| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 397,273 | C→T | 5.9% | A212V (GCC→GTC) | sbmA → | peptide antibiotic transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 397,273 | 0 | C | T | 5.9% | 320.1 / 6.7 | 101 | A212V (GCC→GTC) | sbmA | peptide antibiotic transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/52); new base T (3/3); total (46/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TGTTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTG > NC_000913/397126‑397418 | tgtTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGcc < 1:736539/149‑1 (MQ=255)tgtTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGcc < 2:1478016/149‑1 (MQ=255) cTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGa < 2:584782/149‑1 (MQ=255) gCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGt < 2:1441704/149‑1 (MQ=255) tACAGCGATGAACGAAAAATACATGGCTAACTGGCAACAACTGCTTCATATCGAAGGGGCCGATCAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTGCAACGCTGGAGAATATGGTCGTCAGTTTTATCAACGTCATGATGGCTTTGa < 2:44042/149‑1 (MQ=255) cAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATc < 2:447359/149‑1 (MQ=255) cAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATc > 2:1200174/1‑149 (MQ=255) cAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATc > 2:1200173/1‑149 (MQ=255) cGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGATGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCACCGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCCTGACGTTGATCGcc > 1:87989/1‑149 (MQ=255) cGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGTCATGATGGCGTTGAtaaaa < 2:143656/149‑5 (MQ=255) gATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGTCATGATGGCGTTGAtaaaac < 2:1536049/149‑6 (MQ=255) tGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTc < 1:283730/149‑1 (MQ=255) tGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTc < 2:504081/149‑1 (MQ=255) tGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTc > 2:1496894/1‑149 (MQ=255) aCGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGCAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTg > 2:877514/1‑149 (MQ=255) cGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATAGCCTTCCTGc > 1:1526982/1‑149 (MQ=255) gAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGcc > 2:820787/1‑149 (MQ=255) aaTATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCg > 2:909573/1‑149 (MQ=255) aaTATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCg < 1:1155521/149‑1 (MQ=255) tatTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCggg > 2:551961/1‑148 (MQ=255) tatTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCggg > 2:557675/1‑148 (MQ=255) tACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCt < 2:317599/149‑1 (MQ=255) aCATGGCGTACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTg < 2:1512899/149‑1 (MQ=255) aCATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTg < 2:680066/149‑1 (MQ=255) aCATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTg < 1:820787/149‑1 (MQ=255) ggCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTaa > 2:1005710/1‑149 (MQ=255) ggCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTaa > 2:622397/1‑149 (MQ=255) ttgCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCtctc > 2:396458/3‑149 (MQ=255) tGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCtctc > 2:699106/1‑149 (MQ=255) tGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCtctc > 2:116094/1‑149 (MQ=255) gCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCcg > 2:1420251/1‑149 (MQ=255) aacaacTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGCATATGGGCGTCAGTTTTATCACCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACCCTCTCcgcc > 1:120976/1‑148 (MQ=255) acaacTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCgcgc > 2:820481/1‑149 (MQ=255) cGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGcc > 1:144085/1‑149 (MQ=255) atatCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGTATATGGTCGTCAGTTTTATCAACTCCATCATGAGGTTGATATCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAg < 2:120691/149‑1 (MQ=255) atatCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAg < 2:496232/149‑1 (MQ=255) atatCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAg > 2:887005/1‑149 (MQ=255) atCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCt > 1:139328/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTg > 2:673268/1‑149 (MQ=255) aaGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCg > 2:144702/1‑149 (MQ=255) aGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGa < 1:909573/149‑1 (MQ=255) aGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGa < 2:1107887/149‑1 (MQ=255) gggCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGAtt < 1:1005710/149‑1 (MQ=255) gggCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCGCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGAtt < 1:166702/149‑1 (MQ=255) gCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTAt < 2:560625/149‑1 (MQ=255) cGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGGCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTTGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCg < 1:288638/149‑1 (MQ=255) cacaGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCggg < 2:1352773/149‑1 (MQ=255) cacaGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCggg < 2:1398447/149‑1 (MQ=255) cacaGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCggg < 1:1055831/149‑1 (MQ=255) gCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGcaca > 2:50115/1‑149 (MQ=255) tgtgCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTc < 1:98311/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCGGGAGAATATGGGCGGCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGGTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTa < 1:779616/149‑1 (MQ=255) ggAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACTCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATg < 2:321941/149‑1 (MQ=255) aGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTc < 1:1200173/149‑1 (MQ=255) aGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGGGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATgggc < 1:1200174/149‑3 (MQ=255) acacCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTg > 2:331673/1‑149 (MQ=255) cacCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTgg < 2:1151877/149‑1 (MQ=255) acCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGt > 1:1139277/1‑149 (MQ=255) acCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGt < 2:139328/149‑1 (MQ=255) acCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGt < 2:791661/149‑1 (MQ=255) cctGCGTCTGGCTTCCACGGTGGAGAATATCGGCGTCAGTATTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGGGCTTGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGa < 2:1036904/147‑1 (MQ=255) cATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGa < 1:50115/149‑1 (MQ=255) cATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGGGCTGGTAACGCGCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACAATCCGTATGGGCTGGTGa < 2:1032885/149‑1 (MQ=255) tGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGAtt > 1:1041755/1‑149 (MQ=255) ttttGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCg < 1:877514/149‑1 (MQ=255) cAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTc > 2:431636/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCt < 1:116094/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTg > 1:1350425/1‑149 (MQ=255) cGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCTACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTgg < 1:1496894/149‑1 (MQ=255) cTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTc < 1:1420251/149‑1 (MQ=255) tGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCg > 1:762270/1‑149 (MQ=255) gagaATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCt > 1:1417568/1‑149 (MQ=255) gagaATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCt > 2:468829/1‑149 (MQ=255) gaATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGa > 2:690725/1‑149 (MQ=255) tGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATgggg > 1:143285/1‑149 (MQ=255) gggCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGa < 2:1404603/149‑1 (MQ=255) gggCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTACTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATggggc > 1:856901/1‑148 (MQ=255) cGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCg < 1:747054/149‑1 (MQ=255) cGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGCTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCg < 1:1420602/149‑1 (MQ=255) gTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCgg > 1:163279/1‑149 (MQ=255) tCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCCATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGa > 1:956884/1‑149 (MQ=255) ttttATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTAt > 1:1478919/1‑100 (MQ=255) ttttATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTAt < 2:1478919/100‑1 (MQ=255) ttttATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGc < 1:144702/149‑1 (MQ=255) ttttATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGc > 1:638681/1‑149 (MQ=255) tttATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCt < 2:1579865/149‑1 (MQ=255) tttATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCt < 1:887005/149‑1 (MQ=255) tttATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCt < 2:1041755/149‑1 (MQ=255) tATCACCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCCTGTGCCGGAGCTGCCGAGTCTCGGGCACATTCCGTCTGGGCTGGTGATTGCCGCAATCGCCTGGTCGCTTATTGGGACCGGATTGCTgg < 1:1563990/149‑1 (MQ=255) tATCACCGCCAGCATGACGTGGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGCCTGGTCGCTGAGGGGGACCGGATTGCTgg < 1:1558066/149‑1 (MQ=255) tATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTgg < 2:144085/149‑1 (MQ=255) aTCAACGTCATGATGGCGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGc > 2:733414/1‑149 (MQ=255) aTCAACGTCATGATGGCGTTGATCGCCTTCCTGACGGTGCTGGTAAAGCTATCGGCGCATGTGCCGGAGATGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGGTGGc > 2:312176/1‑149 (MQ=255) aaCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGt < 2:1520060/149‑1 (MQ=255) aaCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGt < 2:829797/149‑1 (MQ=255) aCGTCATGATGGCGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTg > 1:653147/1‑149 (MQ=255) aCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGt < 1:222787/115‑1 (MQ=255) aCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGt > 2:222787/1‑115 (MQ=255) aCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTg > 2:654877/1‑149 (MQ=255) aCGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGACGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTg > 2:1331085/1‑149 (MQ=255) | TGTTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTG > NC_000913/397126‑397418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |