New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1165696 = | NA (NA) | 9 (0.020) | 4/256 | NT | NA | intergenic (+11/‑389) | ycfP/ndh | putative UPF0227 family esterase/respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase |
? | NC_000913 | 1165728 = | NA (NA) | intergenic (+43/‑357) | ycfP/ndh | putative UPF0227 family esterase/respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase |
Only 100 of 467 total aligned reads displayed.
TGAAGCGCTTAACAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCATACACCCCTCACTCTATAT > NC_000913/1165547‑1165845 | tgtttattatttgagcgaatttgtgagagtgatatagagtgaggggtgtatgcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagc < 1:1162324‑M1/1‑1 (MQ=255) tttattatttgagcgaatttgtgagagtgatatagagtgaggggtgtatgcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagcgc < 1:6760751‑M1/3‑1 (MQ=255) tttattatttgagcgaatttgtgagagtgatatagagtgaggggtgtatgcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagcgc < 1:2404880‑M1/3‑1 (MQ=255) tttattatttgagcgaatttgtgagagtgatatagagtgaggggtgtatgcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagcgc < 2:6889692‑M1/3‑1 (MQ=255) aaGCGCTTAACAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGc > 1:4015737/1‑150 (MQ=255) aaGCGCTTAACAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGc > 1:6385392/1‑150 (MQ=255) ttattatttgagcgaatttgtgagagtgatatagagtgaggggtgtatgcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagCGCa < 1:5456449‑M1/4‑1 (MQ=255) cgcTTAACAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATc > 1:775346/1‑150 (MQ=255) ttatttgagcgaatgtgtgagagtgatatagagtgaggggtgtatgcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagCGCATCa > 2:5790510‑M1/144‑150 (MQ=255) gcTTAACAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCa > 2:2928408/1‑150 (MQ=255) atttgagcgaatttgtgagagtgatatagagggaggggggccggcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagCGCATCAgg > 1:6679724‑M1/142‑150 (MQ=255) tttgagcgaatttgtgagagtgatatagagtgaggggtgtatgcagggcgttcggtaggcctgataagaagcgcatcaggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagCGCATCAGGt > 1:7557540‑M1/141‑150 (MQ=255) tAACAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGt < 1:4301814/150‑1 (MQ=255) aCAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTaa < 1:5593380/150‑1 (MQ=255) cagccagcGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAAc < 2:155716/150‑1 (MQ=255) agccagcGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAAcc > 2:5223964/1‑150 (MQ=255) agccagcGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAAcc > 1:6511102/1‑150 (MQ=255) ccagcGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCtt > 2:4891901/1‑150 (MQ=255) 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agcGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGc < 2:4568843/150‑1 (MQ=255) cATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTAc < 2:6265639/150‑1 (MQ=255) cATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTAc < 1:2631152/150‑1 (MQ=255) aTCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTAcc > 1:2040410/1‑150 (MQ=255) tCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCt < 2:7499641/150‑1 (MQ=255) 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aGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTa > 2:4175888/1‑150 (MQ=255) gcgcATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTAt > 2:4155597/1‑150 (MQ=255) cgcATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATc < 2:4468974/150‑1 (MQ=255) gcATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCa < 1:5328271/150‑1 (MQ=255) cATTCAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAg < 2:1170733/150‑1 (MQ=255) cATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAg < 2:3813490/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAgg > 2:1750788/1‑150 (MQ=255) aGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTAc < 1:8077702/150‑1 (MQ=255) cGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCg < 2:7973505/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGc < 1:7221561/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGcc > 2:7875460/1‑150 (MQ=255) aaaCCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGcc < 2:3898849/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGcc < 1:7024470/150‑1 (MQ=255) aCCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCt < 2:3713071/150‑1 (MQ=255) aCCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCACTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCt < 1:2882729/150‑1 (MQ=255) aCCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTCGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCt < 2:7265296/150‑1 (MQ=255) cccTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTg < 2:3028095/150‑1 (MQ=255) ggTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCATaca < 1:1743234/150‑1 (MQ=255) gTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCATacac < 1:4191459/150‑1 (MQ=255) gTAAATCCCCTCCTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATACTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCAGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCacacac < 2:1113172/150‑1 (MQ=255) tGCCCTCGTCGCATCCGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGACGTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCGTCTGATCCGGCCTACCGCACGCCCTGCATACACCCCTc > 2:7431440/1‑150 (MQ=255) ccTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCt > 2:6655320/1‑134 (MQ=255) ccTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCATACACCCCTCAct > 2:8228022/1‑150 (MQ=255) cTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTCATGCGCTCCGAAGTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACCCCGCATCCGACACTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCATATCAGGCCTACCCAACGCCCAGCATACACCCCTCAcac > 2:4333606/1‑148 (MQ=255) gtcgCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCATACACCCCTCActctct > 2:1930926/1‑148 (MQ=255) CGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCTTCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGTACGCCCTGCATACACCCCTCACTCTatat > 2:7558108‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGAAGCGCTTAACAGCCAGCGGACATCTGAAGAGTTGCATCATTATTACGAGATTGTCTGGGACGAAGAGCAGACGCACAAATTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCATACACCCCTCACTCTATAT > NC_000913/1165547‑1165845 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |