Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,009,731 | A→G | 5.5% | intergenic (+19/‑90) | yedF → / → yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,009,731 | 0 | A | G | 5.5% | 863.3 / 26.4 | 253 | intergenic (+19/‑90) | yedF/yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (119/120); new base G (4/10); total (123/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
AAATCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAA > NC_000913/2009582‑2009880 | aactCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATACTATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGa < 1:2904603/147‑1 (MQ=255) aaaTCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGa < 1:2087908/150‑1 (MQ=255) aGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGGTCACAGCgg < 1:4203823/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |