTTAACCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAACTTCT > NC_000913/2995410‑2995704 | aTTTCGTTAACCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACCAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACAtt < 1:161538/149‑1 (MQ=255) aTTTCGTTAACCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAACATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACAtt > 2:1160711/1‑149 (MQ=255) ttAACCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCatat > 2:261837/1‑149 (MQ=255) tAACCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATAtt < 2:476268/149‑1 (MQ=255) aCCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGAATGTCCATAttac < 2:298480/149‑3 (MQ=255) aCCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGAATGTCCATAttac < 2:379335/149‑3 (MQ=255) ccTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATCTTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGAt < 2:850474/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGAt > 1:1543442/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCAATATTGAt > 1:1091048/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTAACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTAAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGAt < 1:1031909/149‑1 (MQ=255) ttGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGAATGTCCATAttacatt < 1:67490/149‑6 (MQ=255) gagaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACaaa > 1:314050/1‑149 (MQ=255) gagaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACaaa > 1:304427/1‑149 (MQ=255) gagaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACaaa > 1:528533/1‑149 (MQ=255) agaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACaaaa > 1:873414/1‑149 (MQ=255) agaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACaaaa < 1:112535/149‑1 (MQ=255) gaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAat < 2:819838/149‑1 (MQ=255) aaCAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATAATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAatat > 1:954081/1‑149 (MQ=255) aCAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATg < 2:110289/149‑1 (MQ=255) aCAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATg > 2:1208746/1‑149 (MQ=255) cAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGa < 2:960752/149‑1 (MQ=255) cAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGa < 2:396404/149‑1 (MQ=255) cAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGa < 2:804747/149‑1 (MQ=255) cAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCAATATTGATTTGTAGAAAAAATATGa > 2:1069989/1‑149 (MQ=255) ttattaATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACAt > 1:155491/1‑115 (MQ=255) ttattaATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACAt < 2:155491/115‑1 (MQ=255) ttattaATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTAc > 1:822246/1‑149 (MQ=255) ttattaATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTAc > 1:1252528/1‑149 (MQ=255) ttaattaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTc > 2:667037/1‑149 (MQ=255) aattaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCaa > 2:581193/1‑149 (MQ=255) aattaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCaa < 1:1171968/149‑1 (MQ=255) aattaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCaa < 2:1316258/149‑1 (MQ=255) attaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAACACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAag < 2:1459313/149‑1 (MQ=255) ttaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCGATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAaga < 1:1470092/149‑1 (MQ=255) ttaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAaga > 1:562322/1‑149 (MQ=255) aaTATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGAc > 1:1414352/1‑149 (MQ=255) tatTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACtt < 1:621278/149‑1 (MQ=255) cTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCtt < 2:659546/149‑1 (MQ=255) cTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCtt > 1:1453456/1‑149 (MQ=255) tCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCttt < 2:463159/149‑1 (MQ=255) acaATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGa < 1:1427473/149‑1 (MQ=255) caATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGaa < 1:1239926/149‑1 (MQ=255) aaTTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTAAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGaaa > 2:885279/1‑149 (MQ=255) aTTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAAc > 2:1535586/1‑149 (MQ=255) ttATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACt > 1:852017/1‑149 (MQ=255) ccACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggta < 1:425250/149‑1 (MQ=255) ccACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggta < 2:925674/149‑1 (MQ=255) ccACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggta < 2:895030/149‑1 (MQ=255) cacaAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtag < 1:523902/149‑1 (MQ=255) acaAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtagg > 2:1369584/1‑149 (MQ=255) caAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtaggt > 1:1044381/1‑149 (MQ=255) aaaaTTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtaggt < 1:1113892/148‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCTGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATg < 1:43222/149‑1 (MQ=255) cTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGga < 2:119139/149‑1 (MQ=255) gACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGAttt > 2:621798/1‑149 (MQ=255) tAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTTGTAGGTATATGGAGATTTACa > 1:1541206/1‑149 (MQ=255) tAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACa > 2:1057050/1‑149 (MQ=255) tAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACa > 1:148825/1‑149 (MQ=255) aaaTTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAg < 2:592138/149‑1 (MQ=255) aaTTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGTTAGGTATATGGAGATTTACatt > 1:1138422/1‑147 (MQ=255) ccAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGa < 1:272390/148‑1 (MQ=255) aaTAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGata < 1:1369584/149‑1 (MQ=255) aaTAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGata > 2:569142/1‑149 (MQ=255) aTAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGatat < 2:1312712/149‑1 (MQ=255) tAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATAtt > 1:1058866/1‑149 (MQ=255) aTTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGAt < 1:604826/149‑1 (MQ=255) ttGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATg < 2:277454/149‑1 (MQ=255) ttGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATCCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATg < 2:193322/149‑1 (MQ=255) cGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAt < 2:1414063/149‑1 (MQ=255) ggTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAtt < 1:1208746/149‑1 (MQ=255) ggTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAtt < 1:1160711/149‑1 (MQ=255) ggTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACCCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAtt > 2:962483/1‑149 (MQ=255) ttAAAAAACACAAAACTCTTATCATCATTAAATGTAATATTGACATTCCATATTGTTTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAttt < 1:476071/148‑1 (MQ=255) tAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAAAGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAAATCGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAtttt > 1:19291/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTg < 2:1131323/149‑1 (MQ=255) aaaCACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCt > 1:961762/1‑127 (MQ=255) aaaCACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTa < 2:338510/149‑1 (MQ=255) caAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACACaa > 2:746164/1‑149 (MQ=255) aaaaCGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAAc > 1:1196642/1‑149 (MQ=255) atcatGAAATTTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACATAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTTGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTTATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAAttt < 1:99046/149‑1 (MQ=255) atcatGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAAttt < 1:1278933/149‑1 (MQ=255) atcatGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAAttt > 1:732107/1‑149 (MQ=255) tcatGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAAtttt < 2:1432087/149‑1 (MQ=255) catGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAAttttt > 2:1599215/1‑148 (MQ=255) atGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGa > 1:1287643/1‑149 (MQ=255) tGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGAt < 1:894754/149‑1 (MQ=255) gAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTTATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATa > 2:248286/1‑149 (MQ=255) aaTGTTATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATTTGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaa < 2:1570411/149‑1 (MQ=255) aaTGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaa > 1:174271/1‑149 (MQ=255) aTGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaaa < 2:1453456/149‑1 (MQ=255) aTGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAAATGGTAGGTATATGGAGATTTACACGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACACAACTATCAAAAATTTTTATaaaa > 2:98821/1‑149 (MQ=255) tGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaaaa > 1:629174/1‑149 (MQ=255) atcaaTATGGAATGTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaaaa > 2:1308048/4‑149 (MQ=255) tcaaTATGGAATGTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAAc > 1:695778/3‑149 (MQ=255) aaTATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACAt < 2:1137521/149‑1 (MQ=255) aaTATGGAATGTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGGAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTCAGATTGATGGTAATTTTGTTACGCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACaa > 2:1486312/1‑148 (MQ=255) atatGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATc < 2:314050/149‑1 (MQ=255) tGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAAc < 1:370061/149‑1 (MQ=255) tGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAAc < 2:346357/149‑1 (MQ=255) tGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACACAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAAc > 2:1243156/1‑149 (MQ=255) | GATTTCGTTAACCTTGTCAGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAACTTCT > NC_000913/2995410‑2995704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |