New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2817942 | 192 (0.770) | 9 (0.040) | 6/238 | NT | 5.2% | intergenic (‑82/+117) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
? | NC_000913 | 2818492 = | 166 (0.780) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
GAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACC > NC_000913/2817796‑2818090 | gaggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTCCTGCTGATATTGATACCGCTACGAAAGCCATATCAAATAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACt > 2:2996640/1‑150 (MQ=255) aggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTc > 2:1937191/1‑150 (MQ=255) ttCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTATCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGTATTAATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCTCTACTAAAGAAATATCAATTAATAGATGTTGCATCCGGGAGTATTACTCTCCt > 1:939197/1‑150 (MQ=14) 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tCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGACTTGCGGCTCGCCCTTCgg > 2:1173059/1‑150 (MQ=255) cGGTTCGTAGCCGAGTTCTCTATCCTGCTGAGCTTCGGATGCATCGGGATAACTTATTCTACTTCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTACGAGATGGTGCATCCGGGAGGCTTACTGGCCTTGCGGCTCGCCCTTCggg < 2:3035670/150‑1 (MQ=17) cGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCggg < 1:3474761/150‑1 (MQ=255) cGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCggg < 1:3227053/150‑1 (MQ=255) cGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCggg < 1:3040588/150‑1 (MQ=255) 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2:3939523‑M1/1‑9 (MQ=255) ggaggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctc < 2:1257398‑M1/150‑143 (MQ=255) ggaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCt > 2:1351521/1‑150 (MQ=255) aggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCGTCGGGCCGTTGCTATAGCAACGTTATCATCCCGAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTcc < 2:2715216/150‑1 (MQ=255) ggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcggc < 2:3067687‑M1/150‑146 (MQ=255) gaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtac > 2:3429337‑M1/1‑4 (MQ=255) gaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGGGGATTCGAACCTCCGa > 1:1114001/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |