Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,405,389 | 0 | G | A | 6.4% | 473.7 / 11.7 | 155 | intergenic (‑317/+314) | nuoA/lrhA | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A/transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (77/68); new base A (6/4); total (83/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
AACAAAAGTTTCTTCACATTAGTTTACATAATATCAACACCATTAGCATTTAATGCCCTTTCACCCCAGATCCTTGACGACTCCAGGATAATTAGATGTTGTTGAATCGTGTCCGTTGTGAAGCAATGGAAAAAATACGGGTCTATTTTGACAGGAATTTGTGTCGATTCCTCCCCCCAAAAGAGAGTATTTTCTTGATCTGTGACACGCTTTTGTCATTCCATAACAAAAACGCAGCAACAAATTTACGTATTTTTTAACATCATTGTAGCAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTG > NC_000913/2405240‑2405538 | aaCAAAAGTTTCTTCACATTAGTTTACATAATATCAACACCATTAGCATTTAATGCCCTTTCACCCCAGATCCTTGACGACTCCAGGATAATTAGATGTTGTTGAATCGTGTCCGTTGTGAAGCAATGGAAAAAATACGGGTCTATTTTg > 2:940838/1‑150 (MQ=255) aCAAAAGTTTCTTCACATTAGTTTACATAATATCAACACCATTAGCATTTAATGCCCTTTCACCCCAGATCCTTGACGACTCCAGGATAATTAGATGTTGTTGAATCGTGTCCGTTGTGAAGCAATGGAAAAAATACGGGTCTATTTTGa > 2:504914/1‑150 (MQ=255) cAAAAGTTTCTTCACATTAGTTTACATAATATCAACACCATTAGCATTTAATGCCCTTTCACCCCAGATCCTTGACGACTCCAGGATAATTAGATGTTGTTGAATCGTGTCCGTTGTGAAGCAATGGAAAAAATACGGGTCTATTTTGAc > 2:210473/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |