| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,311,831 | 0 | C | T | 8.7% | 628.9 / 35.8 | 197 | intergenic (+23/+17) | tonB/yciA | membrane spanning protein in TonB‑ExbB‑ExbD transport complex/acyl‑CoA esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (79/100); new base T (13/4); total (93/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.97e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAAT > NC_000913/1311682‑1311979 | tGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGAc > 2:1574866/1‑150 (MQ=255) gAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCgg > 1:108353/1‑150 (MQ=255) aCATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAg < 2:3299234/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |