| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,239,610 | C→G | 9.0% | intergenic (+65/‑334) | alx → / → sstT | putative membrane‑bound redox modulator/sodium:serine/threonine symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,239,610 | 0 | C | G | 9.0% | 589.7 / 43.3 | 176 | intergenic (+65/‑334) | alx/sstT | putative membrane‑bound redox modulator/sodium:serine/threonine symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (100/60); new base G (11/5); total (111/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAT > NC_000913/3239463‑3239757 | gCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 1:643968/150‑1 (MQ=255) tggtgTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAggg > 1:4113364/1‑150 (MQ=255) tggtgTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAggg > 2:1969550/1‑150 (MQ=255) ggtgTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGga < 1:1511569/150‑1 (MQ=255) ggtgTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGga < 1:3602144/150‑1 (MQ=255) gtgtTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCATCGCCTGGGTGAATTTTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TTCCCTGTCATTAACATGAGCAGGGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGgag > 2:371624/1‑150 (MQ=255) gtgtTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGgag > 2:1546605/1‑150 (MQ=255) gtgtTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGgag > 2:2261390/1‑150 (MQ=255) gtTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:1895713/150‑1 (MQ=255) tttGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAgg > 2:2113177/1‑150 (MQ=255) tttGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTGGAAGGGAGAgg < 1:4124132/150‑1 (MQ=255) cgggCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAggg < 2:3436450/148‑1 (MQ=255) tGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCACCGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAGTCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCACCCTCTCCCTGGAAGGGAGAggga < 1:3774242/150‑2 (MQ=255) tGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt > 2:121051/1‑150 (MQ=255) tGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTGGAAGGGAGAggga < 1:830792/150‑2 (MQ=255) gCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCCGGGAGAGGGTCg < 2:3444837/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGTGGGTCggg < 1:3021702/150‑1 (MQ=255) tGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:3815899/150‑1 (MQ=255) tGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa > 2:73235/1‑150 (MQ=255) ggTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGATTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg > 1:770175/1‑150 (MQ=255) aCGTTTTTTATAAACGCCTGGTTTAATTATCGTAATTATAAGCAGCGGGTTTTATTATTTTTAATCTGCATAAGCGGTT‑TACCCTGTAATTAAATTGAGCACGTTTTTCTCCCTCTCCCTTCCTGGTTGTGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt < 1:1958815/150‑1 (MQ=255) aCGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt < 2:3309684/150‑1 (MQ=255) gTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 2:2722012/1‑150 (MQ=255) gTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCGTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTCAtttt > 2:2155944/1‑150 (MQ=255) gTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAACTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 2:873051/1‑150 (MQ=255) tttATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 2:1266682/1‑150 (MQ=255) ttattaTCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTCATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGGGTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTGTTc > 2:1873218/1‑150 (MQ=255) ttattaTCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTc > 1:3196320/1‑150 (MQ=255) ttattaTCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTc > 2:2497640/1‑150 (MQ=255) tCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 2:1712909/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCgct > 2:4019331/1‑148 (MQ=255) aaCGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt > 2:2665688/1‑150 (MQ=255) gttGAATTATCGGCATGATACGCTGGGGGGTGTATATTTTTTAATCTGCCTAAG‑CGTGTTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTGCGCCCCCCCCCTTCCCGGGAGTGGGTCGGGGTGTGGTTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt < 2:3748242/148‑1 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 2:3068005/1‑150 (MQ=255) tatttATCGGCATGATAAGCAGGGGGGTGGATAATTTTTATTCTGCCTACGCCGTT‑TACCCTGACATTAACATGAGCACCGTTTACTCCCTCTCCCTTCCTGGGAGTGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt < 2:2805931/147‑1 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcc > 1:864250/1‑150 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 2:909879/1‑150 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAcc > 1:446169/1‑150 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAcc > 2:1424267/1‑150 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAcc > 1:2059250/1‑150 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAcc > 1:892367/1‑150 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTaa > 2:3102057/1‑150 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAcc > 1:15138/1‑150 (MQ=255) tggggggTGTATAATTTTTAATCTGCATAAGCGGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTCCGCCCTCGCCCTCCCTGGGTGTGGGTGGGGGTGCGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCtctc < 1:3812118/147‑1 (MQ=37) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCtctc > 1:2435688/1‑150 (MQ=255) gggggtTGTATAATTTTTAATCTGCCTACGCCGTG‑TACCCTGTCTTTAACATGCGCACGGTTTTCTCCCACTCCCTCCCCGGTTGTGGGTCGGGTTGTGGTTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcc < 2:697736/148‑1 (MQ=25) cGGGGGGGATAATTTTTAATCGGCCTAAGCCGTG‑TACCCTCTCATTAACAGGCGCACCGTGTGCGCCCGCTCCCTGCCCGGGAGAGGGTGGGGGTGTGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTccc < 2:4116353/150‑1 (MQ=25) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGTAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAc < 2:2598929/150‑1 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAGGCTGGCCGGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAc > 2:1381226/1‑150 (MQ=255) tttttttttATTGTGCCTATGCGTTG‑TACCCTTTTTTTAATTTGAGCACGGTTTTCTCCCTCCCCGTTCGTGGTTTTGGGTGGGGGTTGGGTTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACggg < 2:2868672/146‑1 (MQ=16) atatTTTTTATTCTGCCTAGGCGTTT‑TACCCTGACTTTAACTTGAGCACCGTTTTCTCCCCCTCCCTGCCCGGGTGTGGGTGGGGGTGAGGTTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACggg < 2:3002899/150‑1 (MQ=21) aTAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACggg > 1:4197632/1‑150 (MQ=255) tAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACgggg > 1:2762269/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGc > 1:2236416/1‑150 (MQ=255) ttttAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGGTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCgtg > 1:153886/1‑148 (MQ=255) ttttAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAg > 1:1178824/1‑150 (MQ=255) ttttAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAg > 1:208714/1‑150 (MQ=255) ttttAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAg > 1:2286425/1‑150 (MQ=255) ttttAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAg > 1:3252694/1‑150 (MQ=255) tttAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAgg > 2:1318700/1‑150 (MQ=255) tCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACt > 1:105532/1‑150 (MQ=255) tGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGATCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGa > 1:342935/1‑150 (MQ=255) ccTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACCGGGCGAGGGGACTGAcc > 2:1618983/1‑150 (MQ=255) tAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGa > 1:1691463/1‑150 (MQ=255) aacgcggtg‑tACCCTTAAATTAACTTGAGCACCTTTTTCTCCCCCCCCCTGCCGGGTTGTGGGTGGGGGTGTGGTAAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGa < 2:3218722/144‑1 (MQ=21) gtg‑tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCtt > 1:3906461/1‑150 (MQ=255) aCCCTTACATTAAAATGCCCCCCGTTTCCCCCCGCCCCCTTCCGGGGTGTGGGGGGGTGTGCGGTAAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCtttttt < 2:1441387/150‑1 (MQ=18) aCCCTGTCATTAACCTGAGCCCCGTGTCCTCCCGCGCCGGGCCCGGGAGCGGGTGGGGGTGCGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCtttttt < 2:977728/150‑1 (MQ=21) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCCGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCtttttt < 2:3473044/150‑1 (MQ=255) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGCCTGACCGAGTCCTGTTTTGa > 2:248358/1‑150 (MQ=255) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCACTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGa > 1:1589035/1‑150 (MQ=255) cTGTCATTAACATGAGCACCGTATTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGAt > 1:2496977/1‑150 (MQ=255) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGAtg > 1:4149982/1‑150 (MQ=255) aTTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGAtgttgt > 2:1406736/1‑150 (MQ=255) tAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGtca < 2:3166272/150‑1 (MQ=255) tAACATGAGCACCGTTTGCGCCCTCGCCCTTCCCGGTTGTGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGtca < 1:564622/150‑1 (MQ=25) aCATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACCGGGCCAGGGGACTGACCCAGTCCTTTTTTGATGTTGtcata > 1:3687516/1‑149 (MQ=255) cATGAGCACCTTTTTCCCCCCCTCCCTTCCTGGGTGTGGGTGGGGGTGTGGTTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGtcatca < 1:344171/150‑1 (MQ=25) tGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGt > 2:3361310/1‑150 (MQ=255) gCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTCATTTTTCGCACCGATGCTGGCCGGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTg > 2:3466985/1‑150 (MQ=255) cACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCACACCCTAACCCACTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTTTCATAAGTCTgg > 1:601654/1‑150 (MQ=255) cACCGTTTTCGCCCTCCCCCGTCCCGGGAGTGGGTGGGGGTGCGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTgg < 1:1319064/150‑1 (MQ=25) cctttttCCCCCTCCCCCTCCCCGGGAGAGGGTGGGGTTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGaa < 1:690177/147‑1 (MQ=25) cGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGTTGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCACAAACGGGGGGAGGGGACTGACCGAGTCGTTTTTTGTTGTTGTGATCAGTCTGGAAg > 1:2548158/1‑150 (MQ=25) cGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAg > 1:4053801/1‑150 (MQ=255) cGTTTCCCCCCGCCCCCTGCCCGGGAGTGGGTGGGGGTGGGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAg < 1:1266682/150‑1 (MQ=25) gTTTCCCCCCCCCCCCTACCTGGGTGTGGGTGGGGGTGTGGTAAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGc < 1:688046/150‑1 (MQ=25) tctccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCACACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCa < 2:1049425/150‑1 (MQ=255) tccctctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGCCGGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACg > 1:2963998/1‑150 (MQ=255) tccctctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTGGGCATCAGTCTGGAAGCCGCACg > 2:1095979/1‑150 (MQ=255) cctctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCCCCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTGTTGATGTTGTCCTCAGTCTGGAAGCCGCACGtt > 2:2087345/1‑150 (MQ=25) cctctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGtt > 2:2087338/1‑150 (MQ=255) cctctccctGGAAGGGAGAGGGTAGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCGGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGtg > 1:3378907/1‑149 (MQ=37) ctctccctCCGGGGGTGTGGGGGGGGGTGTGGTTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTg < 1:2001549/150‑1 (MQ=37) tctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 2:2027765/1‑150 (MQ=255) tctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 2:541711/1‑150 (MQ=255) tctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 2:1628184/1‑150 (MQ=255) tctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 2:1628266/1‑150 (MQ=255) ctccctTCCTGGGTGTGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGc < 1:1726977/150‑1 (MQ=255) tccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCt > 2:2382900/1‑150 (MQ=255) | GCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAT > NC_000913/3239463‑3239757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |