New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2817942 | 377 (0.770) | 37 (0.090) | 23/238 | NT | 11.0% | intergenic (‑82/+117) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
? | NC_000913 | 2818492 = | 279 (0.670) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg |
Only 100 of 495 total aligned reads displayed.
GCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCACC > NC_000913/2818343‑2818640 | gCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTc < 1:6436567/150‑1 (MQ=255) GGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCt > 1:259187‑M1/1‑150 (MQ=255) GGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGa > 2:5444333‑M1/1‑150 (MQ=255) 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tCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAGTCGAACCTCCGACCACTCg > 2:7131993/1‑150 (MQ=255) cTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCAGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCATCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTc > 1:1878734/1‑150 (MQ=255) ttGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCg < 1:3338245/150‑1 (MQ=255) gCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCTGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTa < 2:3447906/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGACTATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCg > 2:7269163/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCg < 1:2458982/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCg > 2:3947303/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCTTCGGGCCGTGGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTCGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCg > 2:6317536/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGa < 2:6810122/150‑1 (MQ=255) cccTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTa > 2:6967022/1‑150 (MQ=255) 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taacGTTGCTTTAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATc > 2:2228325/4‑150 (MQ=255) gCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATcc > 2:5595836/1‑150 (MQ=255) gTTGCTTTAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGc > 1:5541859/1‑150 (MQ=255) gTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGc > 2:7635107/1‑150 (MQ=255) gTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATGCGAACCTCCGACCGCTCGGTGCGTAGCCGAGTCCTCTATCCAGc > 1:4744920/1‑150 (MQ=255) ttGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCt < 1:6948013/150‑1 (MQ=255) cTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAg > 2:529417/1‑150 (MQ=255) tAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGc > 2:4856262/1‑150 (MQ=255) tAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGc > 1:5209717/1‑150 (MQ=255) tAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGc > 1:6320904/1‑150 (MQ=255) 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1:6215219‑M2/27‑150 (MQ=255) gAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGa > 1:1647896/1‑150 (MQ=255) aaTATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAg > 1:5758595/1‑150 (MQ=255) atatGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAgc < 1:1290956/150‑1 (MQ=255) agatggtgcatccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGa > 2:5747171‑M2/23‑125 (MQ=255) tatGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAgcg > 1:5702154/1‑150 (MQ=255) ggtgcatccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCt > 2:1575143‑M2/19‑150 (MQ=255) gtgcatccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTa > 1:4523084‑M2/18‑42 (MQ=255) gtgcatccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGa > 2:4477105‑M2/18‑47 (MQ=255) gtgcatccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCt < 1:459037‑M2/45‑1 (MQ=255) tgcatccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTc < 1:7030461‑M2/134‑1 (MQ=255) gcatccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCa < 2:3858960‑M2/135‑1 (MQ=255) atccgggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGc > 1:6055321‑M2/14‑150 (MQ=255) gggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCgg > 1:4387157‑M2/10‑84 (MQ=255) ggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGa > 2:2646724‑M2/9‑38 (MQ=255) ggaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCtctc < 1:2228325‑M2/142‑1 (MQ=255) gaggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCg < 1:2653949‑M2/143‑1 (MQ=255) ggattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGc < 1:1110516‑M2/145‑1 (MQ=255) gattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCa < 1:5988491‑M2/42‑1 (MQ=255) gattCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGa < 1:345474‑M2/47‑1 (MQ=255) attCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGTGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCa < 2:2472382‑M2/147‑1 (MQ=255) ttCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCAc < 2:3055240‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCACC > NC_000913/2818343‑2818640 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |