| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,451,404 | 0 | T | G | 6.4% | 282.6 / 9.8 | 94 | D94A (GAC→GCC) | rplW | 50S ribosomal subunit protein L23 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/45); new base G (4/2); total (47/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.27e-01 | |||||||||||
TTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCACAG > NC_000913/3451256‑3451548 | ttttttCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGt > 1:498931/1‑149 (MQ=255) tttCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCa > 1:1080350/1‑149 (MQ=255) aGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTc > 1:233383/1‑149 (MQ=255) aGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGGGCAGCTCAGGGTTAACCAATTTAACTACGTGGCGACGCCCCGGAGATGTCGGGTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTTCTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTc > 2:828238/1‑149 (MQ=255) gCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGAAAACCACTTTAACTACCTGGCGACGACCCGGAGAAGTCGGTTTACATTCAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGACGCCAACGAAGTCCAGATTCt > 2:1135496/1‑149 (MQ=255) aaCGGAGCAAATGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTgg < 2:943449/149‑1 (MQ=255) aCGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGc < 1:925299/149‑1 (MQ=255) gAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTACTCCGACTTACACAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCctt > 2:929016/1‑149 (MQ=255) cAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGGCCAGAATCTGGActtcgt < 2:1428237/149‑3 (MQ=255) aaaaGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCTCCGCCAACGAAGTCCAGAATCTGGCCTTCttt > 1:1001858/1‑149 (MQ=255) aaaaGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCttt > 1:499191/1‑149 (MQ=255) aaaGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGCTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGGCCAGAATCTGGACTTCgttg < 1:1290511/149‑2 (MQ=255) aGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAg < 1:1497484/149‑1 (MQ=255) 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tCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCaaa > 2:352051/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAAc < 1:606303/149‑1 (MQ=255) ctgaaagAAGGCCAGAATCTGGACTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCt > 1:1403678/7‑149 (MQ=255) ccAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTg > 1:256327/1‑149 (MQ=255) ccAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTg < 2:749553/149‑1 (MQ=255) ccAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTg > 2:422585/1‑149 (MQ=255) cAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGc > 2:700629/1‑149 (MQ=255) aaCGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGCCGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGca > 1:877704/1‑149 (MQ=255) aagAAGGCCAGAATCTGGACTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGcac > 1:1584940/3‑149 (MQ=255) aagAAGGCCAGAATCTGGACTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGcac > 2:343361/3‑149 (MQ=255) agAAGGCCAGAATCTGGACTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGcaca > 1:1414324/2‑149 (MQ=255) gAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCAcag < 2:1517761/149‑1 (MQ=255) | TTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACGAAGTCCAGATTCTGGCCTTCTTTCAGGGTGACGTAAGCTTTTTTCCAGTCGCTACGACGACCGATACGCTGTCCGTGACGTTTAACTTTCCCTTTAACTACCAGGGTGTTAACGACTTCGACTTCGACTTCAAACAGTTTCTGCACAG > NC_000913/3451256‑3451548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |