New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1396537 = | NA (NA) | 14 (0.130) | 7/266 | NT | 10.1% | noncoding (494/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1428270 | 130 (1.160) | noncoding (525/1196 nt) | IS5 | repeat region |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG > NC_000913/1428120‑1428419 | ggTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGG‑CCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT > 2:1031050‑M2/1‑150 (MQ=255) gTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGGGTTGCTGCTCGTTGTTCTTGGT < 2:1792398‑M2/150‑1 (MQ=255) tCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTc > 1:218615‑M2/1‑149 (MQ=255) tCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTc < 1:627629‑M2/150‑2 (MQ=255) tCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTa < 1:935800/150‑1 (MQ=11) tCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCGTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTc > 1:269673‑M2/1‑149 (MQ=255) cATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcg < 2:860617‑M2/150‑3 (MQ=255) aTGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcga > 2:460599‑M2/1‑147 (MQ=255) tGCTCGTTGACCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTagag > 1:1070547/1‑150 (MQ=17) tCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGTCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTg < 2:1169543/150‑1 (MQ=17) gTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTggg < 1:972379/150‑1 (MQ=32) ggCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGc > 2:1373450/1‑150 (MQ=32) gCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCCCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCCCGGAGTGCCTTTCTGGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGGTGCTGCTCGTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGcc > 1:1153763/1‑150 (MQ=11) ggtgACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACAGATTGCCTATCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAatgat > 1:1418140/1‑150 (MQ=17) gtgGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTTATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTagatctggatgccaccatcattgaggcacccag > 2:923262‑M2/1‑117 (MQ=255) tgGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCATTGTGGGCCTTCATGCCATAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGATGCTGCTCTTTGTTCTTGGTagagctggatgccaccatcattgaggcacccagc > 1:87970‑M2/1‑116 (MQ=255) ggggCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgacca > 1:1617298‑M2/1‑115 (MQ=255) gggTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTATCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgacca > 1:59528‑M2/1‑115 (MQ=255) ggTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTagagctggatgccaccatcattgaggcacccagctc > 1:1906099‑M2/1‑114 (MQ=255) gTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaag > 2:832504‑M2/1‑113 (MQ=255) gTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCaaa > 1:877052/1‑150 (MQ=35) gTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTGTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCTCCaaa > 1:1253506/1‑150 (MQ=25) gcaGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaaga > 1:1821510‑M2/2‑112 (MQ=255) aGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaac > 2:1312478‑M2/1‑110 (MQ=255) aGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaac > 1:1760476‑M2/1‑110 (MQ=255) aGGCCACTCTAGGCATCGACACGAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaac > 1:798302‑M2/1‑110 (MQ=255) gCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCATTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGcc < 1:802806/150‑1 (MQ=37) tcatGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTggg > 1:1181128/4‑150 (MQ=38) gctTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTggg < 2:1569522/149‑1 (MQ=38) ctTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCAAGCCAAAGTGCCACTGTTTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGGTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTCGGTGCCTCACTGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGt > 2:284438/1‑150 (MQ=14) tcggCCTCGACACCATTGTGGGCCTTCCTGCCAAAGGGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCGGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGtc < 1:985827/148‑1 (MQ=14) ggCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGtcat > 2:553497/1‑150 (MQ=39) gCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGtcatc < 2:1490879/150‑1 (MQ=39) gCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGtcatc < 1:6704/150‑1 (MQ=39) gACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGTATCCACCAAAGTGCGGTGGGTCATCATGAc > 2:66865/1‑150 (MQ=255) acacCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACg < 1:716260/150‑1 (MQ=39) cacCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGc > 2:1355703/1‑150 (MQ=39) cacCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGc > 2:1445048/1‑150 (MQ=39) ccAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCGTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCGTTGGGTCCTCATGACGCCt > 1:552802/1‑150 (MQ=255) ccAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATTATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCt > 1:1159193/1‑150 (MQ=255) ggCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGgc < 1:1639242/150‑1 (MQ=39) gCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGgcc < 2:241373/150‑1 (MQ=39) cTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGGCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGgccag < 2:534840/150‑1 (MQ=255) ccAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGGGCCTCAATGATGGAGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTGCGGCCAGCCAGCGa > 1:1877423/1‑150 (MQ=255) ccACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGTTAGAGCTGGGTTCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGt > 1:318021/1‑150 (MQ=255) cACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTc < 1:1390374/150‑1 (MQ=39) aCTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCt < 1:825886/150‑1 (MQ=39) aCTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGGGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCt < 1:1490759/150‑1 (MQ=255) tGATTGCCTTTCTTTGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTTCGGGTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATTGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATTGTCTTg < 2:1175004/150‑1 (MQ=14) tGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGGCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTg < 2:1764181/150‑1 (MQ=255) gATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGa < 1:133786/150‑1 (MQ=21) ccTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAAt > 1:1515371/1‑150 (MQ=39) ccTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTCGGTAGAGCTGGGTGCCTCTATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAAt < 1:396465/150‑1 (MQ=255) cTTTCTTGGGCTGATGCAGCTCCGGATCGCGGTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAAtt < 1:342323/150‑1 (MQ=255) cTTTCTTCGACTGATGCATCTCCTGATCGCGTTGCTGCTCTTTGCTCTTGTTAGAGCTGGGTGCCTCATTGATGTTGGCATCCACCATAGTGCCTTGGGTAATCATGACGACTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAAtt < 1:1128567/150‑1 (MQ=14) cTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACg < 2:1070547/150‑1 (MQ=255) ttGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACgg > 2:1847929/1‑150 (MQ=255) tGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGGGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACggg < 1:1710065/150‑1 (MQ=255) gTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCCGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGcc > 1:897185/1‑150 (MQ=255) gTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGcc > 2:581311/1‑150 (MQ=255) gTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGcc > 2:1520035/1‑150 (MQ=255) gTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGcc > 1:1541354/1‑150 (MQ=255) tCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGATGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGACTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGAAGGTCTTGAACAATTGACGGGGCa > 1:288913/1‑150 (MQ=255) tctcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCGCAATGATGGTGGCATCCACCTAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCTATTGATGGTCTTGAAGAATTGACGGGCCTGTTGAtgct < 1:1015485/150‑1 (MQ=14) ctcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGCCGGGCCAGTTGAtgctg > 2:881416/1‑150 (MQ=255) ctcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGAtgctg > 2:7708/1‑150 (MQ=255) aTCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAg < 2:1140459/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGACCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGt < 2:413265/150‑1 (MQ=255) tgctgcTCTTTGTTCTGGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTgg < 2:1003953/150‑1 (MQ=255) gctgctCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGc > 2:817937/1‑150 (MQ=255) cggcgctTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCg < 2:292958/145‑1 (MQ=255) tgctCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCgg > 2:678686/1‑150 (MQ=255) gctCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGa > 2:1879416/1‑150 (MQ=255) gctCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGa > 2:1806398/1‑150 (MQ=255) gctCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGa > 2:1614709/1‑150 (MQ=255) cTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagttgcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgac > 2:1223728‑M2/1‑6 (MQ=255) cTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgac < 1:1766490‑M2/150‑145 (MQ=255) cTTGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcacattggcatgaaggcccacaatggtgtcgctgccaacagtggcctgac < 1:340325‑M2/150‑145 (MQ=255) ttGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaacgagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacc > 1:1227515‑M2/1‑5 (MQ=255) ttGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacc > 2:1681626‑M2/1‑5 (MQ=255) ttGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacc > 2:1252736‑M2/1‑5 (MQ=255) ttGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCCGCCAGCGAGTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCATGTGGCGGAAATTCatgatg > 2:1417360/1‑150 (MQ=255) ttGGGcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggccggacc > 2:1103011‑M2/1‑5 (MQ=255) tGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagcgcagcaacgcgatccggagatgcagcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtagatgccaagagtggcctgaccc > 2:473199‑M2/1‑4 (MQ=255) tGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgcccc < 1:59884‑M2/150‑147 (MQ=255) tGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgaccc > 1:1266542‑M2/1‑4 (MQ=255) tGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgaccc > 1:215551‑M2/1‑4 (MQ=255) tGGTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgaccc > 1:465397‑M2/1‑4 (MQ=255) tGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGAGTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTAATGAtgg > 1:932209/1‑150 (MQ=255) ggTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcacttcggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgaccca < 2:878943‑M2/150‑148 (MQ=255) gTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgcccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagctgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcacgttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacccac < 1:1121125‑M2/150‑149 (MQ=255) gTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaccgcgatccggagatgcatcagcccaagaacggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacccac < 1:43252‑M2/150‑149 (MQ=255) gTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacccac < 1:1601620‑M2/150‑149 (MQ=255) gTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgcaaagagtggcctgacccaa < 1:227153‑M2/150‑149 (MQ=255) gTcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgacaatgaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaaacagtcgcacttatgcatgaaggcccacattgttgtcgatgacaagagtggcctgacccac < 2:928166‑M2/150‑149 (MQ=255) gTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGAtggtg > 1:1091817/1‑150 (MQ=255) tcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccgtagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacccaca > 2:1745316‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgccccaca < 1:1581932‑M2/150‑150 (MQ=255) tcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagagcagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacccaca > 2:1537281‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgatgccaccatcattgaggcacccagctcgaccaagaacaaagaccagcaacgcgatccggagatgcatcagaccaagaaaggcaatcagtggcactttggcatgaaggcccacattggtgtcgatgccaagagtggcctgacccaca > 1:1002579‑M2/1‑1 (MQ=255) | GGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG > NC_000913/1428120‑1428419 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |