| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4584195 = | 599 (1.230) | 4 (0.010) | 4/264 | NT | 0.73% | coding (2567/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme |
| ? | NC_000913 | 4584232 = | 512 (1.110) | coding (2530/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 689 total aligned reads displayed.
TACGCTGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAACACGATATTA > NC_000913/4584046‑4584344 | tACGCTGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATgg < 2:36869/150‑1 (MQ=255) gctgacgaccggcgtcgatattccgtcgatctgtaatatcgtgttcctgcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactgtgt < 2:1415203‑M1/4‑1 (MQ=255) gctgacgaccggcgtcgatattccgtcgatatgtaatatcgtgttcctgcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactgtgt > 2:822353‑M1/147‑150 (MQ=255) tGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCg > 2:8144689/1‑150 (MQ=255) ggAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGa < 1:3358250/150‑1 (MQ=255) gacgaccggcgtcgatattccgtcgatctgtaatatcgtgttcctgcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGa > 1:5421073‑M1/144‑150 (MQ=255) gacgaccggcgtcgatattccgtcgatctgtaatatcgtgttcctgcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGa < 2:1009755‑M1/7‑1 (MQ=255) gAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGAc > 2:5024221/1‑150 (MQ=255) ttCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGctc > 2:6953267/1‑150 (MQ=255) cggcgtcgatattccgtcgatctgtaatatcgtgttcctgcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGctct > 1:5698167‑M1/138‑150 (MQ=255) cGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCtctc < 2:643786/150‑1 (MQ=255) cGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCtctc > 1:4039028/1‑150 (MQ=255) cGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCtctc < 1:3928274/150‑1 (MQ=255) ccaccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCGCCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCa < 2:3537269/150‑1 (MQ=255) ccaccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCa > 1:3805361/1‑150 (MQ=255) caccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAg > 2:1159306/1‑150 (MQ=255) ccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCg > 1:2268072/1‑150 (MQ=255) caGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGt > 1:4655178/1‑150 (MQ=255) caGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGt > 1:7020572/1‑150 (MQ=255) gttgttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGc > 2:4507171/1‑150 (MQ=255) gttgttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGc > 2:4619421/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa < 1:448598/150‑1 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa > 1:1884484/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa < 1:5146124/150‑1 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCACCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa < 1:7717189/150‑1 (MQ=255) cATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGa > 2:1301500/1‑150 (MQ=255) cATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGa < 2:3918751/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGCTCGGCAAAACTGTGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGat < 2:6757237/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGat < 1:2012749/150‑1 (MQ=255) gCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATc > 1:4847230/1‑150 (MQ=255) gCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATc > 1:5001682/1‑150 (MQ=255) tgtgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGa < 2:6524577/150‑1 (MQ=255) tgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGaca > 2:2469786/1‑150 (MQ=255) 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ttCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTg > 2:72127/1‑150 (MQ=255) ggCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTa < 1:1750140/150‑1 (MQ=255) gcgcACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTAc > 1:4220262/1‑150 (MQ=255) gcgcACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTAc < 2:1741818/150‑1 (MQ=255) accaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTa > 2:5286423/1‑150 (MQ=255) ccaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTAc < 2:7352194/150‑1 (MQ=255) ccaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTAAAAAAACTAAAAGATGGTTTTATTCACCTCCGGGCAAAATCGCGTGTCGCGGCCTTTCATCTGTTCTTACAGAATTAGGCTGCGTACTTTAc > 1:5982783/1‑150 (MQ=255) caccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACg < 2:571486/150‑1 (MQ=255) caccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACg > 1:3568100/1‑150 (MQ=255) accaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGc > 2:6365483/1‑150 (MQ=255) accaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGc > 2:3819294/1‑150 (MQ=255) caccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAg < 1:6868707/150‑1 (MQ=255) caccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTGTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAg > 1:3666011/1‑150 (MQ=255) accGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAgg > 1:7508911/1‑150 (MQ=255) gACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAaca < 2:1974985/150‑1 (MQ=255) gACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAaca > 1:2830988/1‑150 (MQ=255) aCGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAacac < 1:6289497/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAACACGata < 2:1651678/150‑1 (MQ=255) tGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAACACGatat > 1:4383313/1‑150 (MQ=255) tGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAACACGatat > 1:1008447/1‑150 (MQ=255) tGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGAAGAAATCGACACAGTCAAAAATCATAAAGCAGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGAGCGTGTCGCGGCCTATCATCTGTTATTACAGAAAGCCGCTGCGAACTTTACGCAGGAACACGatat > 1:1118776/1‑150 (MQ=255) GTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAACACGATATTa > 2:273345‑M1/1‑150 (MQ=255) | TACGCTGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCTGCGTACTTTACGCAGGAACACGATATTA > NC_000913/4584046‑4584344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |