| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,885,422 | A→T | 6.4% | E253V (GAA→GTA) | yeaW → | putative YeaWX dioxygenase alpha subunit; 2Fe‑2S cluster |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,885,422 | 0 | A | T | 6.4% | 1123.4 / 8.4 | 385 | E253V (GAA→GTA) | yeaW | putative YeaWX dioxygenase alpha subunit; 2Fe‑2S cluster |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (178/175); new base T (27/3); total (207/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
CGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGACGGTCATTTATGAATTCCCGGTGGATTCTGAAACTACCCTGCAAAACTACGATATTTACTTCACCA > NC_000913/1885273‑1885571 | agATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGa < 2:3937747/149‑1 (MQ=255) aTAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAag > 1:1103008/1‑150 (MQ=255) aTAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAag > 1:53470/1‑150 (MQ=255) aaCTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAagag < 1:3849871/150‑1 (MQ=255) aCTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAgg < 2:834156/150‑1 (MQ=255) cTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAggg > 2:6951391/1‑150 (MQ=255) tATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGt > 1:3509010/1‑150 (MQ=255) tATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTGTAAATTTGAAGAGGGt > 2:2743966/1‑150 (MQ=255) tcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTTAAGAGGGTACgg > 1:3636441/1‑150 (MQ=255) gAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTTAAGAGGGTACGGAt > 1:6362502/1‑150 (MQ=255) aGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTTAAGAGGGTACGGATg > 1:2473918/1‑150 (MQ=255) tGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCg < 1:5771399/150‑1 (MQ=255) gCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCgg < 2:6868382/150‑1 (MQ=255) tATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCa > 2:3274112/1‑150 (MQ=255) tATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCa > 1:1528059/1‑150 (MQ=255) tATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCa > 1:5420294/1‑150 (MQ=255) tATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCa > 1:2847203/1‑150 (MQ=255) tATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGGACGGATGCGGCa > 2:2601290/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |