New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4523090 | 407 (1.150) | 5 (0.010) | 4/264 | NT | 1.3% | coding (1005/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | NC_000913 | = 4523100 | 394 (1.170) | coding (995/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 477 total aligned reads displayed.
GTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTT > NC_000913/4522952‑4523249 | gTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTc > 2:2068984‑M2/1‑149 (MQ=255) gTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTc < 2:2906742‑M2/150‑2 (MQ=255) tCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTca < 2:3756692‑M2/150‑3 (MQ=255) tCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTca < 2:3289026‑M2/150‑3 (MQ=255) ttCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTcatc < 2:4011039‑M2/150‑5 (MQ=255) aTGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTcatcaac < 1:5622844‑M2/150‑8 (MQ=255) aTGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTcatcaac > 1:1371638‑M2/1‑143 (MQ=255) tGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACg > 1:5301142/1‑150 (MQ=255) gCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACgg < 2:1893480/150‑1 (MQ=255) gCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACgg > 2:1521437/1‑150 (MQ=255) aacaaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTc > 1:3284991/1‑150 (MQ=255) aacaaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACAGGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGATGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGAACGCTCACCAGACGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCACTCATCAACgggc > 1:4159501/1‑148 (MQ=255) caaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCgg < 2:1325830/150‑1 (MQ=255) caaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCgg < 2:1762998/150‑1 (MQ=255) caaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCgg < 2:1431346/150‑1 (MQ=255) aTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGa > 1:2934556/1‑150 (MQ=255) ccGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGata > 1:5812498/1‑150 (MQ=255) cGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGatat < 2:3080969/150‑1 (MQ=255) 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gCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGt > 2:3922486/1‑150 (MQ=255) aaCATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGa < 2:5384232/150‑1 (MQ=255) cATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGc < 1:755328/150‑1 (MQ=255) aTGACTTCCGGCACACCACCTGCCCTAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCa < 1:4815810/150‑1 (MQ=255) aTGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCa > 1:1146754/1‑150 (MQ=255) aTGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCa > 1:2792718/1‑150 (MQ=255) ttCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGc < 2:5726089/150‑1 (MQ=255) tCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGcc < 1:5923515/150‑1 (MQ=255) ccGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCg < 2:4305956/150‑1 (MQ=255) ggCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCggg > 1:5020212/1‑150 (MQ=255) 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cGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTa > 2:3806622/1‑150 (MQ=255) gCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTAt > 2:3617274/1‑150 (MQ=255) gCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTAt > 1:5659728/1‑150 (MQ=255) gCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTAt < 1:1024862/150‑1 (MQ=255) tCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCg > 2:706158/1‑150 (MQ=255) aCCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCt < 2:2934406/150‑1 (MQ=255) gacGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTAt > 1:3916803/3‑150 (MQ=255) tCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATc < 1:980306/150‑1 (MQ=255) gggCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGt > 2:3583420/1‑150 (MQ=255) gggCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGt < 1:273693/150‑1 (MQ=255) 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ttgATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCgg < 2:4226357/150‑1 (MQ=255) aTGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGggtg < 2:4642262/150‑1 (MQ=255) gCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGggtggt > 1:814466/1‑150 (MQ=255) cGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGgtggtg > 2:5001790/1‑150 (MQ=255) gATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGAt < 1:2231589/150‑1 (MQ=255) gATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGAt < 1:1959338/150‑1 (MQ=255) gTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCttt < 1:1850064/150‑1 (MQ=255) tcatcaACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGATTTTCCCGGGTGGTGATGCCtttt < 2:1146754/150‑1 (MQ=255) tcatcaACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCtttt > 2:5398995/1‑150 (MQ=255) tcatcaACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCtttt < 2:3148698/150‑1 (MQ=255) tcatcaACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCtttt < 2:5931223/150‑1 (MQ=255) tcatcaACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCtttt < 2:3483261/150‑1 (MQ=255) | GTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTT > NC_000913/4522952‑4523249 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |