| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 781369 = | 51 (0.450) | 24 (0.220) +G |
12/276 | NT | 38.6% | noncoding (1/76 nt) | lysZ | tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | = 2521129 | 26 (0.230) | intergenic (+3/‑44) | valX/valY | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
TCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAG > NC_000913/2520994‑2521276 | tcatcaCCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTACTCTCCAgagaaa > 1:1600800/1‑145 (MQ=255)atctcccccAACAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTTTATCAAGAACTTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgttagctc > 1:1258223‑M2/4‑136 (MQ=255) acccaccAACTAGTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCt < 1:1727873/150‑1 (MQ=255) acccaccAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCTCCAGCTAAATTTCt > 1:612806/1‑150 (MQ=255) acccaccAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCt > 2:1450340/1‑150 (MQ=255) cccaccAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTGCTCGCCAGAGAAAtttagt > 1:813837/1‑147 (MQ=255) caACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCCCCCCGTTCTCGCCAGCTAAATGAGTTGTaaa > 1:1382429/1‑150 (MQ=21) caACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgttagctcagttggtagag < 1:648061‑M2/150‑26 (MQ=255) aaCTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCGAAATTTCTTGTtaaa > 1:604404/1‑150 (MQ=255) 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gggTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgttagcgcagttggtagcgcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcccgac < 1:1488139‑M2/150‑72 (MQ=255) ggTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTGTCGCCAGCTAAAATTCTTGTAAAAATGTGAATTTACGAAGTGGGGTATTAGCTGAGATGGGAGATCAccc > 2:1398222/1‑149 (MQ=18) gATTAGCGCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcggggcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccac > 1:995444‑M2/1‑75 (MQ=255) gCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCACCCCCCACTTcgggtcgttagctcagttgggagcgcagtggcctgttattcaattgggcgcaggttcgagtcctgcgcgacccacccatg < 1:1360971‑M2/150‑81 (MQ=255) cTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaattt < 2:108615‑M2/150‑82 (MQ=255) tCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAag > 2:602911/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑gggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatttaaaa < 1:1888786‑M2/150‑85 (MQ=255) tGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgtt > 2:779963‑M2/1‑63 (MQ=255) tGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgtt < 1:779963‑M2/72‑10 (MQ=255) aCCTCCCTTTAAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCTATCATTTACTCACCCACC‑CTTcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatttaaaggtggttactggt > 2:187430‑M2/1‑53 (MQ=255) cctccctcAGAATGATGGGGGCGGCGGTTCGATCACGTCATCACCCACCCCTgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatttaaaggtggttactggta > 2:1212689‑M2/1‑53 (MQ=255) 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gATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGCGCACCTCCCTTACAATGAGGGGGTCGGCGGTGCGCTCCCGTCATCAACCACCACATCcggg > 1:1497455/1‑149 (MQ=25) gATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGt > 2:633770/1‑150 (MQ=255) gATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTACGCTGGGAGAGCACCTCCCGTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCCCATCGGGt > 1:1625513/1‑150 (MQ=25) gATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAACTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGt > 2:588257/1‑150 (MQ=255) cccGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTACGCTGGGAGAGCACCTCCCTTAAAAGGAGGTGGTCGGCGGTTCGATCCAGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGt > 2:1031719/1‑150 (MQ=255) 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cTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGTTGATTAGATCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGATCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCCTTAGCTCAATTGGTtgag > 2:1183326/1‑150 (MQ=21) | TCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAG > NC_000913/2520994‑2521276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |