Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 721,011 | 0 | T | A | 5.2% | 402.2 / 7.5 | 131 | intergenic (+171/+45) | ybfK/kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/73); new base A (3/4); total (54/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.76e-01 |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |