| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,314,683 | T→A | 7.5% | intergenic (+25/+35) | ompW → / ← yciE | outer membrane protein W/putative rubrerythrin/ferritin‑like metal‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,314,683 | 0 | T | A | 7.5% | 333.4 / 12.6 | 124 | intergenic (+25/+35) | ompW/yciE | outer membrane protein W/putative rubrerythrin/ferritin‑like metal‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/43); new base A (8/2); total (79/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGC > NC_000913/1314535‑1314831 | cATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAatt > 1:1034119/1‑149 (MQ=255) aTGTCAGTGGGGTCCATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCGGGCCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAatat < 2:2038058/150‑1 (MQ=255) gTCAGTGTGGTACTTGGATATCGATACATACGCAATTTATATGCTGGGCGGTGGACAGCAAGACGATAGCGTAATCCTCGATCCTTGGGTGTTTATGTTCTCTGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATAc < 2:2002286/150‑1 (MQ=255) gTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATAc > 1:1294918/1‑150 (MQ=255) cAGTGTGGTACATGGATATCGCTACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGCTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGATTTTAATTCCGCAAAAAAACGACCCCGTAAAAAACgg > 1:107399/1‑150 (MQ=255) cAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACgg > 2:601558/1‑150 (MQ=255) aGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTATTATACggg > 2:798209/1‑150 (MQ=255) aGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACggg > 2:1249173/1‑150 (MQ=255) ttgtgGTACATGGAAATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGTCGTTGCACAGCAACAAGATAGCGTACGCCTCGATCCGGGGGTGTTATTGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACgggg < 1:1590934/149‑1 (MQ=255) gtgtGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACgggg < 1:1095054/150‑1 (MQ=255) tgtgGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGt < 1:1202048/150‑1 (MQ=255) ggTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCaa > 2:1938327/1‑150 (MQ=255) ggTACATGGATATCGAAACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTACGCACAAAAACGACCCAGTAATATACGGGGTCaa > 1:1837233/1‑150 (MQ=255) gTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGCCCCCGTAATATACGGGGTCAAt > 2:341689/1‑150 (MQ=255) ctACATGGATATCGACACCACCGCCAATTAAAAGCTGGGCGGTGAACAGCAACACCAAAGCGTACGGCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTATATTACGGGGTcgtt < 2:387400/149‑4 (MQ=255) aCATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATaa > 1:2102160/1‑150 (MQ=255) cATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGTCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAg > 2:1685372/1‑150 (MQ=255) aTGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTATATTACGGGGTcgtttttg < 1:1229980/150‑8 (MQ=255) aatCGATACCACCGCAAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCAGTGGGTGGCTATGTTCTCAGCAGGATATCG‑TTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATgg < 2:76489/149‑1 (MQ=255) atCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGTGCGGTGCACATCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTGTAAGAAGGATATCTTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATgg < 2:1739190/150‑1 (MQ=255) atCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATgg < 1:695854/150‑1 (MQ=255) tCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGt > 2:843429/1‑150 (MQ=255) gATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGAGATCGTTTTTAAATCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACTGGGTCTATAATGACATGGtat > 1:2056363/1‑150 (MQ=255) aTACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGtata > 2:393616/1‑150 (MQ=255) ccaccGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAg > 1:941470/1‑150 (MQ=255) ccaccGCCAATTATAAGATGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTAAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAg > 2:315541/1‑150 (MQ=255) accGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTCCGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAggg < 2:96871/150‑1 (MQ=255) ccGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGt > 1:511457/1‑150 (MQ=255) ccGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTAAATTCCTCACAAAAACGACCCCGTAATATACTCGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGt > 1:1154155/1‑150 (MQ=255) ccAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCATCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAATGACATGGTATAAAGGGtttt > 2:296066/1‑150 (MQ=255) aTTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTattatt > 2:616813/1‑150 (MQ=255) aaGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATttcttg > 2:395219/1‑149 (MQ=255) tGGGCGGTGCACAGAAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACATAAACGACCCCGTAATATACGTGGTGAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCtt < 1:47369/150‑1 (MQ=255) gggCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGACAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTc > 2:2079594/1‑150 (MQ=255) cGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGCTCCGTGGGTGTTTATGTTCGCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAAAGACCCCGTAATATACGGGGGCAATAAGGACATGGTAAAAAGGGGATTATTTCTTCGATTCTAc > 1:833030/1‑150 (MQ=255) gCACAGCAACACGATAGCGGACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCa < 1:185394/150‑1 (MQ=255) cacaGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCAt > 2:2102424/1‑150 (MQ=255) acaGCAACACGAAAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGGTTATGTGCTCAGCAGGATATCGTTTTTATTTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTCCGCTTCTACGCCATc < 1:125167/150‑1 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATTCGGGGTCAATAATGACATGGTTTAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCa > 2:141487/1‑150 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATcg > 2:236282/1‑149 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCa < 1:1738012/150‑1 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAAGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCa > 2:338192/1‑150 (MQ=255) aGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAg < 2:1541847/150‑1 (MQ=255) cAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGACAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCATCTACGCCATAAGtt > 1:1180372/1‑150 (MQ=255) acGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCag < 1:721721/150‑1 (MQ=255) aTAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGc < 2:189810/150‑1 (MQ=255) gTACGCCTCGATGCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAAtt < 2:1092542/150‑1 (MQ=255) tACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTa > 2:1503323/1‑150 (MQ=255) tACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTa > 2:1155544/1‑150 (MQ=255) gCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATTTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaaa > 1:1840968/1‑150 (MQ=255) gCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGGAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTAGTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaaa > 2:1960436/1‑150 (MQ=255) ccTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaaaa > 1:2101880/1‑150 (MQ=255) gATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtc < 2:68415/150‑1 (MQ=255) gATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtc < 1:328547/150‑1 (MQ=255) tgtTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGAGAATTAAAAATTTCACAGTTGttt > 2:2065983/1‑150 (MQ=255) ttATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCg > 1:2019461/1‑150 (MQ=255) ttATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCg > 2:1608470/1‑150 (MQ=255) ttATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCg > 1:1861124/1‑150 (MQ=255) ttATGTTCTCAGAAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGGATCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCACTTGTTTGCg < 2:1885667/150‑1 (MQ=255) tttgttgtCATCAGTATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGTGTCAATTAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTTAAAATTTCTCAGTTGTTTGCgg < 2:983925/148‑1 (MQ=255) tGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTACGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGAGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGATTTTTGCGGaa > 1:1308799/1‑150 (MQ=255) gTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGATCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAat > 2:45988/1‑150 (MQ=255) gTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGaaa > 2:798829/1‑149 (MQ=255) cagcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCt < 2:1206490/150‑1 (MQ=255) cagcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCt > 1:1472138/1‑150 (MQ=255) cagcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGAGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGTGTATTATTTCTTCGCTTCTAAGCCATCAGTTTCAGAGAGAATTAAAAATTTCTAATTTGTTTGCGAAATATTCt > 2:2050242/1‑150 (MQ=255) tgtagGTTATTGTTTTTATTTCCGCAATTAAACGACCCCGTATTATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATATAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTTCGCCATCAGTTTCAGAGGGATTTAAAAATTTATCAGTTGTTTGCGGAATATTCTg < 2:1180372/147‑1 (MQ=255) agGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACTGGGTCAATAATGAAATGGTATAAAGAGTATTATTTCTTCGCTTATACCCCAACAGTTTCAGAGCGAAAAAAAAATTTCTAATTTGTTAGCGGAATATTCTGAAt > 1:112954/1‑150 (MQ=255) agGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAAt > 1:332906/1‑150 (MQ=255) ggATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTATGAATc > 2:1211615/1‑150 (MQ=255) atatCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAg < 1:689454/150‑1 (MQ=255) atCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGcc > 2:532074/1‑150 (MQ=255) atCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGcc < 2:1619059/150‑1 (MQ=255) atCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGcc < 1:315541/150‑1 (MQ=255) gTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGAATTATTTCTTCGCTTCAACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGt > 2:544471/1‑150 (MQ=255) gTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCACGTAATATACGGGGTCAATAAGTACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTACGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCTGAATATTCTGAATCAGCCatt > 1:94611/1‑148 (MQ=255) aaTTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTGAGGTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCa > 1:260586/1‑150 (MQ=255) aaTTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCa < 1:1249173/150‑1 (MQ=255) aTTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCAt > 1:507027/1‑150 (MQ=255) aTTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCAt > 2:967873/1‑150 (MQ=255) gCACAAAAACGACCCCTTAATATACGTGGTAAATAAGGACATGGTATAAAGGGAATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAACTTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCt < 1:44252/150‑1 (MQ=255) acaAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCttt > 1:152928/1‑150 (MQ=255) ccttattgACCCCGTATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTGGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCtttt > 1:1814747/8‑150 (MQ=255) caAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCtttt < 1:1938327/150‑1 (MQ=255) caAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACAAGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTACTCAGTTGTTTGAGGAATATTCTTAATCAGCCAGTCATCCATTTGCtttt > 1:391471/1‑150 (MQ=255) cttattgACCCCGTATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTc > 1:866070/7‑150 (MQ=255) ttattgACCCCGTATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTcc > 1:63142/6‑150 (MQ=255) aaaaCGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTCCGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTcc > 2:1912127/1‑150 (MQ=255) aaaaCGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTcc > 1:1274951/1‑150 (MQ=255) tattgACCCCGTATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCt > 2:497000/5‑150 (MQ=255) tgACCCCGTATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCAt > 1:1677113/2‑150 (MQ=255) tgACCCCGTATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTATCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGACGGCCATTTGCTTTTCCTCAt > 2:1412778/2‑150 (MQ=255) ccccGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTa < 2:283175/150‑1 (MQ=255) ccccGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTa < 2:1067373/150‑1 (MQ=255) cccGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAATAATTTCTCAGTTGGTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTaa < 1:1041323/150‑1 (MQ=255) ccGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTaaa < 1:616813/150‑1 (MQ=255) ccGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTaaa > 1:744613/1‑150 (MQ=255) cGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAAATTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCAGTTGCTTTTCCTCATTTaaaa < 2:1111581/150‑1 (MQ=255) tAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATc < 2:1740338/150‑1 (MQ=255) atatACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGc < 1:541155/150‑1 (MQ=255) | CATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGC > NC_000913/1314535‑1314831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |