| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 708,020 | C→A | 6.3% | intergenic (+263/‑314) | glnS → / → chiP | glutamyl‑tRNA synthetase/chitoporin, uptake of chitosugars |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 708,020 | 0 | C | A | 6.3% | 1006.5 / 5.9 | 319 | intergenic (+263/‑314) | glnS/chiP | glutamyl‑tRNA synthetase/chitoporin, uptake of chitosugars |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (115/169); new base A (31/3); total (147/172) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
CTCTGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCGGTTGCT > NC_000913/707871‑708169 | ctctGCAATATATTGCGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGAAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATc < 1:145952/150‑1 (MQ=255) tctGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATcc > 1:991601/1‑150 (MQ=255) tGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCat > 2:6000617/1‑150 (MQ=255) gCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCata < 2:1368760/150‑1 (MQ=255) cAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCataa > 2:2020396/1‑150 (MQ=255) ttGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAaaataaat < 2:3073659/150‑1 (MQ=255) aGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTa < 2:3423294/150‑1 (MQ=255) gTTTGCGTGCTGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTaa < 1:5320118/150‑1 (MQ=255) ttGCGTGCTTTTGGAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTaaaa < 1:293886/150‑1 (MQ=255) tGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTTTTCTGCGTTTCTTCGCGAAATAATTCCGCATCGCAAATTATCCAAAAAATAAAATTAAAAAAACa > 1:4302379/1‑150 (MQ=38) ttttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTGATAGCGCATTAAATACCCTTAGCAAATTATACATAAAAAAAATTTAAAATAaaaaaa > 1:1017315/1‑150 (MQ=37) ttttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTCGCGAATTAATTACGCTTCGCAATTTATCCATAAAAAAAATTTAAAATAACaaaa > 1:4854053/1‑150 (MQ=255) ttttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTAGCGAATTAATTACGCGTCGCAATTTATCCAAAAAAAAAATTTAAAATAACaaaa > 1:3016331/1‑150 (MQ=38) ttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGCATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAAATTAAAATAACAAAACa > 1:3334633/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAaaaaaaaa > 1:1323678/1‑148 (MQ=255) tGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGAAAAAAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACAt < 1:4498553/150‑1 (MQ=255) gaaGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGAGTTCAGCGGCGAGTTTTAGTCTTTTATTAGCCAAAAAAAAAACCTACACAATTTATACAAAAAAAAAAATTaaaaaaaaaaaaaaaa > 1:4708049/3‑146 (MQ=16) tAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATaa < 2:2358138/150‑1 (MQ=255) tAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTACGCGTCGCAAATTATACAAAAAAAAAATTTaaaaaaaaaaaaaaaaa > 1:25123/1‑145 (MQ=38) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAAtt > 2:4988873/1‑150 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAAAATAAtt > 1:3518451/1‑150 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATta > 2:4940465/1‑150 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTAGCGAATTAATTACGCTTAGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATta > 2:1701465/1‑150 (MQ=255) ggATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATtaaat < 1:4032031/150‑1 (MQ=255) ggATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTGGCGAAATAAATACGCGTAGCAAATTAACCAAAAAATAAAATTAAAAAAAAAAAACAAAAAtaaaa > 1:538708/1‑149 (MQ=255) aaGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATaaaa < 2:935868/150‑1 (MQ=255) aaGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATaaaa < 1:1515929/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAAt < 2:770829/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTACGCTTCGCAATTTATCCAAAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAAt > 2:217142/1‑150 (MQ=255) ggCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTATGGTTTTATTAGCGAAATAATTACGCTTAGCAATTTATACATAAAAAAAATATAAAATAAAAAAAAAAAAATaaaaaaaaag > 1:5922160/1‑148 (MQ=255) ggCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTGTTCTGCTTTTCGTCGCGCATTAATTCCCCATCGCAAATTAACCAAAAAAAAAAATTAAAAAAACAAAACAAAAGAaaaaaaaaag > 1:4172824/1‑148 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTAGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAAATTAAAAAAACAAAACATAAATAAATAAAAttt > 2:3856476/1‑148 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTTTTGTGCGTTTATTCGCGAATTAATTACGCGTCGCAAATTATACAAAAAAAAAATTTAAAAAAACAAAAAAAAAATaaaaaaaaatt > 1:5624392/1‑147 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAAATAAATCCGCGTCGCAAAGTATCCATAAAATAAAGTTAAAATAAAAAAACaaaaaaaaaaaaaaatg > 1:4778844/1‑147 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTTTTATGCTTTTATTAGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAAAAAAATTAAATAAAAttt > 2:1554641/1‑148 (MQ=255) gTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAAAAAAATTAAAATAACAAAAAATAAATAAATAAAATTTaa > 2:1292491/1‑150 (MQ=255) gTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCGTCGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAAATAAATAAAATGTaa > 2:1121278/1‑150 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAAc > 2:2530706/1‑150 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAAAAAATTTAAAATAACAAAACATAAATAAATAAAATTTaaa > 2:5805929/1‑149 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAAcc > 2:4438436/1‑150 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTATGCTTTTCTTCGCGAATTAAATACGCTTGGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAAAATAATTAAATAAAATTTaaac > 1:3523622/1‑148 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAAAATAATTAAATAAAATTTAACCGc > 2:5975262/1‑150 (MQ=255) cgccgcATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCACAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCt < 2:5089615/150‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTATGCTATTATTAGCCAAATAATAACGCTTCGCAAAATATACAAAAAAAAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAATAAAAATTAAACGCtt > 2:736345/1‑150 (MQ=255) gccgcATCCGGCAAGAAACAGCAAACAAACCAACACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCtt < 2:4546598/150‑1 (MQ=255) aTCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATc < 2:268585/150‑1 (MQ=255) cGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTATGCTTTTATTCGCGAAATAATTACGCTTAGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAATTAACCCCTTTCaaattt > 2:1172874/1‑145 (MQ=255) ggCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTCGCGAATTAATTCCGCGTCGCAATTTTTACATAAAATAAAATTAAAATAACAAAACAAAAATAAATAAAATATAACCGCTTTCATATTGc > 2:4070141/1‑150 (MQ=255) ggCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGGTTTGTGGTTTTGTTGGCGAATTAATTACGCGTCGCAAATTATGCATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAAAAAAAATAAATAAAATTTTAACGCGTTGATATTgg > 1:5813203/1‑149 (MQ=255) gCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCt < 2:1447800/150‑1 (MQ=255) gCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCt < 2:5274479/150‑1 (MQ=255) aaGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTTCTTTTATTAGCGAATTAATTCCCCTTAGCAAATTATACATAAAATAAAATTAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAATAAAATTTAAACGCATTAATCTTTCTgg > 2:2164177/1‑150 (MQ=255) gAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGaa < 1:1870581/150‑1 (MQ=255) aaaCAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAACACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAAt < 2:1770241/150‑1 (MQ=255) aaaCAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAAt > 2:3498086/1‑150 (MQ=255) aaCAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAAtt < 2:1913926/150‑1 (MQ=255) aGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAACACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCa < 2:5212830/150‑1 (MQ=255) tCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCGTTTCTTCGCCAATTAATTCCGCTTCGCAAATTATCCAAAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCGTTTAt > 2:4706015/1‑150 (MQ=255) ccaCGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAAGTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTAttctt < 1:2623275/148‑1 (MQ=255) aCGCCGCGTTCAGCGGCGTATTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATtcttct < 1:2691959/150‑1 (MQ=255) ccgcGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAACTCCGCTTCGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATTTAACCGCGTTCATCTTTCTGGAATTTAACGCTTTTATTCTTCTGCa > 2:1850434/1‑150 (MQ=255) ccgcGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTAGCGAAATAATTCCGCATCGCAAATTATAAAAAAAATAAATTTAAAATAACAAAAAATAAATAAATAAAATTTAACCCCTTTCATAATGCTGGAATTTCAAGCGTTTATTCTTCTgaa > 2:5572710/1‑148 (MQ=255) cgcgTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCaa < 2:242224/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCttt < 1:2356287/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCttt < 2:5495540/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTc < 2:650156/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTc < 2:5419006/150‑1 (MQ=255) cggcgTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCaa > 2:5855119/1‑150 (MQ=255) gcgTTTTTTCTGCTTTTCGTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAAcc < 2:3735533/150‑1 (MQ=255) cgTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTAATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTAAACCg > 2:5668693/1‑150 (MQ=255) ttttttCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTACATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCa < 1:1840769/150‑1 (MQ=255) ttttCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCaaa < 1:2236529/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACt > 2:5010955/1‑150 (MQ=255) cTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTa < 1:3273339/150‑1 (MQ=255) ttttCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGcc > 2:4900924/1‑150 (MQ=255) tttCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCt > 1:712515/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCtt < 1:853409/150‑1 (MQ=255) tcttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTg < 2:425610/150‑1 (MQ=255) cttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGt < 2:3362243/150‑1 (MQ=255) cttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGt < 1:4211953/150‑1 (MQ=255) gAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACaaa > 1:5157504/1‑150 (MQ=255) aattaattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACaaaa > 2:3334074/1‑150 (MQ=255) attaattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACaaaaa < 2:4317319/150‑1 (MQ=255) ttaattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAat < 1:5010955/150‑1 (MQ=255) taattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatc < 1:3092400/150‑1 (MQ=255) aattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatca < 2:1627512/150‑1 (MQ=255) aattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatca < 2:2069409/150‑1 (MQ=255) attCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatcat > 1:779015/1‑150 (MQ=255) ttCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatcatc < 1:5975262/150‑1 (MQ=255) tCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAAtcatca < 2:5157504/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCaa > 1:3741978/1‑150 (MQ=255) cgcgacGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAACTAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCaaa < 1:16586/145‑1 (MQ=255) cGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCaaa > 2:2311973/1‑150 (MQ=255) cGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCaaa > 1:1381130/1‑150 (MQ=255) tCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAatat < 2:2831510/150‑1 (MQ=255) cAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATAtgtg < 1:33691/150‑1 (MQ=255) tttATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTCGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCgg < 1:519337/150‑1 (MQ=255) tATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCGGtt < 2:4854053/150‑1 (MQ=255) tCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCGGTTGc < 1:1172874/150‑1 (MQ=255) ccATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCGGTTGCt < 2:2966848/150‑1 (MQ=255) | CTCTGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCGGTTGCT > NC_000913/707871‑708169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |