| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCA > NC_000913/780796‑781093 | cccgatactgcgctggatactacaaactacttccaccgaacccaccgtcattagtggtgggtcgtgcaggatgactcgcttcgctcgccctacgggccgttgctgacgcaacgttatcctacacgcTTAACATCGAAGACAGATGTTAAg > 1:1440168‑M1/127‑150 (MQ=255) ttACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCCCCGGGTCGAGAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTGGACTTTTAATCAATGGGTCGCAGGTTCGAATACTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCTAAGACAGATCTTAAGc > 1:255289/1‑150 (MQ=11) tacttggaggGGGTCGGGGGTTCGCTCCCGTCATCACCCTCCACATGGTCGTTAGCTCAGTTTGTATTGCAGTTGTCTTTTAATCTATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCg < 1:1036576/145‑1 (MQ=14) tACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCCCCACCACCGGGTCGTTAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGCCCCCCCAGTTTTAACATCGCAGACAGATGTTAAggg > 2:1601209/1‑148 (MQ=14) cgatactgcgctggatactacaaactacttccaccgaacccaccgtcattagtggtgggtcgtgcaggatgactcgcttcgctcgccctacgggccgttgctgacgcaacgttatcctacacgcTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCg > 1:10973‑M1/125‑150 (MQ=255) cgatactgcgatggatactacaaactacatccaccgaacccaccgtcattagtggtgggtcgtgcaggatgactcgcttcgctcgccctacgggccgttgctgacgcaacgttatcctacacgcTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCg > 2:1746735‑M1/125‑150 (MQ=255) atactgcgctggatactacaaactacttccaccgaacccaccgtcattagtggtgggtcgtgcaggatgactcgcttcgctcgccctacgggccgttgctgacgcaacgttatcctacacgcTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCgtg > 1:933899‑M1/123‑150 (MQ=255) gaggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCCCCTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCTATAGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAgg < 2:1383329/150‑1 (MQ=14) gaggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCATTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAgg < 1:517906/150‑1 (MQ=255) gggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTAAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAATACAGATGTTTAGCGTGTAGGATaa > 1:968085/1‑150 (MQ=255) cggcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGtt > 2:1450918/1‑150 (MQ=255) gcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAGTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGc < 1:499284/150‑1 (MQ=255) gcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGc > 2:1217387/1‑150 (MQ=255) 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2:119961/1‑150 (MQ=255) cgcttaacatctgtcttcgatgttaaGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCg > 1:10973‑M2/27‑150 (MQ=255) cttaacatctgtcttcgatgttaaGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCggg > 1:1440168‑M2/25‑150 (MQ=255) TAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTg > 2:379693‑M1/1‑150 (MQ=255) TAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTg > 2:1558524‑M1/1‑150 (MQ=255) aaCATCGACGACACAGGCTAAGGGGGTAGGATCTCCTGGCGTCAGCAACGGCCCTTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACACACCACTAATGACGTTGTGTTCGGTGGTAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGa < 2:1735657/150‑1 (MQ=25) AACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGa > 1:919333‑M1/1‑150 (MQ=255) gAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCt > 2:647435/1‑150 (MQ=255) cAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCCACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGGTCGGTGGAAGTAGGTTGTTGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCGCAGcg > 1:258203/1‑149 (MQ=25) atgttaaGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTggg < 2:1871611‑M2/143‑1 (MQ=255) ttaaGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga > 1:773631‑M2/5‑150 (MQ=255) aGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCa < 2:1509963‑M2/149‑1 (MQ=255) | CTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCA > NC_000913/780796‑781093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |