Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,082,702 | 0 | A | C | 5.1% | 1103.1 / 35.5 | 303 | intergenic (+31/+175) | loiP/speB | Phe‑Phe periplasmic metalloprotease, OM lipoprotein; low salt‑inducible; Era‑binding heat shock protein/agmatinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (155/132); new base C (6/10); total (161/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
TTGAAAAACTGGCAAAACTGGAAGAAGGTCGCCAAAGCTCAATGTTTGACGACCATCCTGCATCCGCCGAACGCGCCCAGCATATTCGCGATCGCATGAGCGCGGATGGGATTAAGTAAAGCCTGGTGGTGTCGAACGTAGGTCAGATAAGGCGTTCACGCCGCATCTGACATGAATGGCACATTTGTTACCTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCGAACGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACATTAATGGCACGTTT > NC_000913/3082553‑3082851 | tGAAAAACTGGCAAAACTGGAAGAAGGTCGCCAAAGCTCAATGTTTGACGACCATCCTGCATCCGCCGAACGCGCCCAGCATATTCGCGATCGTATGAGCGCGGATGGGATTAAGTAAAGCCTGGTGGTGTCGAACGTAGGTCAGATAAg > 2:3497979/1‑150 (MQ=255) tGAAAAACTGGCAAAACTGGAAGAAGGTCGCCAAAGCTCAATGTTTGACGACCATCCTGCATCCGCCGAACGCGCCCAGCATATTCGCGATCGCATGAGCGCGGATGGGATTAAGTAAAGCCTGGTGGTGTCGAACGTAGGTCAGATAAg > 1:96954/1‑150 (MQ=255) gAAATACTGGCAAAACTGGAAGAAGGTCGCCAAAGCTCAATGTTTGACGACCATCGTGCATCCGCCGAACGCGCCCAGCATATTCGCGATCTCATGAGCGCGGATGGGATTAAGTAATGCCTGGTGGTGTCGAACGTAGGTCAGATAAgg > 2:2961618/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |