Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,239,609 | 0 | T | G | 14.3% | 418.5 / 48.4 | 175 | intergenic (+64/‑335) | alx/sstT | putative membrane‑bound redox modulator/sodium:serine/threonine symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (99/42); new base G (11/13); total (110/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.29e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TGGGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAT > NC_000913/3239460‑3239757 | tGGGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGACTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCtt > 1:3202318/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATAAACGCCTGGGTGAATTATCGGCAAGATAATCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCACTCTCCCtt > 1:3202324/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 1:643968/150‑1 (MQ=255) 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tctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 2:2181792/1‑150 (MQ=255) tctcccgGCCCGGGAGAGGGTGGGGGTTTGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAACCGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg < 1:979731/150‑1 (MQ=37) | TGGGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAT > NC_000913/3239460‑3239757 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |